Stage : développement d'un outil moléculaire de détection du Wheat Dwarf Virus (91)

Arvalis; France; Hybride; EUR 6 700 - 10 000; Temps partiel

Résumé du poste

Arvalis recherche un stagiaire Master 2 ou ingénieur, spécialisé en biologie moléculaire, biotechnologies ou biologie, pour développer et valider un outil de détection rapide du WDV par LAMP et/ou RPA sur feuilles et insectes vecteurs.

Le stage, situé à Boigneville (91), impliquera des analyses bibliographiques, des tests expérimentaux et une comparaison avec la qPCR de référence, avec une supervision scientifique étroite.

Qualifications

• Master 2 ou diplôme d’ingénieur en biologie moléculaire, biotechnologies ou biologie.
• Bonnes connaissances et compétences pratiques en biologie moléculaire: extraction d’ADN, PCR et qPCR.
• Projet de détection rapide WDV par LAMP et/ou RPA, en milieu laboratoire.

Responsabilités

• Réaliser une revue bibliographique des méthodes de détection rapide du WDV.
• Adapter/développer une méthode LAMP et/ou RPA spécifique du WDV.
• Évaluer les performances de la méthode (sensibilité, spécificité) par comparaison à la qPCR de référence.
• Valider le protocole sur échantillons végétaux et insectes vecteurs.
• Travailler au sein d’une équipe et avec supervision d’un binôme de supervision.

Connaissances

Biologie moléculaire

Extraction d’ADN

PCR

qPCR

Analyse expérimentale

Travail en équipe

Formation

Master 2 ou diplôme d’ingénieur (Biologie moléculaire/biotechnologies)

Outils

LAMP

RPA

Description du poste

• Stage : développement d'un outil moléculaire de détection du Wheat Dwarf Virus (91)

Stage : développement d'un outil moléculaire de détection du Wheat Dwarf Virus (91)

Lieu

Boigneville (91)

Date de début du contrat

Entre Janvier et Mars 2027

Date de dépôt de l'offre

Référence

Développement d’un outil moléculaire de détection rapide du WDV (WDV) sur plante et insecte vecteur

Sujet du stage

Le Wheat dwarf virus (WDV), responsable de la maladie des pieds chétifs, affecte principalement le blé et l’orge et est transmis par des cicadelles, notamment Psammotettix alienus. Sa surveillance nécessite de pouvoir détecter rapidement le virus aussi bien dans les plantes que chez les insectes vecteurs.

Ce stage s’inscrit dans le cadre du PARSADA IPSEELON, qui vise notamment à améliorer l’épidémiosurveillance des insectes piqueurs-suceurs et des agents pathogènes qu’ils transmettent. La détection du WDV repose actuellement sur des méthodes moléculaires telles que la PCR et la qPCR. Une méthode qPCR de référence est disponible et maîtrisée au laboratoire GenoPaV. Les techniques d’amplification isotherme, notamment la LAMP (Loop-mediated Isothermal Amplification) et la RPA (Recombinase Polymerase Amplification), offrent cependant la possibilité de développer des méthodes plus rapides, simples et potentiellement transférables au terrain.

L’objectif du stage sera de développer et valider un outil de détection rapide du WDV par LAMP et/ou RPA, applicable aussi bien aux feuilles de céréales qu’aux insectes vecteurs.

Objectifs du stage

• Réaliser une analyse bibliographique des méthodes de détection rapide du WDV
• Sélectionner, adapter et/ou développer une méthode LAMP et/ou RPA spécifique du WDV
• Évaluer les performances de la méthode (sensibilité, spécificité, répétabilité) par comparaison avec la qPCR de référence
• Valider le protocole sur des échantillons végétaux et des insectes vecteurs
• Étudiant(e) Master 2 ou école d’ingénieur avec une spécialisation en biologie moléculaire, biotechnologies ou biologie
• Bonnes connaissances et compétences pratiques en biologie moléculaire : extraction d’ADN, PCR et qPCR
• Intérêt pour le développement et l’optimisation de méthodes de diagnostic moléculaire
• Prise d’initiative, rigueur expérimentale, capacité d’analyse et travail en équipe
• Permis B et véhicule personnel nécessaires (site non desservi par les transports en commun)