PhD in DNA Data Storage: Robust Data Retrieval & Coding

Inria; Rennes; Sur place; EUR 21 000 - 26 000; Plein temps

Avantages offerts par ce poste

Remboursement transport

Congés annuels + RTT

Télétravail après 6 mois

Equipement professionnel

Événements sociaux et sportifs

Résumé du poste

Inria Rennes propose une thèse doctorante sur RobDNA: récupération robuste de données dans le stockage ADN. Le sujet combine compression et correction d'erreurs pour des lectures nanopore, en lien avec la transformation en alphabet quaternaire et le décodage non-binaire.

Le candidat développera des algorithmes et évaluera des performances sur des ensembles de données réels et simulés, en participant à la diffusion scientifique et à l'intégration dans l'écosystème Inria.

Qualifications

• Solide background en traitement d'image et traitement du signal.
• Connaissances en optimisation et programmation.
• Notions de codage source et théorie de l'information appréciées.

Responsabilités

• Développer des algorithmes de compression et de correction d'erreurs robustes au bruit de lecture nanopore.
• Intégrer les techniques de transcoding et évaluer les performances sur des jeux de données simulés et réels.
• Participer à la rédaction de publications et à la supervision des expérimentations.

Connaissances

Traitement d'image

Traitement du signal

Optimisation

Programmation

Description du poste

Inria Rennes propose une thèse doctorante sur RobDNA: récupération robuste de données dans le stockage ADN. Le sujet combine compression et correction d'erreurs pour des lectures nanopore, en lien avec la transformation en alphabet quaternaire et le décodage non-binaire.

Le candidat développera des algorithmes et évaluera des performances sur des ensembles de données réels et simulés, en participant à la diffusion scientifique et à l'intégration dans l'écosystème Inria.