Forsker II innen mikrobiell genomikk

Karlstad University; Oslo; On-site; NOK 604,000 - 760,000; Full time

Job summary

En forskningsinstitusjon i Oslo søker en forsker for å utføre bioinformatisk og laboratoriearbeid. Stillingen er for to år med varighet; key ansvarsområder inkluderer design av laboratorieeksperimenter og utforskning av komparativ genomikk. Vi ser etter en kandidat med doktorgrad innen molekylær mikrobiologi eller beslektede felt, og solid erfaring med vitenskapelig skriving. Konkurransedyktig lønn tilbys.

Benefits

Gode velferdsordninger

Muligheter for faglig utvikling

Qualifications

• Doktorgrad innen molekylær mikrobiologi, bioinformatikk, biomedisin, biostatistikk eller biologi.
• Dokumentert erfaring med vitenskapelig publisering.
• Selvstendig arbeidserfaring.

Responsibilities

• Designe og utføre laboratorieeksperimenter.
• Utføre komparativ genomikk og strukturell modellering.
• Gjennomføre bioinformatisk og laboratoriearbeid med samarbeidspartnere.

Skills

Bioinformatisk scripting i R

Komparativ genomikk

Vitenskapelig skriving

Biostatistiske metoder

Evolusjonær forståelse

Education

Doktorgrad innen molekylær mikrobiologi eller beslektede felt

Tools

Bioinformatikkverktøy

Job description

Ønsket tiltredelse er så snart som mulig og innen 31.12.2025. Stillingen har en varighet på to år. I tillegg til OsloMet vil forskeren utføre bioinformatisk og laboratoriearbeid med samarbeids-partnere ved Universitetet i Oslo, Folkehelseinstituttet og Oslo Universitetssykehus.

Vi søker deg som kan styrke forskningen vår internasjonalt og som har evner for interdisiplinært arbeid som inkluderer vitenskapelig skriving, evolusjonær tolkning, bioinformatikk og særlig KI-drevet strukturell biologi.

Forskningsprosjektet «Resiliens i seksuelle bakterier» går ut på å teste hypotesen at sex ble utviklet i to store bakteriefamilier under seleksjon for resiliens og antibiotikaresistens. Familiene Neisseriaceae ogPasteurellaceae har genomiske spor av sex som vi studerer bioinformatisk og eksperimentelt. Det er behov for bedre forstå koblingen mellom genomisk distribusjon av disse sporene og horisontal genoverføring i evolusjonær tid. Du vil designe og utføre laboratorieeksperimenter, utføre komparativ genomikk, strukturell modelering og biostatistikk for å søke forståelse av en fascinerende biologisk prosess. Relevante vitenskapelige artikler i PubMed: PMID: 27619692, PMID:40338866 og PMID: 40338866.

• bioinformatisk scripting for KI-drevet studie av proteinstrukturer
• teste prediksjoner eksperimentelt i laboratoriet
• anvende og utvikle bioinformatiske verktøy og biostatistikk
• dekonstruksjon av eksisterende genklassifiseringssystemer og taksonomi
• doktorgrad innen molekylær mikrobiologi, bioinformatikk, biomedisin, biostatistikk eller biologi. Ph.d.-kandidater som har levert og fått ph.d avhandlingen godkjent uten å ha disputert, kan søke, men vil da bli ansatt som forsker III.
• dokumentert erfaring i vitenskapelig publiserte artikler med bioinformatisk scripting i R og biostatistiske metoder

Generelle kriterier fremgår i Statens personalhåndbok (SPH) 5.7.2 §1-8.

• ekspertkunnskap og erfaring med komparativ genomikk og mikrobiologi
• erfaring med vitenskapelig skriving og inngående evolusjonær forståelse
• oppdatert kunnskap om generelle evolusjonære drivere og modeller
• erfaring med veiledning av mastergradsstudenter
• arbeider selvstendig og strukturert, med evne til å gjennomføre oppgaver på en effektiv og pålitelig måte
• har god organiseringsevne, særlig med tanke på håndtering og systematisering av store datamengder
• forskningserfaring i internasjonal forskningsfront
• mulighet for faglig videreutvikling i et kreativt fag- og forskningsmiljø i samarbeid med internasjonale institusjoner
• muligheter for profesjonell utvikling og erverv av veiledningskompetanse
• gode velferdsordninger og et omfattende tilbud av aktiviteter
• låne- og pensjonsbetingelser i Statens pensjonskasse

Stillingen lønnes iht til Hovedtariffavtalene i staten og OsloMets lønnspolitikk i 1009 forsker II tilsvarende kroner 604.900 – 759.100 per år. Fra lønnen trekkes 2% pensjonsinnskudd til Statens pensjonskasse (SPK). For spesielt kvalifiserte søkere kan høyere lønn vurderes.

• CV, attester og alle sider av vitnemål
• gjerne to referanser med kontaktinformasjon