Thèse en physique du vivant (H/F)

CNRS; Villeurbanne; On-site; EUR 23,000 - 28,000; Full time

Benefits offered by this job

RTT 44 jours annuels

Remboursement mobilité 75% et forfait

Indemnisation du TT jusqu’à 300€

Job summary

CNRS, Institut Lumière Matière (Lyon), recherche des candidat·e·s pour étudier la mécanique des monocouches cellulaires en utilisant un micro-étireur intégré à des microcanaux dans un hydrogel.

Le projet vise à relier l’ordre orientationnel des cellules à leur réponse mécanique et implique des acquisitions d’images en temps réel, des analyses d’orientation et des marqueurs actines. Travail en équipe interdisciplinaire et international.

Qualifications

• Prérequis : M2 ou formation équivalente en physique, biophysique, mécanique, matière molle, bio-ingénierie ou dans un domaine connexe.

Responsibilities

• Cultiver des monocouches cellulaires dans des microcanaux en hydrogel et utiliser le micro-étireur.
• Modifier l’ordre nématique initial du tissu.
• Réaliser des acquisitions d’images en temps réel et quantifier la déformation de la lumière du canal et les champs d’orientation de l’actine.
• Étudier l’origine biologique de la réponse mécanique à l’aide d’inhibiteurs pharmacologiques et d’immunomarquages.

Skills

Culture cellulaire

Microfluidique

Microscopie à fluorescence

Analyse d’images et Python

Mécanique des milieux continus

Rhéologie

Crystaux liquides

Education

Master 2 (M2) ou équivalent en physique, biophysique, mécanique, matière molle, bio-ingénierie ou domaine connexe

Tools

PDMS

Hydrogels

Job description

Cette offre est ouverte aux personnes disposant d’un titre leur reconnaissant la qualité de travailleur handicapé ou travailleuse handicapée.

L'offre en un coup d'oeil

L'unité

Type de Contrat

Temps de Travail

Lieu de Travail

Durée du contrat

36 mois

Date d'Embauche

Rémuneration

La rémunération est de 2300 bruts mensuel

Description du Poste

Sujet De Thèse

Étude du rôle de l’activité et de l’anisotropie dans la mécanique des monocouches cellulaires
Ce projet vise à étudier le rôle de l’activité et de l’anisotropie dans la mécanique des monocouches cellulaires. L’activité est une caractéristique des systèmes hors équilibre. Ces systèmes consomment de l’énergie à l’échelle microscopique, par exemple par l’hydrolyse de l’ATP dans les cellules, ce qui leur permet de générer des contraintes actives, telles que les forces contractiles exercées par le réseau actomyosine. L’anisotropie caractérise les systèmes constitués de particules ou de cellules allongées, dont les propriétés diffèrent selon les directions X et Y. Les approches traditionnelles de caractérisation mécanique des tissus biologiques les considèrent comme des matériaux passifs et isotropes. Ce projet vise à combler cette lacune grâce à un nouveau système in vitro : le micro-étireur (microstretcher).
Le micro-étireur est un dispositif microfluidique qui permet d’appliquer une tension à l’échelle tissulaire tout en modulant l’activité et l’anisotropie cellulaires (Dessalles et al., Nature Physics, 2025). Il est constitué d’une monocouche cellulaire, par exemple de cellules endothéliales ou épithéliales, tapissant la surface d’un canal cylindrique situé à l’intérieur d’un hydrogel souple (Dessalles et al., Biofabrication, 2021). Lorsque la pression du fluide dans la lumière du canal augmente, le diamètre du cylindre augmente et les cellules sont soumises à une tension mécanique.
Dans ce cadre, vous réaliserez les premiers essais de rhéologie à long terme sur des monocouches épithéliales courbes (MDCK, MCF-10A) et endothéliales (HUVEC), afin de relier leur réponse mécanique à leur ordre orientationnel. Vos missions seront les suivantes :

• Cultiver des monocouches cellulaires dans des microcanaux en hydrogel et utiliser le micro-étireur.
• Moduler l’ordre nématique initial du tissu.
• Réaliser des acquisitions d’images en temps réel et quantifier la déformation de la lumière du canal, la forme des cellules et les champs d’orientation de l’actine, notamment les défauts topologiques.
• Étudier l’origine biologique de la réponse mécanique à l’aide d’inhibiteurs pharmacologiques et d’immunomarquages.

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Profil recherché

Prérequis : M2 ou formation équivalente en physique, biophysique, mécanique, matière molle, bio-ingénierie ou dans un domaine connexe ; curiosité pour les systèmes vivants ; intérêt pour le travail expérimental.

Compétences appréciées : Culture cellulaire, microfluidique ou microfabrication (PDMS, hydrogels), microscopie à fluorescence, analyse d’images et traitement de données (Python), notions de mécanique des milieux continus, de rhéologie ou de cristaux liquides. Une formation sera assurée sur ces différentes techniques.

Qualités personnelles : Rigueur, dextérité expérimentale, patience face aux expériences de longue durée, capacité à résoudre des problèmes expérimentaux, autonomie et curiosité pour les approches interdisciplinaires à l’interface entre physique et biologie.

Langue de travail : Anglais (la maîtrise du français n’est pas requise). Les candidatures internationales sont les bienvenues.

Vous ne remplissez pas tous les critères ? N’hésitez pas à candidater malgré tout. La motivation et la volonté d’apprendre à l’interface entre la physique et la biologie sont les critères les plus importants. Nous accueillons les candidatures de tous horizons et nous nous engageons en faveur de l’égalité des chances.

Votre Environnement de Travail

L’institut Lumière Matière (iLM) est une unité de recherche CNRS-Université Lyon 1 localisée sur le campus Lyon Tech La Doua. Avec plus de 320 collaborateurs dont une centaine de doctorants et post-doctorants, l’iLM est un acteur majeur de la recherche en physique et chimie sur la région Auvergne Rhône Alpes, reconnu internationalement pour l’excellence de sa recherche.
Un encadrement de proximité : présence quotidienne de votre encadrant·e au laboratoire, entretien individuel hebdomadaire et réunions d’équipe.
Une formation pratique aux techniques expérimentales : biomatériaux, ingénierie d’organes sur puce (organ-on-chip), imagerie en temps réel, analyse quantitative d’images et physique de la matière active.
Une équipe accueillante : un environnement interdisciplinaire au sein d’une équipe de biophysique disposant d’équipements de pointe et entretenant des liens étroits avec les spécialistes de la matière molle et de la rhéologie active de l’ILM.
Des collaborations scientifiques : des collaborations à l’échelle nationale et internationale.

Contraintes et risques

Risque biologique standard.

Rémunération et avantages

Rémunération est de 2300 bruts mensuel

Congés et RTT annuels : 44 jours

Pratique et Indemnisation du TT : Pratique et indemnisation du TT

Prise en charge à 75% du coût et forfait mobilité durable jusqu’à 300€

À propos du CNRS

Le CNRS est un acteur majeur de la recherche fondamentale à une échelle mondiale. Le CNRS est le seul organisme français actif dans tous les domaines scientifiques. Sa position unique de multi-spécialiste lui permet d’associer les différentes disciplines pour affronter les défis les plus importants du monde contemporain, en lien avec les acteurs du changement.