Gespecialiseerd medewerker moleculaire biologie en next-generation sequencing

UAntwerpen - Campus Drie Eiken; Wilrijk; On-site; EUR 30,000 - 45,000; Full time

Job summary

De Universiteit Antwerpen zoekt een voltijds gespecialiseerd medewerker in het domein moleculaire biologie en next-generation sequencing. Je neemt de dagelijkse technische werking van het MuciRNA service sequencing platform waar en draagt bij aan de uitbouw van een organoïden biobank.

Taken omvatten RNA-extracties, kwaliteitscontroles, bereiding van DNA libraries voor targeted long-read RNA sequencing en sequencing op het Oxford Nanopore GridION platform.

Qualifications

• Vakkennis van moleculaire biologie en sequencing gewenst.
• Ervaring met biobank-werk is een plus.
• Nauwkeurige documentatie en kwaliteitsbewaking vereist.

Responsibilities

• Dagelijkse technische werking van het MuciRNA service sequencing platform beheren.
• RNA-extracties uitvoeren en kwaliteitscontroles uitvoeren.
• DNA libraries voorbereiden voor long-read sequencing en data overdracht coördineren.
• sequencing op Oxford Nanopore GridION en dataafstemming met bio-informaticus.
• Organisaties van patiëntafhankelijke organoïden biobank ondersteunen.

Job description

De Universiteit Antwerpen is een dynamische, toekomstgerichte universiteit. We bieden vernieuwend academisch onderwijs aan meer dan 20000 studenten, verrichten baanbrekend wetenschappelijk onderzoek en spelen een belangrijke dienstverlenende rol in de maatschappij. Met meer dan 6000 medewerkers uit 100 verschillende landen bouwen we dagelijks aan de wereld van morgen. Samen verleggen we grenzen en geven we de richting aan. De richting van de toekomst. En die kan jij mee bepalen.

De Faculteit Geneeskunde en Gezondheidswetenschappen/ onderzoeksgroep Laboratorium voor Experimentele Geneeskunde en Pediatrie van de Universiteit Antwerpen zoekt een voltijds (100 %) gespecialiseerd medewerker in het domein moleculaire biologie en next-generation sequencing.

Functie

De functie omvat onder andere volgende opdrachten:

• Je staat in voor de dagelijkse technische werking van het MuciRNA service sequencing platform (mucirna.com) binnen het Laboratorium voor Experimentele Geneeskunde en Pediatrie (LEMP), verbonden aan de Faculteit Geneeskunde en Gezondheidswetenschappen. Je plant en voert sequencing opdrachten uit in overleg met de betrokken onderzoekers. Daarnaast werk je ook mee aan de uitbouw van een organoïden biobank.
• Je verwerkt humane patiëntenstalen, waaronder bloed en weefsel, en voert RNA-extracties en kwaliteitscontroles Je bepaalt de RNA-concentratie en integriteit en beoordeelt of de stalen voldoen aan de vereisten voor verdere verwerking.
• Je bereidt DNA libraries voor targeted long-read RNA sequencing met behulp van manuele en geautomatiseerde workflows.
• Je voert sequencing uit op het long-read Oxford Nanopore GridION sequencing platform. Je controleert de technische kwaliteit en stemt de overdracht van sequencing data af met de betrokken bio-informaticus.
• Je werkt mee aan het opzetten, kweken en onderhouden van patiëntafgeleide organoïden uit humane weefselstalen.
• Je staat in voor het biobanken van humane patiëntenstalen en organoïden, waaronder correcte verwerking, labeling en opslag van de stalen en registreert de staalgegevens en opslaglocaties nauwkeurig in
• Je documenteert de uitgevoerde experimenten en de resultaten van kwaliteitscontroles. Je signaleert technische problemen en afwijkingen en werkt mee aan oplossingen en verbeteringen van de workflow.
• Je verzorgt de logistieke ondersteuning van het platform. Je beheert de voorraad reagentia en verbruiksmaterialen, volgt verbruik en houdbaarheid op en plaatst tijdig bestellingen.
• Je voert de werkzaamheden uit volgens de geldende juridische, ethische, deontologische en veiligheidsprocedures, met bijzondere aandacht voor bioveiligheid, de verwerking van humane stalen en de correcte afvoer van laboratoriumafval.

Bij het realiseren van de doelstellingen hou je rekening met de voorziene instructies en de regelgeving.