Institut de Génétique Humaine

Cnrs Inc; Montpellier; Hybrid; EUR 32,000 - 39,000; Full time

Benefits offered by this job

Prise en charge transport 75%

Forfait mobilité durable 300€

Job summary

Le CNRS, Institut de Génétique Humaine à Montpellier, propose un poste de 13 mois axé sur l’analyse des répertoires immunogénétiques et le développement d’outils de visualisation des résultats IMGT/HighV-QUEST. Vous travaillerez au sein du Laboratoire de l’équipe IMGT et collaborerez avec des partenaires nationaux et internationaux.

Le poste implique des analyses quantitatives, le développement en Python/R et la présentation des résultats lors de congrès.

Qualifications

• Analyse et traitement des données issues du séquençage haut débit.
• Connaissances en immunogénétique et immunoinformatique.
• Maîtrise de l’anglais (C1).
• Gestion de projets et travail en équipe.

Responsibilities

• Extraction des profils d’expression et allèles des immunoglobulines et récepteurs T.
• Développement d’outils de visualisation des résultats IMGT/HighV-QUEST.
• Développement de l’outil StatMutations.
• Interlocuteur principal des collaborations avec ImmGenT et valorisation des analyses.
• Participation à IMGT lors de congrès et workshops.

Skills

Séquençage haute débit

Bioinformatique appliquée

Immunogénétique

Anglais C1

Tools

Python

R

Redmine

Job description

L'offre en un coup d'oeil

L'unité

Institut de Génétique Humaine

Durée du contrat

13 mois

Rémuneration

A partir de 3175€ brut mensuel ajustable en fonction de l'expérience professionnelle sur des postes de niveau équivalent

Description du Poste

Les Missions

Analyses de la diversité du répertoire des récepteurs d’antigènes des cellules B et T, développements d’outils de visualisation interactifs des résultats d’IMGT/HighV-QUEST.

L'Activité

Analyse des répertoires exprimés des immunoglobulines et des récepteurs T avec IMGT/HighV-QUEST

• Extraction des informations pertinentes : profils d’expression des gènes et allèles, analyse détaillée des jonctions, caractérisation des mutations somatiques
• Développement d’outils de visualisation des résultats d’IMGT/HighV-QUEST destinés à être publiés sur le site Web d’IMGT
• Développement de l’outil StatMutations
• Principal interlocuteur de la collaboration avec ImmGenT, responsable des analyses, des échanges et des travaux de valorisation
• Implication dans les développements bioinformatiques IMGT développés dans le cadre la contribution d’IMGT dans l’IHU Immun4cure
• Présentation d’IMGT dans les congrès et les workshops

Votre Profil

Compétences

• Savoirs / connaissances
  • Recueil, analyse et traitement des données issues du séquençage haut-débit, (connaissance approfondie)
  • Bio- Informatique appliquée (connaissance approfondie)
  • Connaissances approfondies en immunogénétique et immunoinformatique
  • Langue anglaise : C1
• Savoir-faire
  • Expertiser : rechercher, comparer, identifier, décrire les répertoires exprimés des immunoglobulines et des récepteurs T, mettre à disposition de ces données, des analyses et interprétations des résultats
  • Développement en langage Python et R
  • Savoir gérer ses projets sous Redmine
  • Collaborer avec le personnel de l’équipe (multidisciplinarité) et avec les partenaires nationaux et internationaux d’IMGT
  • Communiquer : valoriser, donner une visibilité, rédiger
• Savoirs-être
  • Travailler en équipe
  • Etre à l’interface de plusieurs projets
  • Savoir être à l’écoute des utilisateurs et collaborateurs nationaux et internationaux d’IMGT
  • Savoir représenter IMGT dans les congrès et workshop

Votre Environnement de Travail

Système d’information IMGT®, the international ImMunoGenetics information system certifié ISO 9001:2015 and NFX 50-900:2016, qui est la référence en immunogénétique et immunoinformatique. Laboratoire de la Professeure Sofia Kossida (20 personnes) qui fait partie de l’Institut de Génétique Humain, IGH, UMR 9002 CNRS - Université de Montpellier. Développements d’outils en immunogénétique et immunoinformatique, et de partenariats/collaborations nationales et internationales.
L' IGH est situé sur le campus Arnaud de Villeneuve, partie prenante du programme Objectif Employeur Pro-Vélo.

Contraintes et risques

Travail exclusivement sur ordinateur.

Rémunération et avantages

Rémunération

A partir de 3175€ brut mensuel ajustable en fonction de l'expérience professionnelle sur des postes de niveau équivalent

Congés et RTT annuels

44 jours

Pratique et Indemnisation du TT

Pratique et indemnisation du TT

Prise en charge à 75% du coût et forfait mobilité durable jusqu’à 300€

À propos du CNRS

Le CNRS est un acteur majeur de la recherche fondamentale à une échelle mondiale. Le CNRS est le seul organisme français actif dans tous les domaines scientifiques. Sa position unique de multi-spécialiste lui permet d’associer les différentes disciplines pour affronter les défis les plus importants du monde contemporain, en lien avec les acteurs du changement.

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