Ingénieur en biologie moléculaire

IRD; Montpellier; Sur place; EUR 40 000 - 60 000; Plein temps

Résumé du poste

Un institut de recherche en sciences basé à Montpellier recherche un(e) chercheur(se) en microbiologie. Vous serez chargé(e) de mettre en œuvre des méthodes de recherche en écologie microbienne moléculaire, d'effectuer des analyses en biologie moléculaire et de gérer des données de séquençage. Une formation en biologie moléculaire et des compétences en bio-informatique sont essentielles. Ce poste exige un bon niveau d'anglais pour encadrer des étudiants non francophones.

Qualifications

• Autonomie dans la biologie moléculaire (extraction ADN, ARN, PCR).
• Expérience avec outils de bio-informatique.
• Compétent en rédaction de protocoles et rapports.
• Niveau d'anglais B1-B2 pour encadrer étudiants non francophones.

Responsabilités

• Veille méthodologique et mise au point de méthodes en métagénomique.
• Réaliser des analyses de routine en biologie moléculaire.
• Conduire l'analyse de données de séquençage.
• Rédiger des protocoles détaillés d'analyse.

Connaissances

Techniques de base en biologie moléculaire

Bio-informatique

Langages de programmation (R, Python)

Travail en équipe

Formation

Formation approfondie en biologie moléculaire

Outils

Qiime 2

Bash

Description du poste

L'IRD est une organisme de recherche public français pluridisciplinaire qui, depuis près de 80 ans, s'engage dans des partenariats équitables avec les pays du Sud et les Outre-mer français. Acteur de l'agenda international pour le développement, ses priorités s'inscrivent dans la mise en oeuvre des Objectifs de développement durable (ODD). Ensemble, scientifiques et partenaires de l'Institut proposent des solutions concrètes pour répondre aux défis globaux auxquels les sociétés et la planète font face. Cette relation gagnante-gagnante fait de la science et de l'innovation des leviers majeurs du développement. L'Institut est placé sous la double tutelle du ministère chargé de l'Enseignement supérieur et de la Recherche et de celui chargé des Affaires Étrangères.

Sous la responsabilité d'une chercheure à l'IRD spécialiste en microbiologie, votre mission consiste à choisir, adapter et mettre en oeuvre les méthodes nécessaires à la réalisation des activités de recherche de l'UMR dans le domaine de l'écologie microbienne moléculaire.

Activités et responsabilités

• Assurer la veille méthodologique et la mise au point de méthodes en métagénomique (écologie synthétique, cultures microbiennes, approches "méta-omiques", préparation, suivi et contrôle des opérations de fermentation).
• Réaliser des analyses de routine en biologie moléculaire (extraction ADN, ARN, PCR en temps réel, séquençage à haut débit).
• Conduire les analyses de données issues du séquençage à haut débit (métagénomes alimentaires et intestinaux) en utilisant des outils de bio-informatique (Qiime 2, R, Python, Bash), y compris sur des clusters de calcul, du traitement des données à la visualisation.
• Favoriser l'articulation avec les structures opérationnelles et décisionnelles (plateformes de séquençage à haut débit, interactions avec les centres de ressources microbiennes).
• Rédiger des protocoles détaillés d'analyse et former les stagiaires et partenaires.
• Respecter et faire respecter les règles d'éthique, d'hygiène et de sécurité.
• Participer à la gestion du laboratoire (commandes, suivi des stocks, maintenance).

Qualifications et compétences

• Être autonome dans la mise en œuvre des principales techniques de base de biologie moléculaire (extraction ADN, ARN, PCR en temps réel ou digitale, séquençage à haut débit).
• Avoir une expérience d'utilisation des outils de bio-informatique ainsi qu'en langages de programmation utilisés en analyses de données (R, Python).
• Mener les techniques de microbiologie classique.
• Rédiger des comptes rendus et des protocoles.
• Avoir un niveau de connaissance en anglais suffisant pour l'encadrement d'étudiants non francophones (niveau B1‑B2).
• De formation approfondie en biologie moléculaire; une expérience en bio-informatique appliquée est essentielle.

Qualités humaines

• Consciencieux, rigoureux et patient.
• Goût prononcé pour le travail en équipe.
• Capacités d'adaptation fortes à un nouveau collectif et à un environnement multiculturel.