2025-140 Chargé de projet en analyse de données (H/F)

French Agency for Food, Environmental and Occupational Health & Safety (ANSES); Fougères; On-site; EUR 35,000 - 45,000; Full time

Job summary

Une agence de santé publique recherche un Chargé de projet en analyse de données. Le candidat travaillera sur le projet européen Interreg REVALGAE, visant à créer un inventaire d'algues invasives. Les missions incluent l'interrogation des bases de données et la rédaction de comptes-rendus. Un Bac+5 en bioinformatique ou écologie est requis, ainsi qu'une solide expérience en data-mining. Le poste est basé à Fougères, en Bretagne.

Qualifications

• Expérience solide en fouille de données.
• Expérience en création de base de données souhaitée.
• Bonne maîtrise des outils informatiques.

Responsibilities

• Interroger les bases de données mondiales.
• Rédiger des compte-rendus et des délivrables.
• Cartographier la présence des algues.

Skills

Python

Autonomie

Rigueur

Communication

Travail en équipe

Education

Master ou Doctorat en bioinformatique ou en écologie

Bac+3 minimum en écologie, biologie

Tools

Outils de data-mining

Outils de text-mining

Job description

2025-140 Chargé de projet en analyse de données (H/F)

Vous interviendrez, en collaboration avec différents partenaires, dans le cadre du projet européen Interreg REVALGAE intégrant 9 partenaires de l’arc Atlantique (du Portugal à l’Irlande). En collaboration avec le responsable du projet, vous travaillerez sur la mise en place d’un catalogue des algues invasives et halophiles.

Rattaché(e) au laboratoire de Fougères, unité Toxicologie des contaminants

Votre équipe :

Le laboratoire de Fougères regroupe 65 agents répartis en 4 unités. Il exerce son activité dans les domaines de la sécurité alimentaire, de la médecine vétérinaire et de l’hygiène des aliments. La mission du laboratoire est de contribuer à une meilleure connaissance des bénéfices et des risques associés à l'utilisation des médicaments vétérinaires et des désinfectants par la filière agro‑alimentaire. Il analyse également l’effet des antimicrobiens (antibiotiques et biocides) sur l’antibiorésistance et caractérise les dangers toxicologiques associés aux contaminants.

Au sein de ce laboratoire, l’Unité Toxicologie des contaminants est chargée de contribuer à l’évaluation des risques en apportant son expertise dans le domaine de la toxicologie des contaminants. Les activités de recherche s’organisent autour de 2 grands axes :

• l’évaluation du danger, en particulier génotoxique, de contaminants ou de substances émergentes ainsi que de leurs mélanges, à l’aide de tests in vitro sur cultures cellulaires et in vivo sur rongeurs.
• En parallèle, les mécanismes d’action impliqués dans la toxicité des composés sont explorés grâce à des approches « omiques » (transcriptomique, protéomique et métabolomique) et des approaches d’imagerie cellulaire multiparamétriques et in silico.

L’unité contribue également à la génération de bases de données générées sur différentes thématiques en utilisant la fouille de données.

L’Unité est leader du WP1 du projet Interreg REVALGAE, visant à créer un inventaire des espèces d’algues invasives et halophiles retrouvées dans l’espace Atlantique afin de disposer d’une base de connaissances solide pour la mise en œuvre du projet. Pour ce faire, diverses sources de données mondiales (EMODnet, EASIN, AlgaeBase, GBIF, OBIS), mais aussi les bases de données nationales (par exemple, invasoras.pt), ainsi que la littérature scientifique la plus récente (Pub Med, Scopus, Web of Science) seront consultées. En collaboration avec les autres partenaires, il s’agira de consolider les informations provenant de ces plateformes, afin d’obtenir une vue d’ensemble des espèces à fort impact présentes dans la région atlantique, des endroits où elles prolifèrent et des facteurs susceptibles d'influencer leur distribution et leur niveau de biomasse.

Vous rejoindrez une équipe de 9 d’agents (3 personnes en technique et 6 scientifiques), dont la taille varie en fonction des recrutements de CDD sur des projets de recherches ainsi que des apprentis et des étudiants (thèse, master, bac +3)

Votre quotidien :

• Interroger les bases de données mondiales et nationales
• Interroger la littérature scientifique pour en extraire les informations pertinentes
• Cartographier la présence de ces algues
• Identifier des facteurs influençant leur distribution et biomasse
• Compiler les résultats dans un format consultable par les différents partenaires

Valorisation :

• Fournir des compte‑rendus
• Rédiger les délivrables associés
• Participer aux réunions de travail pour le suivi du projet
• Présenter les résultats lors de congrès, colloques ainsi que par publication

Votre profil :

• Bac+5 à BAC+8, master ou doctorat en bioinformatique ou en écologie (minimum Bac+3)
• Formation initiale en écologie, biologie
• Expérience solide en fouille de données (data‑mining et/ou text‑mining)
• Expérience en création de base de données souhaitée

Compétences :

• Maîtrise des outils et des langages informatiques spécialisés tels que Python
• Autonomie, rigueur, réactivité, sens de l’organisation, force de proposition
• Bonne aptitude à la communication et au travail en équipe
• Bon niveau en anglais souhaité