Masters Student

Université Claude Bernard Lyon 1; Villeurbanne; Sur place; EUR 7 800 - 10 000; Temps partiel

Résumé du poste

Université Claude Bernard Lyon 1 propose un stage de Master 2 de 6 mois au CP2M, dans le cadre du projet LIONS financé par BPIfrance et la Région Auvergne-Rhône-Alpes. Le stage vise à développer des modèles de dynamique moléculaire coarse-grained de lipides et d’ARN, pour étudier leur assemblage et contribuer à l’analyse des courbes SAXS.

Les missions incluent le paramétrage de lipides et ARN, mesures d’épaisseur membranaire et étude des interactions via umbrella sampling.

Qualifications

• Linux, Bash et Python requises.
• Connaissances en dynamique moléculaire et expérience avec GROMACS.
• Solides connaissances en physico-chimie de la matière molle et systèmes biomoléculaires.
• Esprit d’analyse, communication et curiosité pour la recherche interdisciplinaire.

Responsabilités

• Paramétrer des lipides ionisables spécifiques et l’ARN.
• Mesurer l’épaisseur des membranes lipidiques et les profils de densité de diffusion.
• Étudier les interactions membrane lipidique–ARN par umbrella sampling.
• Évaluer la rigidité membranaire via des simulations et analyses des fluctuations.

Connaissances

Linux

Bash

Python

Molecular dynamics

Formation

Master 2 en chimie/biophysique

Outils

GROMACS

Description du poste

Nous proposons un stage de Master 2 de 6 mois au sein des laboratoires Catalysis, Polymerization, Processes and Materials (CP2M), dans le cadre du projet LIONS, financé par BPIfrance et la Région Auvergne-Rhône-Alpes.

L’objectif du stage est de développer des modèles de dynamique moléculaire (coarse-grained) de lipides et d’ARN, afin d’étudier leur assemblage et de contribuer à l’analyse des courbes SAXS.

Missions principales

• Paramétrer des lipides ionisables spécifiques et l’ARN
• Mesurer l’épaisseur des membranes lipidiques et les profils de densité de diffusion
• Étudier les interactions membrane lipidique–ARN par umbrella sampling
• Évaluer la rigidité membranaire à l’aide de simulations de lipid pulling et d’analyses des fluctuations dans l’espace réel

Profil recherché

• Linux, Bash et Python
• Connaissances en dynamique moléculaire et expérience avec GROMACS
• Solides connaissances en physico-chimie de la matière molle et systèmes biomoléculaires
• Esprit d’analyse, communication et curiosité pour la recherche interdisciplinaire

Début : flexible, dès que possible