Doctoral student in Multiomics Machine Learning Cancer Bioinformatics

Kungliga Tekniska högskolan; Stockholms kommun; On-site; SEK 391,000 - 469,000; Full time

Job summary

KTH söker en doktorand vid labbet vid KTH/SciLifeLab i Solna som fokuserar på precisionsmedicin och cancerbioinformatik. Projektet omfattar datadrivna analyser, multi-omik integration och maskininlärning i samarbete med kliniska forskare.

Handledare är Assist Prof. Arian Lundberg och Prof. Cecilia Williams; antagning beslutas vid slutgiltig urvalsprocess. Kraven inkluderar grundläggande behörighet, masterexamen i bioinformatik eller relaterat område samt kunskaper i Bash, R och Python.

Qualifications

• Doktorandkandidaten måste ha grundläggande behörighet och minst 240 högskolepoäng.
• Starka kunskaper inom cancerbiologi och cancerdata.
• Masterexamen inom bioinformatik, beräkningsbiologi eller relaterade cancerområden.
• Färdigheter i Bash, R och Python är viktiga för dataanalys.
• Två akademiska eller forskningsreferenser krävs, varav minst en ska vara en chefsreferens.

Skills

Bash

R

Python

Engelska kommunikation

Education

Masterexamen inom bioinformatik

Tools

HPC

Job description

Doktorand inom multiomik, maskininlärning och cancerbioinformatik

Kungliga Tekniska högskolan, Skolan för kemi, bioteknologi och hälsa

Projektbeskrivning

Forskarutbildningsämne: BIO Biotechnology – Cancer bioinformatik

Vi söker en motiverad doktorand till vårt lab vid KTH/SciLifeLab i Solna där vi fokuserar på precisionsmedicin och cancerprogression. Projektet omfattar datadrivna analyser, multi-omika dataintegration och maskininlärning metoder med kliniska forskare för att överbygga grundforskning med patientutfall. Projektet passar särskilt bra för kandidater med bakgrund inom maskinlärning, bioinformatik, speciellt med utbildning och erfarenhet av att jobba med cancerrelevanta data och cancerbiologi.

Handledning: Assist Prof. Arian Lundberg och Prof. Cecilia Williamsföreslås handleda doktoranden. Beslut tas vid antagning

Behörighet för antagning

För att bli antagen till forskarutbildning (kap 7 39 § högskoleförordningen) krävs att den sökande har grundläggande behörighet:

• fullgjort kursfordringar om minst 240 högskolepoäng, varav minst 60 högskolepoäng på avancerad nivå, eller
• på något annat sätt inom eller utom landet förvärvat i huvudsak motsvarande kunskaper.
• starka kunskaper inom cancerbiologi, särskilt tumörfrämjande inflammation och cancerprogression.
• masterexamen inom bioinformatik, beräkningsbiologi eller relaterade cancer områden.
• färdigheter i Bash, R och Python är viktiga för dataanalys och bioinformatikuppgifter.
• förmåga att arbeta självständigt och i en samarbetsinriktad teammiljö.
• stark kommunikationsförmåga för att presentera resultat och samarbeta med andra.
• två akademiska eller forskningsrelaterade referenser krävs, varav minst en ska vara en chefsreferens.

För att lyckas med dina doktorandstudier på KTH behöver du vara målinriktad och ihärdig i ditt arbete. Vid urval av de sökande bedöms förmågan att:

• självständigt driva sitt arbete framåt,
• kunna samarbeta med andra,
• ha ett professionellt förhållningssätt och
• analysera och arbeta med komplexa frågor.
• starka problemlösningsförmågor och noggrannhet.
• arbeta självständigt, med förmåga att ta initiativ och hantera flera uppgifter samtidigt.
• erfarenhet av tvärvetenskaplig forskning och ett intresse för att samarbeta med forskare från olika områden.
• god förståelse för vetenskaplig litteratur och förmåga att förstå och analysera komplex information.
• erfarenhet av maskininlärning och multiomik integration.
• färdigheter i ytterligare programmeringsspråk, bioinformatikpipelines eller verktyg är meriterande.
• erfarenhet av att arbeta med kliniska- eller cancer patientdata är fördelaktigt.
• erfarenhet av High Performance Computing (HPC) är meriterande.
• en solid cancerforskning är att föredra.
• goda kommunikativa färdigheter på engelska, både skriftligt och muntligt då det krävs i det dagliga arbetet.

Information om antagning och anställning

Endast den som antagits till forskarutbildning får anställas som doktorand. Den sammanlagda anställningstiden får inte vara längre än vad som motsvarar utbildning på forskarnivå på heltid under fyra år. En anställd doktorand kan i begränsad omfattning (högst 20 %) utföra vissa arbetsuppgifter inom t.ex. utbildning och administration. En ny anställning som doktorand gäller för högst ett år, anställningen får därefter förnyas med högst två år i taget.

Bli en del av KTH

KTH formar framtiden genom utbildning, forskning och innovation. Som ett ledande internationellt tekniskt universitet spelar vi en aktiv roll i att driva och medverka i omställningen till ett hållbart samhälle. Här erbjuds du möjligheten att växa och utvecklas på en kreativ och dynamisk arbetsplats med goda arbetsvillkor och förmåner. Jämställdhet, mångfald och lika villkor är en kvalitetsfråga och en självklar del av KTH:s värdegrund som universitet och statlig myndighet.

Löneform Månadslön enligt KTH:s avtal för doktorandlöner

Antal lediga befattningar

Sysselsättningsgrad

Referensnummer