Ingénieur.e recherche Analyse de donnees Bio-informatique (H/F)

France Travail; Toulouse; Sur place; EUR 60 000 - 80 000; Plein temps

Résumé du poste

Une organisation de recherche en France recherche un(e) ingénieur(e) en bio-informatique pour analyser des données et concevoir des méthodes d'analyse. Le poste exige au moins un Bac + 5 et une expérience d'un an. Un salaire brut de 2 898,86 € par mois est proposé, avec des avantages tels que 32 jours de congés et une restauration collective subventionnée.

Prestations

32 jours de Congés Annuels

Restauration collective subventionnée

Comité d'action et entraide sociale

Transports publics remboursés à 75 %

Qualifications

• Connaissances solides de la biologie et des techniques de biologie moléculaire.
• Connaissances solides en bioinformatique.
• Maîtrise des logiciels d'analyse de données NGS.
• Maîtrise de l'anglais technique à minima.
• Expérience d'un an en bioinformatique requise.

Responsabilités

• Analyser les données issues des technologies de séquençage NGS.
• Concevoir et implémenter de nouveaux pipelines et méthodes.
• Conseiller les utilisateurs sur les outils disponibles.
• Communiquer les résultats dans des rapports scientifiques.
• Gérer l'activité administrative du plateau de bioinformatique.

Connaissances

Analyse de données expérimentales

Analyse des résultats d'exploitation bio-informatique

Collecte et analyse des données et informations

Langages de programmation informatique

Relayer de l'information

Formation

Bac + 5 ou équivalent en Bio-informatique

Outils

R

Python

Perl

Cellranger

DESeq2

Seurat

minfi

Description du poste

Offre n° 199LWZB – Ingénieur.e recherche Analyse de donnees Bio-informatique (H/F)

MISSION PRINCIPALE : L'ingénieur.e de recherche sera en charge de l'activité du plateau de Bio-informatique. La personne recrutée aura pour mission principale d'analyser les données issues des technologies de séquençage NGS (RNAseq cellules uniques ou bulk), du démultiplexage aux analyses et visualisation des résultats. La prise en charge et l'analyse d'autres types de données (microarray, methylome, séquençage Long Read, technologie Olink.) sont demandées plus ponctuellement. Elle pourra accompagner les utilisateurs dans l'utilisation des logiciels.

Activités principales

• Réaliser et/ou encadrer la réalisation des analyses bioinformatiques du séquençage de nouvelle génération (NGS) principalement pour caractériser les profils génomiques et d'expression génique des cellules.
• Concevoir et implémenter de nouveaux pipelines et/ou méthodes pour l'acquisition et le traitement des données (RNA-seq, DNA-seq, Single-Cell).
• Conseiller les utilisateurs sur les possibilités et limites des outils disponibles.
• Communiquer les résultats dans des rapports scientifiques, des séminaires et participer à la rédaction des articles scientifiques.
• Participer à des réseaux professionnels d'échange de compétences.
• Appliquer et faire appliquer les bonnes pratiques en matière de développement logiciel, d'usage des ressources informatiques et de gestion de la donnée.
• Gérer l'activité administrative et financière du plateau de bioinformatique dans un contexte de certification ISO 9001 et NFX 50-900.

Connaissances

• Connaissances solides de la biologie et des techniques de biologie moléculaire, génomique, transcriptomique.
• Connaissances solides en bioinformatique.
• Connaissances approfondies du Logiciel R et des langages de programmation communément utilisés en bioinformatique (Python, Perl, etc.).
• Maîtrise des logiciels et méthodes statistiques couramment utilisés pour l'analyse des données NGS (Cellranger, DESeq2, Seurat, minfi, analyse d'enrichissement).
• Connaissance des principales bases de données biomédicales utilisées en oncologie (NCBI, TCGA, EBI, KEGG, BROAD, etc.).
• Maîtrise de l'anglais technique à minima.
• Maîtrise de l'environnement de travail Linux et sur un cluster de calcul distant.

Expérience dans le domaine requis

Bac + 5 minimum. Expérience de 1 an en bio-informatique requise.

Avantages

• 32 jours de Congés Annuels et 13 jours de RTTR.
• Restauration collective subventionnée sur place.
• Comité d'action et entraide sociale (prestations sociales, culturelles, sportives).
• Transports publics remboursés à 75 %.

Détails du poste

• Type de contrat : CDD – 12 mois.
• Durée du travail : 38h30/semaine.
• Temps plein, travail en journée.
• Rémunération brute mensuelle : 2 898,86 €.

Profil souhaité

• Expérience : 1 an – Bio-informatique.
• Bac+5 ou équivalent Bio-informatique.

Compétences

• Analyse de données expérimentales.
• Analyse des résultats d'exploitation bio-informatiques.
• Collecte et analyse des données et informations.
• Langages de programmation informatique.
• Relayer de l'information.

Informations complémentaires

• Secteur d'activité : Recherche-développement en sciences physiques et naturelles.

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