De la séquence à la clinique - amélioration du diagnostic de leucémie par l’utilisation de séquençage de 3e génération

Centre de Recherche Azrieli du CHU Sainte-Justine (Université de Montréal); Montreal; On-site; CAD 24,000 - 42,000; Full time

Job summary

Centre de Recherche Azrieli du CHU Sainte-Justine (Université de Montréal) explore l’amélioration du diagnostic de leucémie par le séquençage de 3e génération et l’intégration multi-omique. Le sujet se base sur des données de séquençage de nouvelle génération et vise des cohortes pédiatriques en oncologie.

Le poste requiert un doctorat et des compétences en analyse de données, avec engagement envers une recherche translationnelle et des collaborations inter-équipes.

Qualifications

• Doit posséder un doctorat pertinent et des compétences en analyse de données multi-omiques.
• Solides compétences en interprétation biologique des données et en autonomie.
• Capacité à travailler sur des projets complexes et transverses.

Responsibilities

• Analyser et caractériser des profils génomiques, épigénomiques, transcriptomiques et épitranscriptomiques.
• Collaborer avec l'équipe et rédiger des rapports techniques.
• Contribuer à l’intégration des données et au suivi des projets.

Skills

Analyse informatique

Interprétation biologique

Autonomie

Education

Doctorat en sciences biomédicales

Tools

Nanopore sequencing

Job description

De la séquence à la clinique - amélioration du diagnostic de leucémie par l’utilisation de séquençage de 3e génération

Réf ABG-140524 Sujet de Thèse

13/10/2026 Autre financement public

Centre de Recherche Azrieli du CHU Sainte-Justine (Université de Montréal)

Lieu de travail Montréal - Canada

Intitulé du sujet De la séquence à la clinique - amélioration du diagnostic de leucémie par l’utilisation de séquençage de 3e génération

Champs scientifiques

• Biotechnologie
• Santé, médecine humaine, vétérinaire
• Science de la donnée (stockage, sécurité, mesure, analyse)

Mots clés Séquençage, leucémie, translation, bio-informatique, analyse de données

Description du sujet

Dans une optique d’amélioration de la trajectoire des patients, un vaste projet de recherche reposant sur des données de séquençage de nouvelle génération est en cours. Celui-ci comporte de nombreuses sous-questions auxquelles répondre et plusieurs autres projets pourraient venir s’y greffer en fonction des données générées et des besoins évolutifs du laboratoire.

Séquençage de l’(épi)génome et de l’(épi)transcriptome par Nanopore Grâce à d’importantes subventions de recherche, le laboratoire génère actuellement des données de séquençage du génome et du transcriptome pour une vaste cohorte de patients en oncologie, en utilisant la technologie Nanopore. Cette approche permet le séquençage simultané des modifications des acides nucléiques. Ainsi, les génomes obtenus inclus l’épigénome et les transcriptomes obtenus inclus l’épitranscriptome. Les personnes retenues seront amenées à effectuer l’analyse et la caractérisation de ces profils génomique, épigénomiques, transcriptomiques et épitranscriptomiques à des fins diagnostiques et pour divers sous-groupes de cancer pédiatrique, similairement aux travaux de doctorat du Dr Lavallée.

Prise de fonction :

Nature du financement

Autre financement public

Précisions sur le financement

Fonds de recherche du superviseur

Présentation établissement et labo d'accueil

Centre de Recherche Azrieli du CHU Sainte-Justine (Université de Montréal)

Le laboratoire du Dr Lavallée s’efforce de mieux comprendre les anomalies génomiques menant au cancer, dans le but d’accélérer le diagnostic chez les patients atteints. Pour ce faire, il recourt à des technologies de pointe telles que le séquençage utilisant la technologie Nanopore. Le laboratoire bénéficie également d’un riche ensemble de données multi-omiques, générées au cours des dernières années par séquençage du génome et du transcriptome, tant en mode conventionnel qu’à l’échelle unicellulaire. L’intégration de ces approches permet de révéler avec une précision accrue la diversité cellulaire et génomique caractéristique des leucémies.

Doctorat en Sciences biomédicales, biochimie, bio-informatique ou biologie moléculaire

Pays d'obtention du doctorat

Etablissement délivrant le doctorat

Université de Montréal

Profil du candidat

• Un intérêt pour l’analyse informatique et l’interprétation biologique de données est nécessaire.
• La personne recrutée devra être en mesure de travailler de façon autonome et en recherchant le soutien nécessaire auprès des ressources disponibles au sein du laboratoire.

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