Post-doctorant en génomique évolutive (H/F): Construction d'un modèle phylogénétique pour les t[...]

CNRS; Gif-sur-Yvette; Sur place; EUR 40 000 - 60 000; Plein temps

Résumé du poste

Un institut de recherche en biologie cherche un post-doctorant en génomique évolutive pour développer des modèles phylogénétiques sur les transferts horizontaux d'éléments transposables. Le candidat idéal possède un doctorat en biologie évolutive et des compétences en statistiques, programmation et bio-informatique. Le poste est basé à Gif-sur-Yvette et intégré dans un projet collaboratif sur 4 ans.

Qualifications

• Titulaire d'un doctorat en biologie évolutive théorique.
• Compétences en statistiques, programmation, bio-informatique et modélisation.
• Expérience en recherche collaborative appréciée.

Responsabilités

• Implémenter un modèle théorique de distribution des éléments transposables.
• Explorer et appliquer le modèle à des données réelles.
• Participer aux réunions hebdomadaires et communiquer les résultats.

Connaissances

Biologie évolutive théorique

Statistiques

Programmation

Bio-informatique

Modélisation phylogénétique

Formation

Doctorat

Description du poste

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Post-doctorant en génomique évolutive (H/F): Construction d'un modèle phylogénétique pour les transferts horizontaux des éléments transposables

Cette offre est disponible dans les langues suivantes. Date Limite Candidature : mercredi 15 octobre 2025 23:59:00 heure de Paris. Assurez-vous que votre profil candidat soit correctement renseigné avant de postuler.

Informations générales

Intitulé de l'offre : Post-doctorant en génomique évolutive (H/F): Construction d'un modèle phylogénétique pour les transferts horizontaux des éléments transposables

Référence : UMR9191-ARNLER-006

Nombre de Postes : 1

Lieu de travail : GIF SUR YVETTE

Date de publication : mercredi 24 septembre 2025

Type de contrat : Chercheur en contrat CDD

Durée du contrat : 24 mois

Date d'embauche prévue : 1 janvier 2026

Quotité de travail : Complet

Rémunération : entre 3081,33€ et 3519,85€ Brut mensuel

Niveau d'études souhaité : Doctorat

Expérience souhaitée : Indifférent

Section CN : 29 - Biodiversité, évolution et adaptations biologiques : des macromolécules aux communautés

Missions

Les éléments transposables (ET) sont des séquences d’ADN répétitées capables de promouvoir leur propre mobilité. Ils sont largement répandus dans l’arbre du vivant et représentent souvent une fraction importante des génomes eucaryotes. Au-delà de leur capacité à envahir les génomes, les éléments transposables sont fréquemment impliqués dans des transferts horizontaux, leur permettant de coloniser de nouveaux hôtes. Cependant, comprendre et prédire comment les transferts horizontaux façonnent la distribution des ET entre les espèces est loin d’être trivial. En particulier, les estimations des taux de transfert basées sur les cas documentés sont à la fois biaisées et approximatives.

Ce projet vise à développer des modèles phylogénétiques explicites de l’évolution des ET intégrant les transferts horizontaux, et à utiliser ces modèles pour obtenir des estimations statistiques des principales dynamiques évolutives des familles d'ET à travers les espèces (par exemple, les taux de transfert horizontal et d’extinction). Le projet postdoctoral portera sur l’exploration de l’impact des transferts horizontaux sur la distribution de la présence/absence d\'ET chez des espèces apparentées, à l’aide d’approches statistiques et/ou computationnelles.

Activités

La personne recrutée sera en charge de :

• Implémenter un modèle théorique de la distribution des éléments transposables dans une phylogénie d'espèces en présence de transferts horizontaux
• Explorer ce modèle pour en déduire les patrons de distribution attendus sous différentes hypothèses de variation des taux de transferts horizontaux
• Implementer une version statistique de ce modèle destinée à estimer les taux de transfers à partir de données de génomique
• Appliquer le modèle statistique à des données réelles
• Assurer la veille scientifique (synthèse bibliographique) sur les thèmes du projet
• Participer à la vie scientifique de l'équipe, assister aux réunions hebdomadaires et y présenter régulièrement les avancées des travaux
• Diffuser et communiquer les résultats obtenus en participant à des conférences internationales et en les publiant dans des revues internationales à comité de lecture

Compétences

La personne recrutée sera titulaire d’un doctorat en biologie évolutive théorique; ses compétences en statistiques, en programmation, en bio-informatique et en modélisation phylogénétique seront appréciées.

Contexte de travail

Le poste s’inscrit dans le cadre d’un projet collaboratif de 4 ans financé par l’ANR. Le consortium de recherche réunit deux laboratoires (EGCE à Gif-sur-Yvette et LBBE à Lyon) et implique 7 chercheurs ainsi que 5 postdoctorants et doctorants répartis sur différents volets du projet. Le poste de postdoctorat sera basé au laboratoire EGCE, qui fait partie de l’Institut Diversité, Écologie, et Évolution du Vivant (IDEEV). L’institut offre un environnement scientifique stimulant et dynamique, et est situé sur le nouveau campus de recherche de Paris Saclay, à 35 km au sud de Paris.