Ingénieur·e ADN environnemental et érosion alpine

Choisir le Service Public; Montpellier; On-site; EUR 42,000 - 60,000; Full time

Benefits offered by this job

Restaurant d'entreprise

Job summary

L’Institut national de recherche pour l’agriculture, l’alimentation et l’environnement (INRAE) recrute un ingénieur·e de recherche à Montpellier pour travailler sur le projet FLLORA, dédié à la restauration et l’adaptation des écosystèmes forestiers et d’eau douce. Vous intégrerez l’UMR AMAP et étudierez les bassins versants alpins pour comprendre l’origine des sédiments.

Votre mission consiste à développer et appliquer une méthode combinant ADN environnemental, analyses spatiales et données

Qualifications

• Formation recommandée : doctorat ou formation supérieure en écologie moléculaire, biologie moléculaire, sciences de l’environnement ou discipline proche, avec compétences complémentaires en géomatique et/ou hydrologie.
• Connaissances souhaitées : ADN environnemental (ADNe) et métabarcoding, PCR et séquençage haut débit ; bioinformatique et analyses statistiques ; SIG, processus d’érosion, hydrologie et connectivité sédimentaire.

Responsibilities

• Préparer et réaliser les campagnes de terrain dans les Alpes : choix des sites, prélèvements de sols et de sédiments, relevés environnementaux, conservation et traçabilité des échantillons.
• Effectuer les analyses moléculaires : extraction d’ADNe, PCR, préparation des bibliothèques et réalisation/organisation du séquençage.
• Mettre en œuvre et adapter les pipelines bioinformatiques : contrôle qualité, traitement des séquences, assignation taxonomique et analyse des communautés végétales.
• Comparer les signatures ADNe des sédiments et des zones sources potentielles, en évaluant les incertitudes et les limites de la méthode.
• Croiser les résultats avec les données SIG, topographiques, hydrologiques et de connectivité sédimentaire pour produire des cartes des zones sources et des voies de transfert.
• Documenter les méthodes et les données, présenter les résultats aux partenaires du projet et contribuer aux livrables et publications scientifiques.

Skills

Autonomie

Rigueur

Sens de l'organisation

Education

Doctorat ou formation supérieure en écologie moléculaire

Tools

R

Python

QGIS/ArcGIS

Job description

L’Institut national de recherche pour l’agriculture, l’alimentation et l’environnement (INRAE) recrute un ingénieur·e de recherche à Montpellier pour travailler sur le projet FLLORA, dédié à la restauration et l’adaptation des écosystèmes forestiers et d’eau douce. Vous intégrerez l’UMR AMAP et étudierez les bassins versants alpins pour comprendre l’origine des sédiments.

Votre mission consiste à développer et appliquer une méthode combinant ADN environnemental, analyses spatiales et données