Ingénieur Expérimentation & Bioinformatique 3D Organoïdes

Inserm France; Bordeaux; Hybrid; EUR 42,000 - 64,000; Full time

Benefits offered by this job

Mutuelle santé collective

Restauration collective

Participation aux frais de transport

Forfait mobilité durable

Job summary

L’Inserm Nouvelle-Aquitaine recrute un(e) Ingénieur en expérimentation et bio-informatique biologique à Bordeaux pour rejoindre l’unité BRIC dédiée à l’oncologie.

Vous mettrez en œuvre et optimiserez la culture 3D d’organoïdes mammaires, réaliserez l’agrégation et l’infection lentivirale, et réaliserez les analyses bioinformatiques et transcriptomiques spatiales, en collaboration avec une équipe de 11 équipes de recherche.

Qualifications

• Connaissances en biologie cellulaire et en bioinformatique.
• Expérience ou connaissance des cultures 3D et organoïdes souhaitée.
• Maîtrise de l’anglais professionnel.

Responsibilities

• Réaliser des cultures 3D d’organoïdes mammaires en milieu Clevers.
• Effectuer l’agrégation de cellules et les infections lentivirales.
• Réaliser l’ensemencement d’organoïdes en dômes d’hydrogel (plaque 96 puits).
• Analyser les données de culture avec Incucyte/CellCyte et réaliser des analyses bioinformatiques et transcriptomiques spatiales.

Skills

Biologie cellulaire

Bioinformatique

Anglais professionnel

Esprit d'équipe

Education

Master 2 Biologie du Cancer

Tools

R/Bioconductor

Python

Seurat

scanpy

anndata

ImageJ

QuPath

VS Code (YAML)

Linux

HPC/SLURM

Job description

L’Inserm Nouvelle-Aquitaine recrute un(e) Ingénieur en expérimentation et bio-informatique biologique à Bordeaux pour rejoindre l’unité BRIC dédiée à l’oncologie.

Vous mettrez en œuvre et optimiserez la culture 3D d’organoïdes mammaires, réaliserez l’agrégation et l’infection lentivirale, et réaliserez les analyses bioinformatiques et transcriptomiques spatiales, en collaboration avec une équipe de 11 équipes de recherche.