Chercheur postdoctorat/Chercheuse postdoctorat en microbiologie

CNRS; Illkirch-Graffenstaden; Sur place; EUR 34 000 - 39 000; Plein temps

Avantages offerts par ce poste

Restaurant CROUS

Mutuelle

Transports pris en charge 75%

Télétravail possible

Résumé du poste

CNRS recrute un chercheur en microbiologie pour un projet ANR sur les sidérophores et le microbiote intestinal à Illkirch-Graffenstaden. CDD de 9 mois, salaire mensuel entre 3 071,50 € et 3 501,51 €.

Vous contribuerez à caractériser les sidérophores, à étudier leur impact sur la dynamique du microbiote et à développer des stratégies probiotiques ou thérapeutiques. Le poste requiert un doctorat en microbiologie, une expertise en culture anaérobie, en cytométrie et en analyses bioinformatiques,

Qualifications

• Doctorat en microbiologie exigé.
• Expérience en culture anaérobie et manipulation de souches en biosécurité L2.
• Compétences en analyses moléculaires et bioinformatiques souhaitées.

Responsabilités

• Développement de protocoles pour détecter et quantifier les sidérophores en conditions anaérobies.
• Étude des interactions entre bactéries productrices de sidérophores et le microbiote.
• Analyse des données et rédaction d'articles scientifiques; présentations en conférences internationales.

Connaissances

Anglais C2

Autonomie

Rigueur

Esprit d'équipe

Analyse rédaction scientifique

Culture anaérobie

Biologie moléculaire

Biochimie

Formation

Doctorat en microbiologie

Biologie moléculaire

Biochimie

Outils

ImageJ/Fiji

Description du poste

Poste : Chercheur(e) H/F en microbiologie – Projet ANR sur les sidérophores et le microbiote intestinal Localisation : Illkirch-Graffenstaden (Strasbourg, France) | CDD 9 mois (début : 9 novembre 2026) | Salaire : 3 071,50 – 3 501,51 €/mois

Contexte scientifique : Rejoignez l’équipe MMBCA (Métaux et Microorganismes : Biologie, Chimie et Applications), dirigée par le Dr. Isabelle Schalk et le Dr. Gaetan Mislin, au sein du laboratoire BSC (UMR 7242, CNRS/Université de Strasbourg). Ce poste s’inscrit dans un projet financé par l’ANR visant à décrypter le rôle des sidérophores — des molécules produites par les bactéries intestinales pour capter le fer — dans la compétition microbienne et la résistance à la colonisation par des pathogènes.

Ce projet multidisciplinaire combine : Microbiologie moléculaire Biochimie Analyses génomiques Modèles cellulaires et co-cultures

• Caractériser la production de sidérophores chez des souches bactériennes intestinales (commensales et pathogènes).
• Étudier leur impact sur la dynamique du microbiote et les mécanismes de compétition.
• Développer des stratégies probiotiques ou thérapeutiques pour moduler le microbiote.

Missions clés :

• Développement de protocoles pour détecter et quantifier les sidérophores en conditions anaérobies (milieu limitant en fer).
• Étude des interactions entre bactéries productrices de sidérophores, microbiote résident et pathogènes (modèles in vitro, co-cultures, modèles cellulaires).
• Analyses moléculaires et cellulaires :
• Techniques : PCR, qPCR, séquençage, cytométrie en flux, tests de compétition bactérienne, microscopie à fluorescence.
• Outils : ImageJ/Fiji pour le traitement d’images.
• Construction de souches mutant (mutagenèse ciblée, souches rapporteurs fluorescents).
• Analyse bioinformatique et statistique des données pour identifier les corrélations entre production de sidérophores, composition du microbiote et résistance à la colonisation.
• Rédaction d’articles scientifiques et présentations en conférences internationales.
• Formation : Doctorat en microbiologie, biologie moléculaire, biochimie ou domaine connexe.
• Expérience souhaitée : 1 à 4 ans d’expérience post-doctorale ou équivalente, avec une expertise avérée en :
• Culture bactérienne anaérobie.
• Manipulation de souches pathogènes en niveau de biosécurité L2.
• Modèles cellulaires infectieux (culture de cellules eucaryotes, infections bactériennes).
• Cytométrie en flux, microscopie à fluorescence, traitement d’images (ImageJ/Fiji).
• Mutagenèse ciblée et construction de souches rapporteurs.
• Langues : Anglais C2 (indispensable pour la rédaction d’articles et les collaborations internationales).
• Soft skills : Autonomie, rigueur, esprit d’équipe, capacité à travailler dans un environnement pluridisciplinaire (biologistes, chimistes).

Environnement de travail

• Laboratoire BSC (UMR 7242) : ~100 personnes, équipe MMBCA de ~23 chercheurs (biologistes et chimistes).
• Accès : Tram depuis Strasbourg.
• Restaurant collectif CROUS sur le campus.
• Prise en charge des transports à 75% + forfait mobilité jusqu’à 300 €.
• Participation à la mutuelle, 44 jours de congés + RTT/an, télétravail possible.
• Comité d’Action Sociale (activités sportives, loisirs, billetterie).
• Travail en laboratoire de niveau de biosécurité L2.
• Respect strict des protocoles de sécurité pour la manipulation de souches pathogènes.