PhD optimalisatie van bloedplasmabereiding voor EV-gebaseerde kankerdiagnostiek

Komwerkeninzorgenwelzijn; Amsterdam; On-site; EUR 36,000 - 45,000; Full time

Benefits offered by this job

8,3% eindejaarsuitkering

194,4 uur vakantie per jaar

100% OV-vergoeding

Reiskostenvergoeding 0,21 €/km (max 40

Fietsregeling

BeFrank pensioen

Job summary

Amsterdam UMC Research BV zoekt een gemotiveerde promovendus binnen het Amsterdam Vesicle Center (AVC) om onderzoek te doen naar EV-gebaseerde diagnostiek voor kanker. Je ontwikkelt methoden voor plasma-analyse en draagt bij aan validatie binnen het Secret-omics consortium.

Je werkt samen met clinici en industriële partners, met dagelijkse begeleiding en mogelijkheden voor wetenschappelijke uitwisseling. Het project biedt uitstekende kansen op lange termijn in klinische biomarkerontwikkeling.

Qualifications

• Masterdiploma in biomedische wetenschappen, (bio)medische laboratoriumwetenschappen, moleculaire of cellulaire biologie.
• Sterke interesse in biomarkeronderzoek en de biologie van extracellulaire vesikels.
• Ervaring met technieken zoals celkweek, flowcytometrie of biochemische assays.
• Analytische en organisatorische vaardigheden; uitstekende beheersing van Engels.

Responsibilities

• Methoden ontwikkelen om de kwaliteit van bloedplasma te beoordelen en de aanwezigheid van resterende bloedcellen en hemolyse te evalueren.
• Onderzoeken hoe pre-analytische variabelen de plasma- en EV-samenstelling beïnvloeden.
• Ontwerpen en optimaliseren van experimentele protocollen voor bereiding en opslag van bloedplasma met behoud van het EV-secretome.
• Beoordelen van monsters uit klinische biobanken en vaststellen van inclusie-/exclusiecriteria voor biomarkeranalyses.
• Ontwikkelen en valideren van gestandaardiseerde testsamples binnen het Secret-omics consortium.

Skills

Flowcytometrie

Celkweek

Biochemische assays

Analytische vaardigheden

Samenwerkend / teamgericht

Education

Masterdiploma in biomedische wetenschappen / medische laboratoriumwetenschappen / moleculaire of cellulaire biologie

Job description

Wil jij methoden ontwikkelen om de bereiding van bloedplasma voor analyse van extracellulaire vesikels (EVs) bij kanker te verbeteren? Draag bij aan betrouwbare detectie van tumor EVs en aan de ontwikkeling van bloedtesten die kunnen helpen bij het selecteren van de juiste kankerbehandeling.

Bij de keuze voor een kankerbehandeling is vaak niet bekend of een individuele patiënt op een bepaalde behandeling zal reageren. Om dit vraagstuk aan te pakken, zijn we gestart met Secret-omics: een multidisciplinair onderzoeksproject waarin vijf Nederlandse onderzoeksinstituten en 21 internationale bedrijven samenwerken. Binnen Secret-omics ontwikkelen we nieuwe bloedtesten die extracellulaire vesikels (EV's) analyseren die door tumoren worden afgegeven. Deze tumor EV's bevatten informatie, het zogenaamde secretome, die gerelateerd is aan de respons op behandeling.

Een belangrijke uitdaging binnen biomarker onderzoek naar EV's is de wisselende samenstelling van verzameld bloed en bloedplasma dat in biobanks wordt opgeslagen. Huidige protocollen voor bloedafname, verwerking en opslag kunnen leiden tot wisselende concentraties van andere deeltjes dan EV's. Deze deeltjes kunnen de signalen van daaropvolgende analyses beïnvloeden en daarmee leiden tot onbetrouwbare biomarker metingen.

In dit promotietraject richt je je op het optimaliseren van de bereiding en opslag van bloedplasma, waarbij je het volledige EV-secretome behoudt. Je ontwikkelt gestandaardiseerde methoden om de samenstelling van plasma te beoordelen en kwaliteitsparameters voor biobanken vast te stellen.

Samen met clinici, biomedische onderzoekers en industriële partners valideer je deze methoden in klinische biobanken. Ook ontwikkel je goed gedefinieerde testsamples die de technologische ontwikkeling binnen het hele Secret-omics-consortium ondersteunen. Met jouw onderzoek leg je de basis voor robuuste en reproduceerbare EV-gebaseerde diagnostiek voor de selectie van kankerbehandelingen.

Je gaat:

• methoden ontwikkelen om de kwaliteit van bloedplasma te beoordelen, waaronder de aanwezigheid van resterende bloedcellen en hemolyse;
• onderzoeken hoe bloedafnamebuizen en pre-analytische variabelen de samenstelling van plasma en het EV-secretome beïnvloeden;
• experimentele protocollen ontwerpen en optimaliseren voor de bereiding en opslag van bloedplasma, waarbij het EV-secretome behouden blijft;
• de kwaliteit van monsters uit klinische biobanken beoordelen en inclusie- en exclusiecriteria vaststellen voor daaropvolgende biomarkeranalyses;
• gestandaardiseerde testsamples ontwikkelen en valideren voor technologische ontwikkeling binnen het consortium.

Daarnaast pas je analysetechnieken toe, zoals flowcytometrie en spectrofotometrische assays. Samen met academische en industriële partners integreer je jouw onderzoek binnen het bredere Secret-omics-project.

Deze functie biedt je de mogelijkheid om sterke experimentele, analytische en conceptuele vaardigheden te ontwikkelen en tegelijkertijd bij te dragen aan klinisch relevante innovaties op het gebied van kankerdiagnostiek.

We zoeken een enthousiaste, gemotiveerde en nieuwsgierige kandidaat die wil bijdragen aan innovatief biomarker onderzoek. Je werkt graag in een multidisciplinaire omgeving en vindt het interessant om experimentele inzichten te vertalen naar robuuste en reproduceerbare methoden.

Je hebt ook:

• een masterdiploma in biomedische wetenschappen, (bio)medische laboratoriumwetenschappen, moleculaire of cellulaire biologie of een vergelijkbare opleiding;
• een sterke interesse in biomarkeronderzoek, klinische chemie en/of de biologie van extracellulaire vesikels;
• affiniteit met experimenteel laboratoriumonderzoek en bij voorkeur ervaring met technieken zoals celkweek, flowcytometrie of biochemische assays;
• interesse in methodeontwikkeling, standaardisatie en pre-analytische processen, gecombineerd met sterke analytische en organisatorische vaardigheden;
• een proactieve en samenwerkingsgerichte houding, goede communicatieve vaardigheden en een uitstekende beheersing van het gesproken en geschreven Engels.

Programmeervaardigheden zijn een pré. Je neemt verantwoordelijkheid voor je eigen werk en bent flexibel wanneer dat nodig is.

• Je treedt in dienst bij Amsterdam UMC Research BV.
• Een contract voor de duur van 12 maanden, met de intentie te verlengen tot een totaal van vier jaar. Voor deze vacature geldt de Richtlijn Promovendi.
• Inschaling in salarisschaal OIO: € 3.217 tot € 4.077 bruto bij een fulltime dienstverband (afhankelijk van ervaring). Daarnaast ontvang je 8,3% eindejaarsuitkering.
• Vakantie-uren: 194,4 uur per jaar bij een fulltime dienstverband en de mogelijkheid om uren bij te sparen.
• 100% OV-vergoeding. Kom je lopend, fietsend of met de auto? Dan ontvang je een vergoeding van €0,21 per km (voor de auto geldt een maximum van 40 km enkele reis).
• Kom je op de fiets? Maak gebruik van onze goede fietsregeling.
• Pensioenopbouw bij BeFrank, een modern, begrijpelijk en eerlijk geprijsd pensioen.

Bekijk deze video met meer informatie over de indiensttreding bij Amsterdam UMC Research BV.

Je maakt deel uit van het Amsterdam Vesicle Center (AVC), onderdeel van het Laboratorium Gespecialiseerde Diagnostiek en Onderzoek. Onze onderzoeksgroep ontwikkelt nieuwe technologieën om de aanwezigheid en biologische functie van EV's in gezondheid en ziekte te bestuderen, met als doel EV's in te zetten als klinische biomarkers. We hebben uitgebreide expertise in EV-biologie, liquid biopsies en de invloed van pre-analytische variabelen op bloedgebaseerde diagnostiek.

Daarnaast maak je deel uit van het Secret-omics-projectteam, dat bestaat uit acht promovendi, drie postdoctoraal onderzoekers en twee clinici. Je werkt in een samenwerkingsgerichte omgeving met volop mogelijkheden voor dagelijkse begeleiding, wetenschappelijke uitwisseling en samenwerking. Je wordt begeleid door dr. Rienk Nieuwland, dr. Jillian Bracht en dr. Edwin van der Pol, die het project leidt.

Als onderdeel van het bredere Secret-omics-consortium werk je samen met een multidisciplinair netwerk van academische en industriële partners. Samen draag je bij aan de ontwikkeling van klinisch relevante technologieën voor de kankerdiagnostiek en theraphieselectie.

Amsterdam UMC Research BV

Amsterdam UMC Research BV ondersteunt wetenschappelijk onderzoek zonder winstoogmerk. Hiermee voorzien we onderzoekers in alles wat ze nodig hebben om te kunnen excelleren. Zo bieden onze principal investigators (PI's) en projectleiders begeleiding op het gebied van projectbeheer, finance en human resources. Bij medisch-wetenschappelijke onderzoeksprojecten wordt daarnaast ook ondersteuning op juridisch vlak geboden.

Bekijk de video voor meer informatie.

Heb je nog vragen? Voor inhoudelijke informatie over deze vacature kun je terecht bij dr. Jillian Bracht, via [e-mail] of dr. Rienk Nieuwland, via [e-mail].

Een referentiecheck en screening kunnen onderdeel zijn van de procedure. Kom je bij ons in dienst, dan vragen we voor een aantal functiegroepen standaard een VOG (Verklaring Omtrent Gedrag). Bekijk wat het inhoudt en of het voor jouw functie van toepassing is.

Interne kandidaten krijgen, bij gelijke geschiktheid, voorrang op externe kandidaten.

Acquisitie naar aanleiding van deze vacature wordt niet op prijs gesteld.