Ingénieur.e biologiste en laboratoire

Nantes Université; Nantes; Sur place; EUR 30 000 - 40 000; Plein temps

Résumé du poste

Une université de recherche innovante à Nantes cherche un(e) candidat(e) pour caractériser le rôle des histones H2A dans le contexte de l'augmentation de la température marine. Le poste implique l'utilisation de techniques avancées de biologie cellulaire et moléculaire, ainsi que la gestion des données génomiques. Diplôme Bac+5 requis et une expérience en biologie est appréciée.

Qualifications

• Diplôme Bac+5 en biologie ou domaine connexe requis.
• Expérience en biologie et bio-informatique souhaitable.

Responsabilités

• Conduire des techniques de biologie cellulaire et moléculaire en conditions stériles.
• Prélever et conditionner des échantillons pour l'expérimentation.
• Gérer et traiter les données de séquençage.
• Consigner et présenter les résultats des travaux.
• Assurer la gestion des stocks des ressources biologiques.

Connaissances

Biologie cellulaire

Biologie moléculaire

Bio-informatique

Formation

Bac+5 en biologie

Outils

CRISPR-Cas9

ChIP-Seq

RNA-Seq

Description du poste

À propos de nous

Nantes Université est un établissement public d’enseignement supérieur et de recherche qui propose un modèle d’université inédit en France unissant une université, un hôpital universitaire (CHU de Nantes), un institut de recherche technologique (IRT Jules Verne), un organisme national de recherche (Inserm) ainsi que Centrale Nantes, l’école des Beaux-Arts Nantes Saint-Nazaire et l’École Nationale Supérieure d’Architecture de Nantes. Ces acteurs concentrent leurs forces pour développer l’excellence de la recherche nantaise et offrir de nouvelles opportunités de formations dans tous les domaines de la connaissance. Durable et ouverte sur le monde, Nantes Université veille à la qualité des conditions d’études et de travail offertes à ses étudiantes, étudiants et personnels, pour favoriser leur épanouissement sur tous ses campus de Nantes, Saint-Nazaire et La Roche-sur-Yon.

Mission

Environnement et contexte de travail

Localisation : Nantes. L’unité mixte de recherche US2B (Unité en Sciences Biologiques et Biotechnologies) est structurée autour de 5 équipes de recherche, d'une plateforme expérimentale et d'une cellule de compétences. Le poste est à pourvoir au sein de l’équipe 5 «Epigénomique des microalgues et interactions avec l'environnement» dirigée par Leïla Tirichine. L’équipe s’intéresse à la réponse moléculaire, et en particulier épigénétique, des microalgues à leur environnement. Au sein de cette équipe, la personne recrutée travaillera principalement avec Céline Duc, qui s’intéresse notamment à la conservation fonctionnelle des variants d’histones H2A entre les micro et macroalgues brunes.

Missions

Dans le cadre d’un financement ANR PRC, la personne recrutée aura pour but de caractériser le rôle des histones H2A d’algues brunes dans le contexte de l’augmentation de la température marine via l’étude de l’impact de l’absence d’une isoforme d’histone H2A sur la croissance et la réponse au stress thermique et de la distribution génomique des variants H2A chez P. tricornutum et de la conservation fonctionnelle des variants d’histone H2A d’Ectocarpus chez P. tricornutum. Ses missions seront de mettre en œuvre, dans le cadre de protocoles établis, des techniques de biologie cellulaire et moléculaire et de biochimie pour la préparation, la caractérisation et l’étude d’échantillons biologiques et d’organiser la collecte, le traitement et l’analyse de données génomiques.

Activités principales

• Conduire un ensemble de techniques de biologie cellulaire et moléculaire en conditions stériles, y compris la réalisation de cultures de microalgues et la création de mutants perte-de-fonction par la technologie CRISPR‑Cas9.
• Prélever et conditionner des échantillons en vue d’une expérimentation, notamment l’utilisation de la technique de ChIP‑Seq pour quantifier l’abondance et la localisation des histones à l’échelle nucléosomale et l’utilisation de la technique de RNA‑Seq pour quantifier l’expression du génome.
• Assurer la gestion et le traitement des données de séquençage, en mettant en place et en optimisant les procédures de recueil et de contrôle des données, en réalisant le traitement des données génomiques et en organisant la mise en forme et le stockage des données génomiques.
• Consigner, mettre en forme et présenter les résultats, en utilisant un cahier de laboratoire pour archiver les travaux et en présentant des résultats pendant les réunions d’équipe.
• Assurer la gestion des stocks, en conservant et suivant les mutants obtenus et en participant au repiquage des microalgues étudiées.

Profil

• Formation et/ou qualification : Bac+5.
• Expériences antérieures bienvenues pour occuper le poste : en biologie et si possible, en bio‑informatique.

Référence de l'offre : 656h3umgaw.