Thèse : mécanisme moléculaire du transporteur ABC de multiples drogues, BmrA (H/F)

CNRS; Lyon; Hybrid; EUR 23,000 - 28,000; Full time

Benefits offered by this job

Congés 44 jours/ RTT annuels

Mobilité durable remboursée 300€

Job summary

CNRS - Unité Microbiologie Moléculaire et Biochimie Structurale (MMSB), Lyon, recherche un doctorant en biochimie et biologie structurale. Le projet porte sur les transporteurs ABC et la résistance aux drogues, avec analyses fonctionnelles et structuraless.

La thèse combine biologie moléculaire, caractérisation fonctionnelle et cryo-EM pour comprendre les mécanismes coopératifs et les liaisons des substrats, dans un environnement collaboratif à proximité du centre-ville de Lyon.

Qualifications

• Formation solide en biochimie et biologie structurale.
• Connaissances en protéines membranaires et techniques structurales.
• Curiosité et motivation pour la biophysique et les mécanismes de transport.

Responsibilities

• Mutagénèse dirigée et production/purification de protéines membranaires (BmrA WT et mutants).
• Caractérisation fonctionnelle: activité ATPase et transport de médicaments.
• Études de liaison des médicaments et analyses avec ITC/fluorimétrie.
• Biologie structurale: préparation de cryo-EM pour déterminer les structures 3D.

Skills

Biochimie

Biologie structurale

Biophysique

Protéines membranaires

Education

Doctorat en Biochimie / Biologie structurale

Tools

Cryo-EM

Calorimétrie ITC

Purification de protéines membranaires

Job description

Cette offre est ouverte aux personnes disposant d’un titre leur reconnaissant la qualité de travailleur handicapé ou travailleuse handicapée.

L'offre en un coup d'oeil

L'unité

Microbiologie Moléculaire et Biochimie Structurale

Type de Contrat

Temps de Travail

Lieu de Travail

Durée du contrat

36 mois

Date d'Embauche

Rémuneration

Description du Poste

Sujet De Thèse

Contexte scientifique :
La résistance à de multiples drogues (MDR) chez les bactéries représente une menace majeure pour la santé mondiale, compromettant l'efficacité des traitements antibiotiques. Les transporteurs de médicaments polyspécifiques jouent un rôle clé dans cette résistance, en permettant l’efflux d’une large gamme d’antibiotiques hors de la cellule. BmrA, un transporteur de type ATP-Binding Cassette (ABC), sert de modèle pour étudier ces mécanismes.

Questions clés :
Une question centrale est de comprendre comment BmrA peut expulser une si grande variété de médicaments, et en particulier, si son état de repos nécessite une conformation largement ouverte pour accommoder les molécules les plus volumineuses. Par ailleurs, il est établi que différents médicaments peuvent se lier simultanément au transporteur et déclencher un mécanisme de transport coopératif, mais cette coopérativité reste mal comprise.

Contexte du projet :

• Biologie moléculaire (ex. : mutagénèse dirigée ; production et purification de protéines membranaires (surexpression et purification de BmrA sauvage (WT) et mutant)) ;
• Caractérisation fonctionnelle (tests d’activité ATPase ; tests de transport de médicaments ; études de liaison aux médicaments (ex. : Calorimétrie de Titration Isotherme, tests basés sur la fluorescence)) ;
• Biologie structurale (microscopie électronique par cryo-EM pour déterminer les structures 3D de BmrA WT et mutant).

Profil du candidat :

Nous recherchons un doctorant hautement motivé, avec une solide formation en biochimie et un vif intérêt pour la biologie structurale et la biophysique. Une expérience ou des connaissances en protéines membranaires et en techniques de biologie structurale seraient un atout. Le candidat doit être curieux, passionné par la recherche et motivé pour étudier les protéines membranaires à l’interface de la biochimie, de la biologie structurale et de la biophysique.

P.S. Cette offre de thèse correspond à celle que nous avons récemment publié sur LinkedIn. Si vous nous avez déjà soumis votre candidature et que nous ne l’avons pas retenue car votre profil ne correspondait pas à ce que nous recherchions, merci de ne pas candidater à nouveau.

Publications pertinentes du laboratoire :

• Di Cesare et al. (J. Biol. Chem., 2024). L’activité de transport du transporteur ABC multidrogue BmrA ne nécessite pas une large séparation des domaines de liaison des nucléotides.
• Pérez Carrillo et al. (Nat. Commun., 2025). Communication bidirectionnelle entre les sites de liaison des nucléotides et des substrats dans un transporteur ABC multidrogue de type IV.

Votre Environnement de Travail

Laboratoire d’accueil : Unité de recherche Microbiologie Moléculaire et Biochimie Structurale (MMSB), campus de Gerland (Lyon).
Tutelles : Unité mixte sous la supervision du CNRS et de l’Université Lyon 1.
Axes de recherche : Comprendre les mécanismes moléculaires de la pathogénie microbienne et des interactions macromoléculaires (structure, dynamique et fonction).
Environnement de travail :
Situé à proximité du centre-ville de Lyon, avec un accès facile aux transports en commun (métro, tram, pistes cyclables). Infrastructures modernes et une ambiance collaborative et bienveillante. Opportunités de formation et de participation à des conférences

Rémunération et avantages

Rémunération

Congés et RTT annuels

44 jours

Pratique et Indemnisation du TT

Pratique et indemnisation du TT

Prise en charge à 75% du coût et forfait mobilité durable jusqu’à 300€

À propos du CNRS

Le CNRS est un acteur majeur de la recherche fondamentale à une échelle mondiale. Le CNRS est le seul organisme français actif dans tous les domaines scientifiques. Sa position unique de multi-spécialiste lui permet d’associer les différentes disciplines pour affronter les défis les plus importants du monde contemporain, en lien avec les acteurs du changement.