Prédiction Génomique des Stades d’Orge

Arvalis; Ploërmel; Sur place; EUR 7 800 - 10 000; Plein temps

Résumé du poste

Arvalis recherche un stagiaire Master II ou ingénieur intéressé par la génétique quantitative et la modélisation pour contribuer au projet HORLORGE autour de la phénologie chez l'orge. Vous travaillerez sur l'ajustement des paramètres génétiques et sur l'intégration des données génomiques dans un cadre APSIM.

Le stage vise à cartographier les facteurs génétiques, réaliser des analyses GWAS et calibrer un modèle de prédiction, avec évaluation des capacités prédictives et des interdépendances avec

Qualifications

• Master II ou diplôme d'ingénieur en génétique quantitative, statistiques ou modélisation.
• Intérêt démontré pour les paramètres génétiques et la phénologie des céréales.
• Compétences en analyse de données et en modélisation recommandées.

Responsabilités

• Réaliser une analyse bibliographique des facteurs génétiques liés à la phénologie chez l'orge.
• Optimiser les valeurs des paramètres génétiques du modèle APSIM pour le panel testé.
• Identifier les zones du génome associées aux variations des paramètres par GWAS.
• Calibrer et valider un modèle de prédiction génomique pour les paramètres du modèle.
• Evaluer les capacités prédictives du modèle.

Connaissances

analyse bibliographique

génomique quantitative

statistiques

modélisation

Formation

Master II ou ingénieur

Outils

R

Python

GWAS software

Description du poste

Arvalis recherche un stagiaire Master II ou ingénieur intéressé par la génétique quantitative et la modélisation pour contribuer au projet HORLORGE autour de la phénologie chez l'orge. Vous travaillerez sur l'ajustement des paramètres génétiques et sur l'intégration des données génomiques dans un cadre APSIM.

Le stage vise à cartographier les facteurs génétiques, réaliser des analyses GWAS et calibrer un modèle de prédiction, avec évaluation des capacités prédictives et des interdépendances avec