Post-doc en mycobactériologie (H/F)

Cnrs Inc; Montpellier; On-site; EUR 42,000 - 54,000; Full time

Job summary

CNRS, site de Montpellier, recherche des compétences avancées en biologie moléculaire pour identifier des récepteurs impliqués dans la phagocytose et comprendre les interactions phage–hôte dans Mycobacterium abscessus. Le candidat mènera des expériences sur l’environnement, évaluerera lyse et interactions avec antibiotiques, et analysera des mutants pour cartographier les gènes clés.

Le poste s’inscrit dans un cadre de laboratoire de haut niveau, avec possibilité de travail hors heures ouvrables

Qualifications

• Maîtrise des techniques de biologie moléculaire (PCR, clonage, transformation, mutants par délétion).
• Solides compétences en biologie des phages et des mycobactéries.
• Grande expérience en génomique bactérienne et analyse de séquences.
• Capacité à travailler de manière autonome et en équipe.

Responsibilities

• Identifier de nouveaux récepteurs impliqués dans la reconnaissance phagique.
• Caractériser plusieurs phages et déterminer leur spectre d’hôte sur Mycobacterium abscessus.
• Analyser les mutants résistants et effectuer des analyses génomiques pour identifier les gènes impliqués.

Skills

Biologie moléculaire

Phages et mycobactéries

Génomique bactérienne

Autonomie et collaboration

Tools

PCR

Clonage

Job description

Missions:
L’objectif principal de ce travail consistera identifier de nouveaux récepteurs impliqués dans la reconnaissance phagique mais aussi d’identifier d’éventuels gènes impliqués dans les étapes tardives du processus infectieux afin de mieux décrypter les interactions entre phages et mycobactéries. La compréhension de ces mécanismes permettra d’améliorer notre connaissance des déterminants de la spécificité phage-hôte et pourrait, à plus long terme, contribuer à l’optimisation de nouveaux cocktails phagiques et au développement de nouvelles stratégies de phagothérapie.
Activités:
Le projet consistera à caractériser plusieurs phages à partir de l’environnement et à déterminer leur spectre d’hôte sur une collection de souches cliniques de Mycobacterium abscessus. L’efficacité et la spécificité de lyse de ces phages seront évaluées in vitro, en présence ou en absence d’antibiotiques, afin d’étudier d’éventuelles interactions synergiques entre phagothérapie et antibiothérapie. Dans un second temps, des mutants bactériens résistants à certains phages seront générés à partir de souches sensibles. L’analyse génomique de ces mutants permettra d’identifier le ou les gènes impliqués dans la résistance phagique et d’identifier des gènes bactériens nécessaires aux étapes précoces et/ou tardives de l’infection par le phage.
Contexte de travail:
La quasi-totalité des équipements et plateformes nécessaires à la réalisation du projet sont disponibles au laboratoire ou sur le site. La plupart des expériences seront réalisées dans un laboratoire de confinement de niveau 2.

Conditions particulières d'exercice

Le Centre national de la recherche scientifique est l’une des plus importantes institutions publiques au monde: 34 000 femmes et hommes (plus de 1 000 laboratoires et 200 métiers) , en partenariat avec les universités et les grandes écoles, y font progresser les connaissances en explorant le vivant, la matière, l’Univers et le fonctionnement des sociétés humaines. Depuis plus de 80 ans, y sont développées des recherches pluri et interdisciplinaires sur tout le territoire national, en Europe et à l’international. Le lien étroit que le CNRS tisse entre ses missions de recherche et le transfert vers la société fait de lui un acteur clé de l’innovation en France et dans le monde. Le partenariat qui le lie avec les entreprises est le socle de sa politique de valorisation et les start-ups issues de ses laboratoires (près de 100 chaque année) témoignent du potentiel économique de ses travaux de recherche.

Profil recherché

Competences:

• Maîtrise des techniques de biologie moléculaire, incluant la PCR, le clonage, la transformation et la construction de mutants par délétion.
• De solides compétences sur la biologie phages et des mycobactéries sont nécessaires
• Une forte expérience en génomique bactérienne et analyse de séquence est requise
• Compétences en résolution de problèmes avec la capacité de travailler de manière autonome et en collaboration.

Contraintes et risques:
Les expériences et le suivi de l'infection peuvent nécessiter de travailler en dehors des heures ouvrables, notamment le week-end.

Présentation de Cnrs

Le Centre national de la recherche scientifique est un organisme public de recherche pluridisciplinaire placé sous la tutelle du ministère de l’Enseignement supérieure et de la Recherche. Créé en 1939 et dirigé par des scientifiques, il a pour mission de faire progresser la connaissance et être utile à la société dans le respect des règles d’éthique, de déontologie et d’intégrité scientifique.