Bio informaticien Registre CNV - H/F

CHU de Bordeaux; Bordeaux; On-site; EUR 52,000 - 75,000; Full time

Job summary

Le CHU de Bordeaux, premier employeur de Nouvelle-Aquitaine, propose un poste de bioinformaticien au sein des Registres Cardio-Neuro-Vasculaires (RCNV). Vous travaillerez sur le traitement, l’intégration et l’exploitation des données cliniques et SNDS, en lien avec les équipes médicales et informatiques.

Vous assurerez la qualité, la sécurité et la gouvernance des données, participerez à la rédaction de protocoles et à la valorisation des résultats, dans un contexte de médecine et de recherche

Qualifications

• Anglais scientifique exigé pour les échanges et la documentation.
• Connaissances solides en biologie et en informatique médicale.
• Maîtrise des bases de données et des outils d’analyse statistique.

Responsibilities

• Concevoir, piloter et maintenir les bases de données et leur traitement.
• Garantir la qualité et la sécurité des données collectées.
• Contribuer à l’exploitation et à la valorisation des résultats.

Skills

Anglais scientifique

Biologie

Bureautique / TIC

Conduite de projet

Ethique déontologie médicale

Informatique / Système d’information

Méthodes de recherche clinique

Vocabulaire médical

Environnement SAS

Langage de programmation

Langage Python

LLMs/IA

Tools

SAS

Job description

Rejoignez le CHU de Bordeaux, premier employeur de Nouvelle-Aquitaine ! Intégrez un collectif passionné de 15 700 professionnels, dont 1 600 médecins, couvrant plus de 200 métiers. Ici, les soins sont responsables, durables, portés par une ambitieuse RSE et une transition écologique en marche.

Implanté sur quatre sites— Pellegrin et Saint-André à Bordeaux, Haut-Lévêque et Xavier-Arnozan à Pessac —, le CHU offre un cadre pluridisciplinaire en pleine évolution, au cœur de pôles d’excellence reconnus nationalement.

Chaque année, nous prenons en charge plus d’un million de patients, formons les futures générations de soignants et propulsons la recherche via nos deux instituts hospitalo-universitaires et unités de pointe, saluées à l’international.

Plongez dans un environnement innovant où votre expertise compte !

Pellegrin

L’hôpital Pellegrin constitue l’un des principaux sites du CHU de Bordeaux, avec une offre de soins très large et diversifiée couvrant des activités cliniques, chirurgicales, médico‑chirurgicales et d’urgence de haut niveau. L’hôpital des enfants et le centre Aliénor d’Aquitaine, réunissant maternité et offre de soins gynécologiques et obstétriques, sont notamment situés à l’hôpital Pellegrin. Le CHU de Bordeaux va déployer le projet « Nouveau CHU » : 1,4 milliard d’investissement pour rénover et construire de nouveaux bâtiments. C’est le plus grand chantier de France.

Le Poste

Contexte

Pilotés par l’ARS Nouvelle-Aquitaine, les Registres Cardio-Neuro-Vasculaires (RCNV) constituent depuis 2010 un dispositif régional de suivi des parcours de soins des patients pris en charge pour un AVC, un infarctus du myocarde ou un acte de coronarographie/angioplastie coronaire. Ils reposent sur trois recueils pérennes, multicentriques et continus de données nominatives, appariées aux bases existantes (SAMU, PMSI, fichier des personnes décédées, SNDS), permettant d’analyser les pratiques, les organisations et les résultats des prises en charge.

Les RCNV visent à caractériser les besoins des patients, identifier les problématiques organisationnelles régionales et contribuer à la définition d’une politique de santé adaptée aux pathologies cardio-neuro-vasculaires.

Ils Comprennent Trois Recueils

• REANIM : 17 000 prises en charge pour infarctus du myocarde enregistrées depuis 2012 dans 6 SAMU, 19 SMUR et 33 services d’urgence d’Aquitaine ;
• ACIRA : 320 000 actes de coronarographie et/ou d’angioplastie coronaire enregistrés depuis 2012 dans 11 centres d’Aquitaine ;
• ObA2 : 52 000 séjours pour AVC et 16 000 consultations post-AVC enregistrés depuis 2012 dans 49 établissements de santé de Nouvelle-Aquitaine.

Le poste s’inscrit dans le cadre du remplacement d’un bioinformaticien de l’équipe.

Missions générales

• Coordonner le développement et la maintenance des bases de données ;
• Garantir la qualité et la sécurité des données ;
• Participer à leur traitement et à leur valorisation ;
• Contribuer aux missions nécessaires au bon fonctionnement des registres.

Principales Activités

Traitement et gestion des données

• Identifier et concevoir les outils informatiques de recueil des données ;
• Piloter leur déploiement dans les établissements, en lien avec les référents informatiques, et assurer leur maintenance
• Exploiter les données, harmoniser les informations et organiser leur mise en forme et leur stockage avec l’hébergeur ;
• Piloter l’intégration et le chaînage des données dans la base de production SQL ;
• Exploiter les données du SNDS pour le suivi des patients ;
• Assurer la gestion et la maintenance du parc informatique ainsi qu’une veille sur la sécurité et les systèmes d’information.

Qualité et sécurité

• Garantir le respect des règles de sécurité des données ;
• Développer et mettre en œuvre les contrôles qualité ;
• Définir et gérer les demandes de correction relatives à l’exhaustivité, au remplissage, à la cohérence et à l’homogénéité des données, en lien avec les attachés de recherche clinique ;
• Rédiger et actualiser la documentation technique et les procédures de recueil, d’extraction, de transfert, d’harmonisation, de contrôle et d’assurance qualité.

Exploitation et valorisation

• Participer à l’analyse, à l’interprétation et à la présentation des résultats statistiques, en lien avec le statisticien et le médecin coordonnateur ;
• Contribuer au développement et à l’amélioration de la plateforme de restitution des résultats.

Profil Recherché

Aptitudes attendues :

• Concevoir, formaliser et adapter des procédures / protocoles / modes opératoires / consignes relatives à son domaine de compétence
• Concevoir, piloter et évaluer un projet / un processus relevant de son domaine de compétence
• Identifier, analyser, prioriser et synthétiser les informations relevant de son domaine d’activité
• Piloter, animer / communiquer, motiver une ou plusieurs personnes
• Rédiger et mettre en forme des notes, documents et/ou rapports relatifs à son domaine de compétence
• S’exprimer en public
• Travailler en équipe pluridisciplinaire / en réseau
• Utiliser les logiciels métier

Connaissances Attendues

• Anglais scientifique
• Biologie
• Bureautique / Technologies information et communication
• Conduite de projet
• Ethique et déontologie médicale
• Informatique / Système d’information
• Méthodes de recherche clinique
• Vocabulaire médical
• Environnement SAS
• Langage de programmation
• Langage de programmation Python
• LLMs/IA

Localisation

Poste basé à l’Institut de Santé Publique, d’Épidémiologie et de Développement (ISPED), 146 rue Léo-Saignat, 33000 Bordeaux, au sein de l’équipe des registres cardio-neuro-vasculaires.