Doktorand i bioinformatik och evolutionär mikrobiologi

Uppsala Universitet; Uppsala kommun; On-site; SEK 335,000 - 402,000; Full time

Job summary

Uppsala universitet söker en mycket motiverad doktorand till projektet om en två miljarder år lång historia av infektioner och värdanpassning hos tidiga gammaproteobakterier. Anställningen är tidsbegränsad och heltid vid Biomedicinskt centrum i Uppsala, med bred internationell forskningsmiljö.

Arbetet innefattar att samla genomdata, rekonstruera evolutionen, undersöka horisontell genöverföring och analysera gemensamma egenskaper hos DIG och Legionella under ledning av projektet finansierat av

Qualifications

• Behörig till utbildning på forskarnivå inom relevanta områden.
• Dokumenterade programmeringskunskaper i Python eller R.
• Kunskap om metagenomik och molekylär evolution.

Responsibilities

• Samla in DIG-genom och rekonstruera evolutionär historia.
• Bedöma metabola potential och identifiera Gener för värdanpassning.
• Analysera HR evolutionen inom Legionella och Tillhörande släkten.

Skills

Python

R

Metagenomik

Molekylär evolution

Education

Avancerad examen i bioinformatik

240 hp med 60 hp på avancerad nivå inkl. självständigt arbete

Tools

HPC-pipelines

Job description

Uppsala universitet söker en mycket motiverad doktorand till projektet om en två miljarder år lång historia av infektioner och värdanpassning hos tidiga gammaproteobakterier. Anställningen är tidsbegränsad och heltid vid Biomedicinskt centrum i Uppsala, med bred internationell forskningsmiljö.

Arbetet innefattar att samla genomdata, rekonstruera evolutionen, undersöka horisontell genöverföring och analysera gemensamma egenskaper hos DIG och Legionella under ledning av projektet finansierat av