STAGE M2 en tolérance végétale à l'eutrophisation H/F

EDYSAN UMR7058 CNRS-UPJV; Hauts-de-France; Sur place; EUR 20 000 - 40 000; Plein temps

Résumé du poste

Un laboratoire de recherche en écologie en Hauts-de-France propose un stage de 6 mois sur l'eutrophisation des sols et la tolérance végétale. Le stage inclut des expériences avec Arabidopsis thaliana, la mesure de performance végétale et l'analyse de données sous RStudio. Les candidats doivent être en Master 2 en écologie ou disciplines similaires, avec un intérêt pour l'écologie microbienne. Début prévue en janvier 2026.

Qualifications

• Intérêt pour l'écophysiologie et l'écologie microbienne.
• Des connaissances en culture stérile et en biologie moléculaire seront appréciées.

Responsabilités

• Participer à des études expérimentales sur la tolérance végétale.
• Suivre des expériences en microboxes gnotobiotiques.
• Mesurer la performance végétale sous différents régimes nutritifs.
• Préparer des échantillons pour l'analyse du microbiome.
• Analyser les données sous RStudio et contribuer à un article scientifique.

Connaissances

Rigueur expérimentale

Autonomie au laboratoire

Capacité de synthèse

Esprit de travail en équipe

Formation

Étudiant en Master 2 en écologie, biologie des plantes, microbiologie ou disciplines proches

Outils

RStudio

Description du poste

Contexte du recrutement et définition de poste :

L'eutrophisation des sols, provoquée par des apports excessifs d'azote, de phosphore ou d'autres éléments liés à l'utilisation intensive d'engrais mais aussi aux dépôts atmosphériques, perturbe les interactions sol‑plante et compromet la résilience et la productivité des écosystèmes naturels et agricoles. Comprendre les mécanismes qui permettent aux plantes de tolérer ce stress toxique est essentiel pour anticiper les effets du changement global sur la biodiversité et la productivité. Ce stage vise à explorer le rôle du microbiome du sol dans la tolérance végétale à l'eutrophisation à l'aide du modèle Arabidopsis thaliana.

• la stagiaire participera à une étude expérimentale visant à comprendre les mécanismes de tolérance végétale à l'eutrophisation et le rôle du microbiome du sol dans cette réponse. Ses missions comprendront :
• la mise en place et le suivi d'expériences en microboxes gnotobiotiques avec Arabidopsis thaliana ;
• la mesure de paramètres de performance végétale (germination, croissance, floraison, biomasse) sous différents régimes nutritifs ;
• la préparation d'échantillons pour l'analyse du microbiome par séquençage à haut débit (16S et ITS2) ;
• l'analyse des données sous RStudio et la contribution à la rédaction d'un article scientifique.

Ce stage s'inscrit dans le cadre d'un projet de recherche plus large sur les interactions plante–microbiome et sur l'acclimatation et l'adaptation aux stress environnementaux.

Durée : 6 mois

Début : janvier 2026

Encadrant : Marco COSME, professeur junior

Dossier de candidature : les candidat

• es sont invité
• es à envoyer un CV, une lettre de motivation, le relevé de notes du Master, et, si possible, une lettre de recommandation de l'encadrant du stage de Master 1 ou d'autres encadrants précédents.

Profil recherché : Étudiant

• e en Master 2 en écologie, biologie des plantes, microbiologie, biotechnologie ou disciplines proches. Un intérêt marqué pour l'écophysiologie, l'écologie microbienne, la biologie des plantes et les interactions plante–microbiome est attendu.
• Des connaissances de base en culture stérile, en biologie moléculaire et / ou en analyses de données sous RStudio seront appréciées.
• e devra faire preuve de rigueur expérimentale, d'autonomie au laboratoire, d'une bonne capacité de synthèse et d'un esprit de travail en équipe.