Ingénieur de recherche bio-informaticien en Onco-Immunologie (H/F)

CNRS; Valbonne; Sur place; EUR 40 000 - 60 000; Plein temps

Résumé du poste

Un institut de recherche reconnu recherche un Ingénieur de recherche bio-informaticien en Onco-Immunologie pour participer à un projet collaboratif. Le poste demande un doctorat et des compétences en langage informatique, en analyse de données, et une connaissance de l’onco-immunologie. Le candidat travaillera en équipe sur des projets innovants avec des technologies avancées.

Qualifications

• Doctorat en bio-informatique ou domaine connexe requis.
• Expérience en analyse de données souhaitée.
• Compétences en imagerie et cytométrie en flux sont un plus.

Responsabilités

• Concevoir des panels d'analyses impliquant imagerie et transcriptomique.
• Appliquer des méthodes informatiques pour l'analyse spatiale.
• Gérer des données d'imagerie haute dimension.

Connaissances

Esprit critique

Autonomie

Rigueur

Précision dans la gestion des données

Langages informatiques (R et Python)

Connaissance en onco-immunologie

Capacité rédactionnelle en anglais

Formation

Doctorat

Description du poste

Ingénieur de recherche bio‑informaticien en Onco‑Immunologie (H/F)

Date limite de candidature : mardi 4 novembre 2025 23:59:00 heure de Paris
Assurez‑vous que votre profil candidat soit correctement renseigné avant de postuler.

Informations générales

• Intitulé de l’offre : Ingénieur de recherche bio‑informaticien en Onco‑Immunologie (H/F)
• Référence : UMR7275-FABANJ-002
• Nombre de postes : 1
• Lieu de travail : VALBONNE
• Date de publication : mardi 14 octobre 2025
• Type de contrat : IT en contrat CDD
• Durée du contrat : 28 mois
• Date d’embauche prévue : 1 janvier 2026
• Quotité de travail : Complet
• Rémunération : entre 3175 et 4864 euros selon expérience professionnelle acquise antérieurement
• Niveau d’études souhaité : Doctorat
• Expérience souhaitée : Indifférent
• BAP : A - Sciences du vivant, de la terre et de l’environnement
• Emploi type : Ingénieur ou ingénieur biologiste en analyse de données

Missions

Ingénieur de recherche (28 mois) participant à la réalisation d’un projet collaboratif en onco‑immunologie sur des tumeurs d’une cohorte de patients atteints de carcinomes épidermoïdes de la tête et du cou. Assurer l’organisation et l’exécution expérimentale du projet en collaboration avec les plateformes technologiques (imagerie par cytométrie de masse, transcriptomique spatiale). Ces études utiliseront des données scRNAseq et d’imagerie multidimensionnelle (protéines/ARN). Le candidat participera à la conception de panels d’analyses multiparamétriques, utilisera et développera des méthodes informatiques pour l’analyse spatiale des images en étroite interaction avec les membres de l’équipe et le réseau de collaborateurs scientifiques et cliniques du projet.

Activités

• Participer à la conception de panels de marquages en imagerie multiparamétrique (imagerie par cytométrie de masse, immunofluorescence)
• Concevoir un panel de transcriptomique spatiale
• Coordonner le transfert des échantillons biologiques entre partenaires
• Gérer les données d’imagerie haute dimension générées (IMC, transcriptomique spatiale)
• Appliquer des méthodes informatiques pour l’analyse spatiale de marquages de coupes de tumeurs humaines
• Développer des méthodes informatiques pour l’analyse spatiale de marquages multiparamétriques de coupes de tumeurs humaines
• Assurer la mise en forme et la présentation des résultats
• Rédiger des rapports

Compétences

• Esprit critique, autonomie, rigueur et précision dans la gestion et l’analyse des données
• Maîtrise des langages informatiques (R et Python)
• Connaissance en onco‑immunologie, imagerie et cytométrie en flux
• Conception de nouvelles techniques et analyses, mise en forme des résultats, analyses statistiques
• Capacité rédactionnelle et communication en anglais parlé et écrit

Contexte de travail

Le laboratoire de recherche des Drs Véronique Braud et Fabienne Anjuère est établi à l’Institut de Pharmacologie Moléculaire et Cellulaire (IPMC), Université Côte d’Azur, Sophia Antipolis, France, offrant un environnement de recherche multidisciplinaire stimulant et des technologies de pointe.

L’ingénieur(e) recruté(e) travaillera sous la responsabilité du Dr Fabienne Anjuère, en relation étroite avec les membres de l’équipe et en collaboration avec le réseau de collaborateurs scientifiques et cliniques participant au projet.

Le poste se situe dans un secteur relevant de la protection du potentiel scientifique et technique (PPST) et nécessite l’autorisation par l’autorité compétente du MESR.

Contraintes et risques

• Contraintes classiques liées à l’utilisation de matériels biologiques et chimiques.
• Possibilité d'adaptation aux contraintes de services et d’horaires.