Scientist/Postdoc (m/f/d) bioinformatics and data management

IT-Systemhaus der Bundesagentur für Arbeit; Kiel; Vor Ort; EUR 40.000 - 60.000; Vollzeit

Zusammenfassung

Eine führende Forschungseinrichtung in Kiel sucht einen erfahrenen Scientist/Postdoc in Bioinformatik und Datenmanagement. Diese Position richtet sich an Bewerber mit einem PhD in Bioinformatik oder verwandten Bereichen. Der ideal Kandidat hat Erfahrung in der Datenanalyse, Programmierung (Bash, Python) und einem starken Engagement für wissenschaftliche Arbeiten. Nutzen Sie diese Gelegenheit, um an internationalen Projekten mitzuwirken. Die Stelle ist auf vier Jahre finanziert und gemäß dem deutschen E13 TV-L Entgelt bezahlt.

Leistungen

Viele Mitarbeiter-Rabatte auf verschiedenen Online-Plattformen

Universitätssport und Fitness zu ermäßigten Preisen

Weitere attraktive Vorteile bei UKSH

Qualifikationen

• Promotion in Bioinformatik oder verwandten Disziplinen erforderlich.
• Erfahrung mit Next Generation Sequencing (NGS) Daten erforderlich.
• Fähigkeit, hochwertige wissenschaftliche Manuskripte zu schreiben.

Aufgaben

• Entwicklung und Durchführung origineller Forschungsfragen.
• Management von mehrschichtigen Datensätzen und Bereitstellung bioinformatischer Lösungen.
• Integration in die Forschungsagenda der CATCH ALL-Gruppe.

Kenntnisse

Kenntnisse in Linux

Programmierkenntnisse in Bash und Python

Datenmanagementfähigkeiten für NGS-Daten

Erfahrung in mathematischer/statistischer Expertise

Erfahrung in der Verarbeitung von Omics-Daten

Ausbildung

PhD in Bioinformatik, Molekularbiologie oder verwandten Bereichen

Tools

iRods

Yoda

GitHub

Jobbeschreibung

Scientist/Postdoc (m/f/d) bioinformatics and data management

Scientist/Postdoc (m/f/d) bioinformatics and data management

Arbeitsort

Kiel

Beginn

Das Universitätsklinikum Schleswig-Holstein (UKSH) verbindet internationale Spitzenforschung mit interdisziplinärer Krankenversorgung. Wir sind einziger Maximalversorger und größter Arbeitgeber des Landes. Unsere rund 17.000 Mitarbeitenden stellen eine höchst individuelle Versorgung sicher - unverzichtbar für die Menschen in Schleswig-Holstein.
Institute of Clinical Molecular Biology (IKMB)
The IKMB, together with the DFG-funded Clinical Research Unit (CRU) "CATCH ALL" and the Liquid Biomarkers group, is looking for an experienced bioinformatician with a PhD in bioinformatics, molecular biology, genetics, informatics, or a related field to join our interdisciplinary research group. The position will be hosted at the Institute of Clinical Molecular Biology (IKMB). We invite applications from experienced postdoctoral researchers who are looking for cutting-edge research opportunities in the clinical field. This position requires expertise in informatics, biology, omics and biostatistics. We expect the ideal candidate to be intensely interested, driven and dedicated with respect to our research schedule.

Start in our team
The position is available from 01.02.2026 and is funded for four years, an ideal springboard in your career ladder to prepare yourself for higher positions. The contract will be issued for 4 years.

What we offer

• The salary will be based on the German E13 TV-L scale, if terms and conditions under collective bargaining law are fulfilled
• Full-time employment, currently 38,5 hours per week; part-time employment may be compatible within the framework of certain working time models
• Many employee discounts on various online platforms and with various companies
• University sports and fitness at a company rate as a balance to work
• You can find more attractive UKSH benefits here: Benefits (uksh.de)

What you can expect

• Integration into the research agenda, both within CATCH ALL and within the Liquid Biomarkers group
• Development and Conduct of original research questions using our unique collection of medical multi-omics data
• Management of the diverse multi-level data sets in CATCH ALL and provision of bioinformatics solutions for the inherent research questions
• Data storage in our existing infrastructure (iRods and Yoda), application of pipelines and development of new bioinformatics solutions
• Opportunities to interact in EU projects such as Instand-NGS4P and EASIGEN-DS, with clinicians and researchers at the University Hospital Schleswig-Holstein, as well as with external researchers nationally and internationally

What you bring with you

• Command line use in Linux, running of cluster jobs (sbatch, nextflow, snakemake) and mathematical/statistical expertise
• Programming languages Bash and Python (incl. NumPy and Pandas), handling and uploading codes to GitHub
• Professional data management skills for Next Generation Sequencing (NGS) data and other scientific datasets (using iRods, Yoda), as well as submission management to ENA, EGA and other appropriate repositories
• Professional skills in processing omics data (scRNA, RNA, DNA etc.), and interest in spatial data
• Proven ability and dedication to write and publish high quality scientific manuscripts

We look forward to receiving your application by 06.01.2026, quoting the job number 27738.