Técnico/a de Proyecto de Investigación

Agencia De Vivienda Y Rehabilitacion De Andalucia; Granada; On-site; EUR 30,000 - 40,000; Full time

Job summary

Una entidad pública andaluza busca un/a Técnico/a de Proyecto de Investigación para análisis de datos de NGS-secuenciación. Se requiere formación en Biología o disciplinas afines, con experiencia en técnicas de RNA-seq y clasificación de datos. El candidato ideal manejará lenguajes de programación como R y BASH, y será capaz de integrar y analizar datos clínicos y transcriptómicos. Ofrecemos un contrato indefinido en Granada, Andalucía, con un entorno de trabajo colaborativo.

Qualifications

• Experiencia mínima de 1 año en análisis de datos de NGS-secuenciación.
• Documentación reglada para contratación laboral en España.
• Conocimientos de análisis de transcriptoma: RNAseq y smallRNAseq.

Responsibilities

• Análisis de las librerías de RNA‑Seq de muestras de plasma.
• Integración de datos de RNA‑Seq y DNA‑Seq.
• Generación de modelos de clasificación de pacientes mediante machine learning.

Skills

Análisis de datos de NGS-secuenciación

Nivel de Inglés B2

Manejo de R

Manejo de BASH

Conocimientos en bioestadística

Conocimientos de ofimática avanzada

Education

Licenciatura o Grado Universitario en Biología, Biomedicina, Bioquímica

Tools

Docker

Git

Job description

Oferta de empleo – Técnico/a de Proyecto de Investigación

Puesto: Técnico/a de Proyecto de Investigación.

Entidad: Fundación Pública Andaluza Progreso y Salud, M.P.

Contrato: Indefinido.

Requisitos

• Licenciatura o Grado Universitario en Biología, Biomedicina, Bioquímica o equivalente.
• Experiencia de al menos 1 año en análisis de datos de NGS‑secuenciación de nueva generación.
• Nivel de Inglés B2 (MCREL) evidenciado por título o prueba de nivel.
• Documentación reglada para contratación laboral en España.
• Requisitos valorables:
  • Trabajos fin de grado, fin de máster o publicaciones con análisis de NGS‑secuenciación.
  • Conocimientos en técnicas de NGS‑secuenciación:
    • Análisis de transcriptoma: RNAseq y smallRNAseq.
    • Análisis del repertorio de linfocitos T (TCRseq).
    • Manejo fluido de bases de datos y herramientas on‑line (TCGA, ENSEMBL, GTEx, ClinVar).
  • Manejo fluido de los lenguajes de programación R y BASH.
  • Conocimientos básicos de Docker y Git.
  • Conocimientos bioestadística (cursos oficiales):
    • Análisis multivariante.
  • Conocimientos de ofimática avanzada:
    • Creación de figuras.
    • Manejo de Excel.
    • Redacción de artículos y proyectos científicos.

Funciones

• Análisis de las librerías de RNA‑Seq (muestras de plasma, biopsias frescas y embebidas en parafina).
• Análisis del repertorio de linfocitos T (TCRseq) a partir de los datos de RNA‑seq.
• Estratificación de pacientes mediante análisis multivariante a partir de variables clínicas, transcriptómicas y genéticas.
• Integración de datos de RNA‑Seq y DNA‑Seq.
• Empleo de repositorios públicos (TCGA y GEO) para la validación y análisis de supervivencia de los resultados obtenidos en los estudios de RNA‑Seq y DNA‑Seq; análisis de redes de interacción molecular entre los principales genes detectados.
• Generación de modelos de clasificación de pacientes mediante “machine learning” a partir de las variables clínicas, transcriptómicas y genéticas de interés.