Postdoctoral Fellow: CNS Single-Cell & Spatial Omics

Karolinska Institutet; Solna kommun; On-site; SEK 469,000 - 625,000; Full time

Job summary

Karolinska Institutet söker en postdoktor inom encellsomik och spatial omik kopplad till CNS-utveckling och sjukdom. Du kommer att designa och genomföra storskaliga analyser av enradiga och lokala omikdata och samarbeta tätt med experimentella forskare.

Vi söker en drivande forskare med stark bakgrund inom bioinformatik, beräkningsbiologi och genomik som kan leda data‑drivna projekt och bidra till utvecklingen av nya analysmetoder och modeller.

Qualifications

• Doktorsexamen krävs eller motsvarande bedömning.
• Dokumenterad erfarenhet av analys av enskilda cellers RNA-seq-data.
• Erfarenhet av analys av spatiala omikdata och integrering av multi-omikdata.

Responsibilities

• Analysera data från single-cell RNA-seq och spatial omik för CNS-utveckling och sjukdom.
• Integrera data över prover, utvecklingsstadier och sjukdomstillstånd.
• Identifiera celltillstånd, utvecklingsbanor och regulatoriska program.
• Utveckla och underhålla reproducerbara analysworkflows och pipelines.
• Samarbeta nära experimentella forskare och tolka resultat i biologiska sammanhang.
• Delta i studiedesign och data‑dvisualisering samt skriva forskningsmanuskript.

Skills

RNA-seq analys

Spatial transkriptomik

R eller Python

Data integration

Beräkningsmetoder

Engelska kommunikation

Education

Doktorsexamen i bioinformatik/beräkningsbiologi/genomik

Tools

R

Python

HPC

Job description

Karolinska Institutet söker en postdoktor inom encellsomik och spatial omik kopplad till CNS-utveckling och sjukdom. Du kommer att designa och genomföra storskaliga analyser av enradiga och lokala omikdata och samarbeta tätt med experimentella forskare.

Vi söker en drivande forskare med stark bakgrund inom bioinformatik, beräkningsbiologi och genomik som kan leda data‑drivna projekt och bidra till utvecklingen av nya analysmetoder och modeller.