Postdoktor i fotobiokatalyse og AI-basert proteindesign

Norwegian University of Life Sciences; Ås; On-site; NOK 605,000 - 797,000; Full time

Job summary

Norges miljø- og biovitenskapelige universitet (NMBU) i Ås søker en postdoktor innen fotobiokatalyse og design av nye enzymer. Prosjektet innebærer å utvikle proteiner som bruker lys til å drive mekanismer i vann under milde betingelser.

Du vil arbeide tverrfaglig fra molekylærbiologi til krystallografi og beregningsarbeid, og bidra i hele design-til-test-kjeden. Arbeidet krever dokumentert erfaring og et sterkt ønske om å lære resten.

Qualifications

• Doktorgrad innen kjemi, biokjemi eller strukturbiologi, med erfaring fra beregningskjemi eller tilsvarende fagområde.
• Dokumentert erfaring med biokjemisk og molekylærbiologisk laboratoriearbeid, inkludert kloning, rekombinant proteinekspresjon og proteinrensing.
• Dokumentert erfaring med røntgenkrystallografi av proteiner og med spektroskopiske metoder.
• Dokumentert erfaring med beregningsorienterte metoder og bruk av AI-baserte modeller på HPC-klynger.
• God fremstillingsevne på engelsk, skriftlig og muntlig.

Responsibilities

• Designe nye kofaktorbindende proteiner med generative AI-modeller og kvantekjemiske modeller av aktive seter.
• Klone, uttrykke og rense designede proteinvarianter.
• Måle kofaktorbinding, fotostabilitet, aktivitet og selektivitet med UV-vis, LC-MS og NMR under kalibrerte lysforhold, og påvise radikalintermediater med EPR.
• Krystallisere designede proteiner, samle inn diffraksjonsdata ved synkrotron og bestemme og tolke strukturer.
• Publisere og presentere resultater internasjonalt, og medveilede master- og doktorgradsstudenter

Skills

Kjemi og biokjemi

Proteinkjemi

Beregning/AI på HPC

Laboratoriearbeid

Engelsk kommunikasjon

Education

Doktorgrad innen kjemi/biokjemi/strukturbiologi

Tools

X-ray krystallografi

Proteinuttrykk og rensing

HPC-klynger

AI-baserte modeller

LC-MS / NMR / UV-Vis

Job description

Om stillingen

Ved Fakultet for kjemi, bioteknologi og matvitenskap (KBM) ved NMBU er det ledig stilling som postdoktor innen fotobiokatalyse og design av nye enzymer. Stillingen er en åremålsstilling med varighet 3 år, finansiert av KBM/NMBU.

Kan lys brukes til å drive kjemiske reaksjoner som i dag krever sjeldne metaller og organiske løsemidler? Vi søker en postdoktor som vil designe helt nye enzymer som gjør nettopp det. Du blir sentral i et prosjekt der vi bygger proteiner som ikke finnes i naturen, utstyrer dem med lysaktive kofaktorer og bruker dem til selektive reaksjoner i vann under milde betingelser.

Vi bruker kvantekjemi til å definere hvordan kofaktor og substrat må plasseres for at lysdrevet elektron- eller hydrogenoverføring skal skje, genererer hele proteiner rundt disse geometriene med generative AI-modeller, og måler deretter designene i laboratoriet under nøye kalibrert lys. Resultatene går tilbake inn i neste designrunde.

Du vil arbeide gjennom hele denne kjeden, fra molekylærbiologi og proteinkjemi til krystallografi, spektroskopi og beregningsarbeid. Vi forventer ikke at du er like sterk på alt fra dag én, men du må ha dokumentert erfaring fra flere av områdene og et reelt ønske om å lære resten.

Du får tilgang til et godt utstyrt laboratorium med robotisert kloning og rensing, LC-MS, UV-vis, EPR, krystalliseringsoppsett og regelmessig synkrotronstråletid ved MAX IV og ESRF. Beregningsarbeidet kjøres på Sigma2-infrastrukturen. Stillingen er knyttet til kjemiseksjonen ved KBM, og du samarbeider tett med fagmiljøer innen organisk syntese, proteinteknologi og spektroskopi.

Stillingen kan forlenges til maksimalt 4 år med undervisning.

Arbeidsoppgaver

• Designe nye kofaktorbindende proteiner med generative AI-modeller og kvantekjemiske modeller av aktive seter.
• Klone, uttrykke og rense designede proteinvarianter.
• Måle kofaktorbinding, fotostabilitet, aktivitet og selektivitet med UV-vis, LC-MS og NMR under kalibrerte lysforhold, og påvise radikalintermediater med EPR.
• Krystallisere designede proteiner, samle inn diffraksjonsdata ved synkrotron og bestemme og tolke strukturer.
• Publisere og presentere resultater internasjonalt, og medveilede master- og doktorgradsstudenter

Tilsetting i postdoktorstilling har som hovedmål å kvalifisere for arbeid i vitenskapelige førstestillinger.Det kreves oppnådd doktorgrad for tilsetting.

Kompetanse

Det kreves

• Doktorgrad innen kjemi, biokjemi eller strukturbiologi, med erfaring fra beregningskjemi eller tilsvarende fagområde
• Dokumentert erfaring med biokjemisk og molekylærbiologisk laboratoriearbeid, inkludert kloning, rekombinant proteinekspresjon og proteinrensing
• Dokumentert erfaring med røntgenkrystallografi av proteiner og med spektroskopiske metoder.
• Dokumentert erfaring med beregningsorienterte metoder og bruk av AI-baserte modeller på HPC-klynger.
• God fremstillingsevne på engelsk, skriftlig og muntlig

Søkere som har levert doktoravhandlingen til vurdering innen søknadsfristen kan søke, men doktorgraden må være oppnådd før tiltredelse.

Ønskede kvalifikasjoner

• Erfaring med generativ proteindesign og all-atom strukturprediksjon.
• Erfaring med kvantekjemiske beregninger, molekyldynamikk eller QM/MM-metoder.
• Erfaring med metalloproteiner, redoksenzymer, flavoproteiner eller fotokjemi.
• Erfaring med enzymkinetikk, LC-MS-basert produktanalyse eller laboratorieautomasjon.

Personlige egenskaper

• Faglig nysgjerrighet og evne til å arbeide på tvers av eksperimentelle og beregningsorienterte metoder
• Evne til å ta initiativ og arbeide systematisk og effektivt, både selvstendig og i team
• Gode kommunikasjons- og formidlingsevner, og bidrar til et godt arbeidsmiljø

Lønns- og tilsettingsvilkår og nærmere opplysninger

Stillingen innplasseres i stillingskode 1352 Postdoktor (NOK 604900 - 796600) avhengig av kvalifikasjoner. For særlig godt kvalifiserte søkere kan høyere lønn vurderes. Ansiennitetsopprykk i stillingen.

Fra lønnen trekkes 2 prosent lovfestet innskudd til Statens pensjonskasse.

Interessert i å vite mer om stillingen? Vi forteller deg gjerne mer om vår hverdag.Ta kontakt med førsteamanuensis Åsmund Røhr Kjendseth, tlf: [phone], e-post:[e-mail].

Generell informasjon til søkere

Om Fakultet for kjemi, bioteknologi og matvitenskap

Fakultet for kjemi, bioteknologi og matvitenskap (KBM) er lokalisert på Ås, ca. 30 minutter med tog, buss eller bil fra Oslo, på den staselige campusen til Norges miljø- og biovitenskapelige universitet (NMBU), som er omgitt av et av de største og vakreste parkanlegg i Norge. KBM er et naturvitenskapelig fakultet, med undervisning, forskning, formidling og oppdragsforskning, som hovedsakelig fokuserer på mat.

Fakultetet har aktive forskningsgrupper innen ernæring, matvitenskap, mat-teknologi og matkvalitet, kjemi og biokjemi, mikrobiologi og mikrobiell genteknologi, bioinformatikk og statistikk. KBM har omtrent 160 ansatte, inkludert 50 doktorgradsstudenter. I tillegg har KBM ca. 500 bachelor- og masterstudenter. Fakultetet har en sterk forskningskultur, noe som gjenspeiles i våre utdanningsprogrammer.

Norges miljø- og biovitenskapelige universitet (NMBU)

NMBU skal bidra til å sikre fremtidens livsgrunnlag gjennom fremragende forskning, utdanning, formidling og innovasjon. Vi har landets mest fornøyde universitetsstudenter, som får forskningsbasert utdanning i et unikt studentmiljø. Våre kandidater får med seg høy kompetanse på tverrfaglig samarbeid og er populære i arbeidsmarkedet.

NMBU har internasjonalt ledende forskningsmiljøer innen flere fag. Sammen med våre partnere i samfunns- og næringslivet bidrar vi til å løse noen av de største samfunnsutfordringene i vår tid. Vi satser på innovasjon, formidling og entreprenørskap fordi vi mener disse utfordringene best løses med felles innsats.

Vi mener at et godt arbeidsmiljø preges av mangfold. Vi oppfordrer kvalifiserte kandidater til å søke uavhengig av kjønn, funksjonsevne, kulturell bakgrunn eller om du har vært utenfor arbeidslivet en periode. Vi vil legge arbeidsplassen til rette for personer med nedsatt funksjonsevne.

Nærmere opplysninger om NMBU finnes på www.nmbu.no