Data Manager (all genders)

Universitätsklinikum Hamburg-Eppendorf (UKE); Hamburg; Vor Ort; EUR 53.400 - 82.100; Vollzeit

Benefits dieser Stelle

Zuschüsse zum Deutschlandticket

Betriebliche Altersvorsorge

Umfangreiche Fortbildungsprogramme

Familienfreundliches Arbeitsumfeld

Zusammenfassung

Das Universitätsklinikum Hamburg-Eppendorf (UKE) in Hamburg sucht einen Data Manager (m/w/d) in Digital Cardiovascular Research. Ihre Aufgaben beinhalten die Einrichtung und Pflege von Datenbanken, Verantwortung für das Datenmanagement in Cloud-Computing-Strukturen und die Koordination des Datenaustauschs.
Die Stelle ist auf drei Jahre befristet, mit einer Vergütung von 53.400 € - 82.100 € brutto jährlich, basierend auf Qualifikationen und Erfahrungen.

Wir bieten individuelle Weiterbildungsmöglichkeiten, Zuschüsse zu Jobtickets, ein familienfreundliches Arbeitsumfeld und ein gutes Mitarbeiterrestaurant.

Qualifikationen

• Technische Kompetenz in Data Science und Data Engineering.
• Erfahrung mit relationalen Datenbanken, insbesondere PostgreSQL.
• Hervorragende Kommunikationsfähigkeit in Deutsch und Englisch.

Aufgaben

• Einrichtung und Pflege des Zugriffs auf große genomische und phänotypische Datenbanken.
• Verantwortung für das Datenmanagement binnen dedizierter Cloud-Computing-Strukturen.
• Koordination des datenschutzkonformen Datenaustauschs.

Kenntnisse

Data Science

Data Engineering

Python

R

PostgreSQL

Git

GitLab

CI/CD-Pipelines

Kommunikationsfähigkeit

Ausbildung

Abgeschlossenes Hochschulstudium in Data Science, (Bio-)Informatik, (Bio-)Statistik oder verwandtem Fachgebiet

Tools

Linux

DNAnexus

All of Us Cloud

UK Biobank

SNOMED CT

LOINC

Jobbeschreibung

Abteilung/Aufgabengebiet

Wir sind das Universitätsklinikum Hamburg-Eppendorf (UKE) – und stehen für exzellente Kompetenz in Forschung, Lehre und der vollumfänglichen Gesundheitsversorgung in unseren Kliniken. Unsere rund 14.400 Mitarbeiter:innen streben jeden Tag aufs Neue danach, mit ihrem Beitrag die Welt ein bisschen gesünder zu machen.

Es ist unser Anspruch, eine der führenden Universitätskliniken zu sein – und gleichzeitig der beste Arbeitgeber unserer Branche. So glauben wir im UKE fest daran, dass erfolgreiches und erfüllendes Arbeiten im Einklang mit den persönlichen Bedürfnissen und individuellen Lebensentwürfen der Mitarbeitenden stehen sollte. Und so unterschiedlich diese sind, so vielfältig ist unser Angebot an individuellen Lösungen.

Data Manager (all genders) in Digital Cardiovascular Research in der Klinik für Kardiologie - Universitäres Herz- und Gefäßzentrum

Am Universitären Herz- und Gefäßzentrum (UHZ) des Universitätsklinikums Hamburg-Eppendorf (UKE) denken wir klinische und translationale kardiovaskuläre Forschung direkt integriert in unsere tägliche Patientenversorgung. Unser Ökosystem verbindet umfassend phänotypisierte Kohortenstudien einschließlich Biobanking, strukturierte Nachuntersuchungen und moderne computergestützte Methoden.

Die Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG) hat Dr. med. Shinwan Kany in das renommierte Emmy Noether-Programm aufgenommen. Das neu eingerichtete Forschungsprojekt befasst sich mit dem Thema „Risikostratifizierung für Vorhofflimmern und Herzschwäche bei Menschen mit seltenen Kardiomyopathie-Genvarianten mithilfe neuer Methoden“. Das Projekt zielt darauf ab, großskalige epidemiologische Daten, Cloud-Infrastrukturen und maschinelles Lernen miteinander zu verknüpfen, um prädiktive Modelle für Hochrisikopatienten zu entwickeln.

Ihre Aufgaben:

• Einrichtung und kontinuierliche Pflege des systematischen Zugriffs auf große genomische und phänotypische Datenbanken (insbesondere UK Biobank und All of Us).
• Verantwortung für das Datenmanagement sowie die Pipeline-Infrastruktur innerhalb dedizierter Cloud-Computing-Strukturen wie DNAnexus und der All of Us Cloud-Infrastruktur.
• Strukturierung und Harmonisierung der im klinischen Arbeitspaket (WP4) erhobenen Register- und Patientendaten, einschließlich der Unterstützung bei der Pflege der TRUST-Kohorte.
• Koordination des datenschutzkonformen Datenaustauschs sowie des Rechtemanagements zwischen den Postdoktorand:innen und Doktorand:innen des Teams sowie der TRUST-Gruppe.
• Konzeption und Implementierung automatisierter Pipelines zur Qualitätssicherung und KI-gestützten Anomalieerkennung in heterogenen klinischen Datensätzen.
• Etablierung einheitlicher Code-Standards und Versionskontrollverfahren zur Sicherstellung einer reproduzierbaren Datenverarbeitung im Gesamtprojekt.

Wir freuen uns auf Ihren Lebenslauf, ein Motivationsschreiben, in dem Sie Ihre Interessen im Projekt sowohl aus technischer (Infrastruktur, Cloud-Computing) als auch aus klinischer Perspektive darlegen, Referenzprojekten, die Ihre fachliche Kompetenz im Datenmanagement belegen, sowie einer Beschreibung Ihres eigenen Beitrags zu diesen Projekten, und den Kontaktdaten von vorzugsweise drei Forschern, die sich bereit erklärt haben, Referenzschreiben zu verfassen.

Die Stelle ist auf drei Jahre befristet zu besetzen. Eine Verlängerung wird angestrebt und ist im zweiten Abschnitt des Emmy Noether Projekts bereits eingeplant.

Profil/Qualifikationen

• Abgeschlossene Berufsausbildung: einschlägige IT-Fachrichtung oder abgeschlossenes Hochschulstudium: einschlägige Fachrichtung, dann Bsp: in Data Science, (Bio-)Informatik, (Bio-)Statistik oder einem eng verwandten quantitativen Fachgebiet oder gleichwertige Fähigkeiten und Erfahrungen.
• Technische Kompetenz in Data Science und Data Engineering, nachgewiesen durch eine GitHub-Präsenz, publizierte Fachbeiträge oder ein vergleichbares Projektportfolio.
• Erfahrung mit relationalen Datenbanken (z. B. PostgreSQL), Objektspeichern (z. B. MinIO) sowie Versionskontrollsystemen inklusive CI/CD-Pipelines mit Git und GitLab.
• Sicherer Umgang mit den für die Datenanalyse relevanten Programmiersprachen, insbesondere Python und R.
• Echte Neugierde für die klinische kardiovaskuläre Medizin, intrinsische Motivation, ergebnisorientiertes Arbeiten sowie ausgeprägte Fähigkeiten im Selbstmanagement.
• Hervorragende Kommunikationsfähigkeiten in Deutsch und Englisch sowie die Fähigkeit, als effektive Schnittstelle zwischen technischen und klinischen Partnern zu agieren.

Wünschenswert

• Erfahrung mit Datenstandards für klinische Studien (z. B. CDISC SDTM/ADaM) und/oder medizinischen Ontologien (SNOMED CT, LOINC).
• Nachweisbare praktische Erfahrung in der Administration von Linux-basierten Forschungsinfrastrukturen oder Workload-Automatisierung

Immunitätsstatus

Eine Einstellung ist nur möglich, wenn nach den jeweils geltenden (gesetzlichen und medizinischen) Vorgaben gegen das Masernvirus ein vollständiger Immunisierungs- bzw. Immunitätsnachweis vorliegt. Dies ist vor Beschäftigungsbeginn durch entsprechende Unterlagen (z. B. Impfausweis) nachzuweisen.

Stellenangebot und Perspektiven

• Faire und transparente Vergütung nach unserem TarifvertragTVöD/VKA (53.400 € - 82.100 €) unter Berücksichtigung von Qualifikationen und Berufserfahrung. Die Gehaltsangabe bezieht sich auf eine Vollzeitstelle mit 38,5 Wochenstunden. Die genannten Beträge sind Richtwerte und stellen kein Gehaltsversprechen dar.
• Gezielte und individuelle Weiterentwicklung auf Fach- und Projektebene ist gegeben, so bieten wir eine langfristige Perspektive in einem sinnstiftenden Umfeld
• Umfangreiche Fort- und Weiterbildungsprogramme an unsererUKE-Akademie für Bildung und Karriere
• Möglichkeiten zur Mitgestaltung unserer Personalpolitik „UKE INside“ in berufsgruppen- und hierarchieübergreifenden Projekten
• Nachhaltig unterwegs: Zuschüsse zum Deutschlandticket als Jobticket und Dr. Bike Fahrradservice; Option zum Dienstrad-Leasing
• Ausgezeichnete Gesundheits-, Präventions- und Sportangebote
• Familienfreundliches Arbeitsumfeld: Kooperation zur Kinderbetreuung, kostenlose Ferienbetreuung, Beratung für Beschäftigte mit pflegebedürftigen Angehörigen
• Krisensicherer Arbeitsplatz, sinnstiftende Tätigkeit, wertschätzendes Miteinander
• Strukturierte Einarbeitung und offener Wissensaustausch im Team
• Unser Mitarbeitenden Restaurant bietet eine reiche Auswahl an kulinarischen Angeboten; weitere Angebote gibt es in den „Health Kitchen“ Cafés und Bistros und in einem Supermarkt direkt auf dem Gelände