Postdoktorandin / Postdoktorand (d/w/m) - Computational Biology / Bioinformatik – Proteomik und komplexe biologische Daten

Charité - Universitätsmedizin Berlin; Berlin; Vor Ort; EUR 52.000 - 74.000; Vollzeit

Zusammenfassung

Charité – Universitätsmedizin Berlin sucht eine/n Computational Biologist mit starkem Interesse an quantitativer Biologie und Proteomik. Der Fokus liegt auf der Generierung komplexer Proteomik-Datensätze und deren Analyse mittels neuer computergestützter Ansätze.

Sie arbeiten an Projekten mit mikrobiellen Gemeinschaften, Darmmikrobiomen und Patientenkohorten; Zusammenarbeit mit MS, Bioinformatik, Immunologie und Grundlagenforschung ist vorgesehen.

Qualifikationen

• Nachweisbare Erfahrung in Analyse von biologischen Datensätzen, insbesondere Proteomik.
• Promotion in einem quantitativen Biologiefeld ist wünschenswert.
• Gute Kenntnisse in Python und/oder R sowie statistischer Methoden.

Aufgaben

• Generierung systematischer proteomischer Datensätze im Team.
• Entwicklung von computergestützten Pipelines und Analysekonzepten für proteomische Fragestellungen.
• Datenintegration von Proteomik mit Genomik und klinischen Informationen.
• enge interdisziplinäre Zusammenarbeit mit Massenspektrometrie, Immunologie und Grundlagenforschung.

Kenntnisse

Python

R

Kommunikationsfähigkeit

Teamarbeit

Selbständiges Arbeiten

Ausbildung

Promotion in Bioinformatik

Promotion in Computationale Biologie

Promotion in Systembiologie

Tools

Massenspektrometrie

Jobbeschreibung

Wir suchen eine / einen Computational Biologist mit starkem Interesse an quantitativer Biologie und Proteomik.

Ein zentraler Schwerpunkt des Projekts liegt auf der Generierung von komplexen Proteomik-Datensätzenund deren Analyse mittels neuer computergestützter und statistischer Ansätze. Sie untersuchen, welche biologischen Prozesse auf proteomischer Ebene verändert sind und analysieren experimentelles Design, Probenkomplexität und massenspektrometrische Daten.

Für das Projekt stehen außergewöhnliche großskalige Datensätze und biologische Ressourcen zur Verfügung, darunter Proteomik-Daten aus mikrobiellen Gemeinschaften, Darmmikrobiomen und Patientenkohorten sowie Hefe-Stammsammlungen. Diese Systeme ermöglichen es, neue computergestützte Ansätze in unterschiedlichen Bereichen anzuwenden und weiterzuentwickeln - von mikrobieller Physiologie und Systembiologie bis hin zu Wirt-Mikroben-Interaktionen und entzündlichen Erkrankungen.

Ihre Aufgaben umfassen:

• Generierung systematischer proteomischer Datensätze in Teamarbeit
• Anwendung und Entwicklung von computergestützten Pipelines und Analysekonzepten für komplexe proteomische Fragestellungen
• Integration von Proteomik-Daten mit anderen biologischen Daten, z. B. Genomik-Daten und klinischen Informationen
• Enge Zusammenarbeit mit Expertinnen / Experten aus Massenspektrometrie, experimenteller Forschung, Bioinformatik, Immunologie und Grundlagenforschung

Sie werden als wissenschaftliche Mitarbeiterin / wissenschaftlicher Mitarbeiter beschäftigt: Nach §110 (4) Satz 3 sieht das BerlHG für wissenschaftliche Mitarbeitende eine angemessene Zeit innerhalb der Arbeitszeit für die eigene wissenschaftliche Weiterqualifikation vor.

• Promotion in Bioinformatik, Computationale Biologie, Systembiologie oder einem verwandten quantitativen Fachgebiet
• Erfahrung in der Analyse biologischer Datensätze, insbesondere Proteomik-Daten
• Fundierte Kenntnisse statistischer und quantitativer Methoden zur Analyse komplexer, hochdimensionaler Datensätze
• Gutes Verständnis der Grundlagen von biochemischen Methoden, u. a. Massenspektrometrie
• Gute Programmierkenntnisse in Python und/oder R
• Ausgeprägte Kommunikationsfähigkeit und Freude an interdisziplinärer Zusammenarbeit
• Fähigkeit zum selbstständigen Arbeiten und zur Zusammenarbeit über verschiedene Forschungsgruppen hinweg