Chercheur en chémoinformatique: Python/RDKit & découverte

Unistra; Strasbourg; Sur place; EUR 36 000 - 52 000; Plein temps

Résumé du poste

Université de Strasbourg cherche un chercheur/chercheuse en chémoinformatique en CDD de projet de 13 mois. Développera et appliquera des méthodes pour l’analyse et la visualisation de l’espace chimique, la conception et la priorisation de chimiothèques, en collaboration avec un partenaire industriel du secteur pharmaceutique.

Maîtrise de RDKit et programmation Python requises; déploiement en flux reproductibles, API et notebooks, avec une forte autonomie et esprit collaboratif dans un contexte

Qualifications

• Doctorat en chémoinformatique ou domaine proche.
• Solide expertise en chémoinformatique: représentation et standardisation des structures chimiques, mesures de similarité, analyse et visualisation de l’espace chimique.
• Connaissance des approches computationnelles de conception et d’optimisation de chimiothèques.
• Maîtrise de l’anglais scientifique, à l’écrit comme à l’oral.

Responsabilités

• Développer des flux de travail reproductibles pour le traitement, la standardisation, la représentation, la comparaison et l’analyse des structures chimiques et des données associées.
• Concevoir des visualisations claires, statiques et interactives, des espaces chimiques, des squelettes moléculaires et des paysages de propriétés ou d’activités.
• Concevoir et évaluer des chimiothèques ciblées et diversifiées et prioriser les composés.
• Implémenter ces méthodes sous forme de paquets Python/RDKit maintenables et d’outils en ligne de commande, en collaboration avec les chimistes du partenaire industriel.

Connaissances

Python

RDKit

Bash/Linux

Git

CI/CD

Data visualization

Teamwork

Autonomy

Formation

Doctorat en chémoinformatique

Outils

RDKit

Description du poste

Université de Strasbourg cherche un chercheur/chercheuse en chémoinformatique en CDD de projet de 13 mois. Développera et appliquera des méthodes pour l’analyse et la visualisation de l’espace chimique, la conception et la priorisation de chimiothèques, en collaboration avec un partenaire industriel du secteur pharmaceutique.

Maîtrise de RDKit et programmation Python requises; déploiement en flux reproductibles, API et notebooks, avec une forte autonomie et esprit collaboratif dans un contexte