INGENIEUR D’ETUDES DONNEES DE SANTE, EPIDEMIOLOGIE H/F

HOSPICES CIVILS DE LYON; Lyon; Sur place; EUR 35 000 - 45 000; Plein temps

Résumé du poste

Un établissement de santé recherche un analyste de données pour maintenir un outil de détection automatique des transmissions bactériennes. Le candidat devra avoir un Bac +5 en statistiques ou épidémiologie, et maîtriser des outils comme R et PostgreSQL. Le poste comprend des responsabilités en analyse de données et production de rapports pour les équipes opérationnelles. Prise de fonction en septembre 2025, contrat d'un an.

Qualifications

• Première prise de poste envisageable, mais de l'expérience en analyse de données est appréciée.
• Compétences souhaitées en logiciels d'analyses et gestion de données.

Responsabilités

• Analyse statistique et identification des tendances.
• Production de tableaux de bord et rapports pour les cliniciens.
• Maintenance d'un outil en production et intégration de bases de données.

Connaissances

Analyse des données

Visualisation de données (R, R Shiny, Python)

Gestion de bases de données (PostgreSQL)

Programmation dans un environnement Linux

Formation

Bac +5 dans le domaine des statistiques, gestion ou épidémiologie

Description du poste

Contexte

La détection rapide des épidémies bactériennes est un enjeu majeur pour les systèmes de santé. Les méthodes actuelles de surveillance des épidémies à l’hôpital sont peu réactives. Notre équipe développe et évalue des méthodes automatisées de surveillance épidémiologique, basées sur l’analyse en temps-réel des données de diagnostic microbiologique générées par les laboratoires hospitaliers.

Mission

La mission principale du poste porte sur le maintien d’un outil de détection automatique des transmissions bactériennes entre patients. Cet outil est basé sur un algorithme qui analyse quotidiennement des données d’antibiogramme des bactéries isolées des patients de l’hôpital, avec une interface graphique, à destination des équipes opérationnelles d’hygiène de chaque groupement hospitalier des Hospices Civils de Lyon. Les technologies utilisées sont Rshiny, PostgreSQL et Python.

Dans un contexte d’amélioration de la surveillance des infections, des épidémies bactériennes et de l’antibiorésistance, et dans une démarche d’épidémiologie et de recherche appliquée, vous contribuerez à l’exploitation, l’intégration et l’analyse des données de données de l’hôpital.

Missions

• Analyse statistique des données: participer au choix de la méthodologie, identifier des tendances, corrélations pertinentes pour la veille épidémiologique ou la recherche.
• Organiser le stockage de données au sein d’une infrastructure de stockage hospitalière
• En lien avec les autres personnes de l’équipe, produire des tableaux de bord, rapports: création de supports visuels et analytiques à destination des cliniciens, épidémiologistes, ou instances de l’hôpital.
• Assurer la maintenance d’un outil déployé en production utilisant les technologies R, Rshiny, PostgreSQL et Python
• Mettre en place d’éventuels développements de l’outil, en lien avec l’équipe projet
• Intégrer de bases de données hétérogènes: mise en relation de sources variées (laboratoire de bactériologie, suivi des épidémies, pharmacie, données administratives…)

Projet

Détection automatisée des épidémies en milieu hospitalier

Consortium ARPEGE

Profil

Formation :

Bac +5 dans le domaine des statistiques, de la gestion et du traitement de données ou de l’épidémiologie (formation universitaire ou diplôme d’ingénieur)

Expérience:

Peut convenir à un profil junior pour une première prise de poste.

Néanmoins, les expériences suivantes seraient appréciées :

- expérience en analyse et traitements de données

- expérience en maintenance évolutive et corrective d’applications déployées

Compétences techniques souhaitées :

• Maîtrise d’un ou plusieurs logiciels d’analyses de données, d’outils de visualisation de données (R, R Shiny, Python…)

• Compétence en gestion de bases de données (PostgreSQL)

• Compréhension d’un algorithme de détection de signaux épidémiques.

• Capacité à dialoguer avec l’équipe projet pour faire évoluer les règles d’alerte ou les seuils.

• Capacité à gérer des déploiements, des mises à jour et le suivi des incidents d’un outil informatique avec une interface utilisateurs

• Capacité à programmer efficacement tout en veillant à ce que le code soit évolutif, documenté et facilement réutilisable.

• Capacité à naviguer dans un environnement Linux (gestion de serveurs distants)

Pour postuler

Envoi CV + lettre de motivation à:

Jean-Philippe RASIGADE, [e-mail]

Mélanie Colomb-Cotinat: [e-mail]

Hospices Civils de Lyon / Centre International de Recherche en Infectiologie.

Prise de fonction en septembre 2025. Contrat de 1 an.