Bio Informaticien H/F

Gustave Roussy; France; Hybrid; EUR 52,000 - 72,000; Full time

Benefits offered by this job

Politique de formation dynamique

Accès au CSE

Dispositifs de bien-être au travail

Pass Navigo + forfait mobilité durable

Self et cafétéria d’entreprise

Job summary

Gustave Roussy recrute un bioinformaticien(ne) pour rejoindre le Laboratoire de génétique et de biologie des cancers de la thyroïde, sur le campus de Villejuif. Le poste est un CDI de chantier de 2 ans, en collaboration avec les équipes Iñigo Landa et Julien Hadoux, et vise l’analyse de données génomiques bulk et single-cell (WES, WGS, RNA-seq, multiome).

Vous maîtrisez Unix, Python/R, et les pipelines Nextflow ou Snakemake, avec une expérience en HPC et un esprit rigoureux, organisé et capable

Qualifications

• Master en bioinformatique / biologie computationnelle ou doctorat équivalent.
• Maîtrise d’Unix et de Python/R.
• Expérience en analyse de grands jeux de données génomiques.
• Expérience avec Nextflow ou Snakemake est souhaitable.
• Bonne organisation et rigueur scientifique.
• Bon anglais requis.
• Intérêt pour un environnement wet lab et travail en équipe internationale.

Responsibilities

• Analyser des données de séquençage nuclééaire unicellulaire et multiome.
• Intégrer et analyser des profils multi-omiques bulk et cellule unique.
• Contribuer à des analyses RNA-seq bulk, ATAC-seq et long reads et échanger avec l’équipe de recherche.

Skills

Unix

Python

R

Nextflow

Snakemake

Organisation

Autonomie

Rigueur scientifique

Anglais professionnel

Education

Master en bioinformatique / biologie computationnelle

Doctorat en bioinformatique / génomique

Job description

Bienvenue sur le nouveau site de Gustave Roussy

Un nouveau site pensé pour vous offrir une expérience plus simple, plus claire et plus intuitive. Patients, aidants, professionnels, donateurs : retrouvez plus facilement les informations, les actualités et les services.

Offre publiée le 06-08-2026.Référence : 2026-734

L'espoir de guérir le cancer a un nom, Gustave Roussy.

Premier centre européen de lutte contre le cancer et de renommée internationale, Gustave Roussy recrute unBio Informaticien H/F en CDI de chantier de 2 ans.

Le Laboratoire de génétique et de biologie des cancers de la thyroïde, dirigé par Iñigo Landa, PhD, au sein de l’INSERM UMR981 et de l’IHU-PRISM, explore les aspects fondamentaux et translationnels des cancers de la thyroïde, avec un accent particulier sur les formes avancées de la maladie. Le laboratoire utilise diverses techniques s’appuyant sur des échantillons humains, des systèmes cellulaires et des modèles animaux. Notre objectif est de produire des connaissances scientifiques de haute qualité tout en favorisant un bon équilibre entre vie professionnelle et vie personnelle. Le poste proposé est initialement financé pour une durée de deux ans. Le ou la candidat(e) retenu(e) devra travailler sur des projets collaboratifs entre Iñigo Landa et Julien Hadoux du Comité des Tumeurs Endocrines.

La personne recrutée réalisera des analyses bioinformatiques sur des données existantes et à venir. Celles-ci incluent des données de séquençage en vrac (WES, WGS, RNAseq, long read DNAseq), des données de RNA-seq en cellule unique/noyau unique et multiome (RNA/ATACseq), ainsi que des données de transcriptomique/protéomique spatiale, obtenues à la fois à partir d’échantillons de patients et de modèles animaux de la maladie.

Les projets actuels du laboratoire visent à comprendre comment les altérations génétiques et épigénétiques favorisent la progression des cancers de la thyroïde, ainsi qu’à décrypter leur microenvironnement tumoral immunitaire. Le/la candidat(e) sera amené(e) à travailler en tant que Bio Informaticien(ne) sur les tâches suivantes :

• Analyser des données de séquençage nucléaire unicellulaire (snRNA-seq) et de multiome déjà générées à partir de modèles murins génétiquement modifiés de cancers de la thyroïde;
• Contribuer à l’intégration et à l’analyse de données issues de profils multi-omiques existants et futurs (bulk et cellule unique) provenant de cohortes de patients atteints de cancer thyroïdien anaplasique;
• Analyser des données de RNA‑seq en vrac (bulk RNA‑seq), d’ATAC‑seq et de séquençage à longues lectures obtenues à partir d’échantillons de patients et d’organoïdes dérivés de patients. Participer activement aux réunions de l’équipe, échanger avec les membres du laboratoire expérimental afin d’identifier leurs besoins, et les conseiller sur les meilleures pratiques en matière d’analyse bioinformatique et statistique des données.

Profil recherché

• Master en bioinformatique / biologie computationnelle ou dans un domaine connexe avec plusieurs années d’expérience, ou doctorat en bioinformatique, biologie computationnelle, génomique ou domaine connexe.
• Maîtrise d’Unix et de Python/R.
• Maîtrise des environnements de calcul haute performance (HPC).
• Expérience préalable dans l’analyse de grands jeux de données génomiques, idéalement issus d’approches en cellule unique.
• Une expérience dans l’exécution de pipelines bioinformatiques avec Nextflow ou Snakemake est souhaitable.
• Excellentes capacités d’organisation, autonomie et rigueur scientifique.
• Volonté de s’intégrer dans un environnement de laboratoire expérimental (« wet lab ») et de contribuer à plusieurs projets.
• Nous sommes une équipe internationale et les activités de recherche se déroulent en anglais. Une bonne maîtrise de l’anglais est donc indispensable.

Aptitudes complémentaires

• Intérêt pour un environnement de recherche collaboratif et multidisciplinaire.
• Initiative et créativité pour résoudre des problématiques techniques.
• Excellentes compétences en communication écrite et orale, capacité à documenter les méthodes et résultats de façon claire, pour des publications

Ce CDI de chantier de 2 ans renouvelable sous réserve de la poursuite du financement, est basé à Villejuif, Grand Paris, sur le campus de Gustave Roussy.

• Politique de formation dynamique
• Accès au CSE (Chèques vacances, voyages, événements culturels, chèque cadeaux…)
• Dispositifs de bien-être au travail (Bulle détente, ostéopathie, Shiatsu…)
• Prise en charge du Pass Navigo à 75%, forfait mobilité durable (vélo ou trottinette)
• Self et cafétéria d’entreprise

Accessibilité:

• Lignes 14 et 15 – Station: Villejuif – Gustave Roussy
• Parking sur place

Intégrer le premier centre français et européen de lutte contre le cancer

Classé premier centre européen et dans le top 10 mondial, Gustave Roussy constitue un pôle d’expertise globale entièrement dédié aux patients atteints de cancer. L’Institut est un pilier fondateur du biocluster en oncologie, le Paris Saclay Cancer Cluster. Source d'innovations thérapeutiques et d'avancées diagnostiques, l’Institut accueille plus de 50 000 patients chaque année et développe une approche intégrée entre recherche, soins et enseignement.

Expert des cancers rares et des tumeurs complexes, Gustave Roussy est un établissement privé à but non lucratif participant au service public hospitalier français et traite tous les cancers, à tous les âges de la vie. Il propose à ses patients une prise en charge personnalisée qui allie innovation et humanité, où sont pris en compte le soin mais aussi la qualité de vie physique, psychologique et sociale. Avec 4 000 salariés répartis sur deux sites, Villejuif et Chevilly-Larue, Gustave Roussy réunit les expertises indispensables à une recherche de haut niveau en cancérologie ; un quart des patients traités sont inclus dans des essais cliniques.

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