Senior, AI Engineer - (Imaging)

Roche Holding AG; Basel; On-site; CHF 140,000 - 210,000; Full time

Job summary

Roche Holding AG in Basel sucht einen imaging-focused Machine-Learning-Ingenieur im AI Enablement Team. Sie arbeiten eng mit Wissenschaftlern, Biologen und Software-Ingenieuren zusammen, bauen skalierbare KI/ML- und Computer-Vision-Systeme für große Bilddaten und tragen zur Beschleunigung der Therapieforschung bei.

Sie entwerfen und testen robuste Webanwendungen sowie Backend-Pipelines, entwickeln Modelle wie Zellsegmentierung und Gewebe-Analyse, arbeiten an Cloud-Infrastrukturen und MLOps,

Qualifications

• PhD oder Masterabschluss in CS, Biomedizinischer Technik oder verwandtem Fachgebiet mit Fokus auf ML und CV.
• Mehrjährige relevante Forschungserfahrung im Bereich KI/ CV (z. B. Zellsegmentierung, Gewebeanalyse).
• Tiefe Kenntnisse in ML-Theorie, Bildverarbeitung und quantitativer Bildanalyse.
• Erfahrung mit hochdimensionale Bilddaten und Cloud-Infrastruktur ist wünschenswert.

Responsibilities

• Entwerfen, entwickeln und testen robuste, skalierbare KI/ML Webanwendungen und Backend-Pipelines für Hochdurchsatz-Bilddaten.
• Entwickeln und verfeinern state-of-the-art CV-Modelle (z. B. Zellsegmentierung, Phänotypisierung, Gewebe-Segmentation).
• Aufbau von Evaluationswerkzeugen, Benchmark-Datensätze und Überwachung von Modellqualität, Robustheit und Drift.
• Entwerfen und pflegen skalierbare Cloud-Infrastrukturen und Datenpipelines für große Bilddatensammlungen.
• Beitrag zu Architektur-Entscheidungen, Code-Reviews und MLOps-Prozessen im CV-Bereich.
• Aktuelles Wissen zu CV-Technologien und Förderung einer Lernkultur im Team.

Skills

AI/ML Frameworks

Computer Vision

Kommunikation

Education

PhD oder Master in CS/biomedizinische Technik

Bachelor mit 4–7 Jahren Erfahrung

Tools

PyTorch

TensorFlow

OpenCV

MONAI

Scikit-Image

Napari

Bio-Formats

Kubernetes

AWS/GCP/Azure

Job description

Bei Roche kannst du ganz du selbst sein und wirst für deine einzigartigen Qualitäten geschätzt. Unsere Kultur fördert persönlichen Ausdruck, offenen Dialog und echte Verbindungen. Hier wirst du für das, was du bist, wertgeschätzt, akzeptiert und respektiert. Dies schafft ein Umfeld, in dem du sowohl persönlich als auch beruflich wachsen kannst. Gemeinsam wollen wir Krankheiten vorbeugen, stoppen und heilen und sicherstellen, dass jeder Zugang zur Gesundheitsversorgung hat - heute und in Zukunft. Werde Teil von Roche, wo jede Stimme zählt.

Die Position

As an imaging-focused machine learning engineer within the AI Enablement team, you will be working closely with folks that span the gamut across computational scientists, biologists, bench scientists, AI/ML experts, product leaders, software engineers, and everyone in between. Your work will help bridge scientific intuition with quantitative analysis, enable richer phenotypic analysis, and provide new multimodal capabilities across large-scale, state-of-the-art datasets. You'll build, own, and constantly improve scalable AI/ML and computer vision systems that unlock the potential of our diverse scientific imaging data (e.g., microscopy, digital pathology, biomedical imaging, etc), accelerating the discovery and development of life-changing treatments for patients.

The Opportunity

• Design, develop, and test robust, scalable, and maintainable AI/ML scientific web applications and backend pipelines tailored for high-throughput scientific imaging data processing and visualization.
• Build, evaluate, and fine-tune state-of-the-art computer vision and deep learning models (e.g., cell segmentation, cell classification, phenotypic profiling, tissue segmentation, feature extraction, and image registration) applied to biological and clinical imaging modalities.
• Build tools to evaluate AI/ML and vision model performance, establish benchmark datasets, and quantify model quality, robustness, and drift over time.
• Develop and maintain scalable cloud infrastructures and data pipelines for collecting, structuring, storing, and accessing large-scale multi-dimensional imaging datasets (e.g., OME-TIFF, Zarr, HDF5).
• Contribute to architectural decisions, code reviews, and the evolution of engineering and MLOps processes for computer vision models.
• Stay up-to-date with emerging computer vision technologies and industry best practices while promoting a culture of continuous learning, collaboration, and curiosity.

Who You Are

• PhD, Master's with 3-5 years, or Bachelor's with 4-7 years experience with a degree in Computer Science, Biomedical Engineering, Electrical Engineering, Computational Biology, or a related technical field with focus on machine learning engineering and computer vision.
• Strong proficiency with AI/ML frameworks and computer vision libraries (e.g., PyTorch, TensorFlow, OpenCV, MONAI, Scikit-Image, torchvision, Napari, or Bio-Formats).
• Deep expertise in computer vision algorithms (e.g., CNNs, Vision Transformers, UNet, SAM/Segment Anything, Cellpose).
• Expert knowledge of machine learning theory, image processing fundamentals, object detection, instance segmentation, and quantitative image analysis.
• Demonstrated experience working with high-dimensional scientific imaging data (e.g., fluorescence/brightfield microscopy, digital pathology whole slide images, high-content screening, multiplexed imaging, etc).
• Experience with Kubernetes, relational databases, NoSQL databases, object storage, and cloud-native architectures in public clouds (ideally AWS).
• Excellent communication skills and ability to build trusted partnerships with scientific collaborators, bioimage analysts, and cross-functional teams.
• Experience with multi-modal data fusion (combining scientific imaging with genomics, transcriptomics, or clinical tabular data) or in a pharma/biotech research environment.
• Experience with workflow automation, GenAI, Vision-Language Models, and/or AI agents.

Wer wir sind

Eine gesündere Zukunft treibt uns zur Innovation an. Mehr als 100.000 Mitarbeiter weltweit arbeiten gemeinsam daran, wissenschaftliche Fortschritte zu erzielen und sicherzustellen, dass jeder Zugang zur Gesundheitsversorgung hat - heute und für zukünftige Generationen. Durch unser Engagement werden über 26 Millionen Menschen mit unseren Medikamenten behandelt und mehr als 30 Milliarden Tests mit unseren Diagnostik-Produkten durchgeführt. Wir ermutigen uns gegenseitig, neue Möglichkeiten zu erkunden, Kreativität zu fördern und hohe Ziele zu setzen, um lebensverändernde Gesundheitslösungen zu liefern.

Gemeinsam können wir eine gesündere Zukunft gestalten.

Roche ist ein Arbeitgeber, der die Chancengleichheit fördert.