Softwareentwickler (m/w/d)

Philipps-Universität Marburg - Fachbereich Medizin; Marburg; On-site; EUR 54,000 - 72,000; Full time

Benefits offered by this job

Interdisziplinäres Team

Möglichkeit zur Mitarbeit im German Bi

Job summary

Die Philipps-Universität Marburg – Fachbereich Medizin sucht eine/n Projekt- und IT-Manager*in Biobank im Rahmen eines Drittmittelprojekts. Die Stelle ist befristet bis 31.12.2029 und wird je nach Qualifikation bis Entgeltgruppe 13 TV-L Hessen eingeordnet.

Sie koordinieren Biobankarbeiten, entwickeln das IT-Management weiter und integrieren Biobank-Daten in das regionale DIZ-System. Die Anstellung erfolgt in Marburg, mit enger Zusammenarbeit im NUM-Netzwerk.

Qualifications

• Wissenschaftliches Hochschulstudium (Diplom, Master oder vergleichbar) in Informatik oder verwandten Bereichen.
• Fundierte Kenntnisse in Java, SQL und GitLab sowie HL7 2.x/Hl7-FHIR.
• Verständnis klinischer Prozessabläufe in Krankenhäusern.
• Gute Deutsch- und Englischkenntnisse in Wort und Schrift.

Responsibilities

• Koordination von Biobankarbeiten in NUM-Projekten am Standort Marburg.
• Vorbereitung, Begleitung und Durchführung von Schulungen, Ringversuchen und Audits.
• Weiterentwicklung und IT-Management des Biobank-Informations- und Managementsystems.
• Anbindung des Systems an das lokale DIZ und Integration der Biobank-Datenflüsse.
• Bearbeitung von Anfragen und Machbarkeitsanalysen zu Bioproben- und Datenbeständen.
• Mitarbeit in Arbeitsgruppen des German Biobank Networks zu IT-Management und Datenqualität.

Skills

Deutschkenntnisse (sehr gut)

Englischkenntnisse (sehr gut)

Java

SQL

GitLab

HL7 2.x

HL7-FHIR

Datenbank-Kuration

IT-Management

Teamfähigkeit

Selbstständige Arbeitsweise

Education

Diplom / Master in Informatik / medizinische Informatik / Software-Entwicklung / Bioinformatik

Tools

Java

SQL

GitLab

HL7 2.x

HL7-FHIR

Job description

Die 1527 gegründete Philipps-Universität bietet vielfach ausgezeichnete Lehre für rund 22.000 Studierende und stellt sich mit exzellenter Forschung in der Breite der Wissenschaft den wichtigen Themen unserer Zeit.

Projekt- und IT-Manager*in Biobank

Am Fachbereich Medizin, Comprehensive Biomaterial Bank Marburg, ist zum nächstmöglichen Zeitpunkt befristet bis 31.12.2029 eine drittmittelfinanzierte Vollzeitstelle als Projekt- und IT-Manager*in Biobank zu besetzen. Die Eingruppierung erfolgt je nach Qualifikation und Erfüllung der tariflichen Voraussetzungen bis Entgeltgruppe 13 des Tarifvertrages des Landes Hessen. Eine unbefristete Verlängerung der Stelle über den Befristungszeitraum hinaus wird angestrebt.

Das Forschungsvorhaben/Drittmittelprojekt „Eine Biobankplattform für Deutschland (BPD) “ im Netzwerk Universitätsmedizin (NUM) verfolgt das Ziel, den Zugang zu qualitätsgesicherten humanen Bioproben und zugehöriger Daten in Deutschland grundlegend zu vereinfachen. Durch den Ausbau bestehender universitärer Biobanken zu einer serviceorientierten nationalen Forschungsinfrastruktur für Akademia und Industrie kann sowohl der wissenschaftliche Erkenntnisgewinn beschleunigt, als auch die Entwicklung neuer Diagnostika und Therapien erheblich unterstützt werden. Damit adressiert die BPD einen zentralen Bedarf der nationalen und internationalen akademischen Forschung und der forschenden Industrie: einen schnellen, ressourcenschonenden und rechtssicheren Zugang zu genau den Bioproben und Daten, die für die Beantwortung aktueller und zukünftiger biomedizinischer und translationaler Fragestellungen benötigt werden.

Diese Ausschreibung richtet sich an wissenschaftliches Personal, das einen neuen Schwerpunkt im Bereich des klinischen Biobankings für Forschungszwecke sucht oder alternativ auch an Personen mit Erfahrung im Bereich Forschungsdatenmanagement. Der/die Stelleninhaber*in fungiert als Brückenposition zwischen der Biobank und dem lokalen Datenintegrationszentrum am Standort Marburg und fördert deren strukturelle Anbindung.

Aufgaben

• Koordination von Biobankarbeiten in NUM-Projekten am Standort, insbesondere im Bereich Projektberatung, -begleitung, -vorbereitung und -pilotierung in Zusammenarbeit mit assoziierten Partnerinstitutionen, klinischem Personal und Forschenden
• Vorbereitung, Begleitung und Durchführung von Schulungen, Ringversuchen und Audits im Rahmen des NUM
• Weiterentwicklung und IT-Management des Biobank-Informations- und Managementsystems
• Etablierung der Anbindung des Biobank-Informations- und Managementssystems an das lokale Datenintegrationszentrum (DIZ) sowie Integration der Biobank-Datenflüsse in die NUM-Datenstrukturen
• Bearbeitung von Anfragen und Durchführung von Machbarkeitsanalysen zu individuellen lokalen Bioproben- und Datenbeständen in Kooperation mit dem lokalen DIZ
• aktive Mitarbeit in Arbeitsgruppen des German Biobank Networks (GBN) zu Themen IT-Management, Datenqualität und intersektoraler Vernetzung

Qualifikationen

• abgeschlossenes wissenschaftliches Hochschulstudium (Diplom, Master oder vergleichbar) im Fach Informatik, medizinische Informatik, Software-Entwicklung, Bioinformatik oder verwandte Fachrichtungen
• fundierte Kenntnisse in JAVA, SQL und Gitlab sowie Erfahrungen mit der Programmierung von ETL-Strecken basierend auf HL7 2.x und HL7-FHIR sowie dem Aufbau und der Kuration von Datenbanken
• Verständnis der Prozessarchitektur eines Krankenhauses im Zusammenspiel administrativer und klinischer Prozessabläufe
• von Vorteil sind gute Kenntnisse in der Gewinnung und Präanalytik von Biomaterialien sowie in der medizinischen Merkmal-orientierten Probenbestandsabfrage
• eine gewissenhafte, strukturierte und selbstständige Arbeitsweise mit gutem Zeitmanagement, Teamfähigkeit sowie kommunikativer Kompetenz
• sehr gute Deutsch- und Englischkenntnisse in Wort und Schrift

Benefits

• ein vielseitiges und interessantes Arbeitsumfeld in einem interdisziplinären Team
• Möglichkeiten zur Mitarbeit in unserem starken nationalen Partnernetzwerk (German Biobank Network)
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