Ingénieur en bioinfomatique et biologie moléculaire - 80% - H/F

CHU Grenoble Alpes; Grenoble; Sur place; EUR 42 000 - 64 000; Plein temps

Résumé du poste

Le CHU Grenoble Alpes recherche un(e) ingénieur(e) en bioinformatique et biologie moléculaire pour participer au diagnostic génétique de l'infertilité et au développement de nouvelles approches génomiques et multiomiques.

Le poste combine biologie moléculaire, analyse bioinformatique et développement méthodologique, en collaboration avec les biologistes médicaux et les équipes techniques du laboratoire.

Qualifications

• Formation: Master 2 en bioinformatique, génétique, génomique, biologie moléculaire ou discipline apparentée.
• Compétences: maîtrise des outils bioinformatiques (Python, R et/ou Bash), environnement Linux et analyses de données de séquençage à haut débit.
• Compétences appréciées: expérience en génétique de l'infertilité, analyses multiomiques et développement d'outils bioinformatiques.
• Qualités: rigueur scientifique, autonomie, organisation et esprit d'équipe pluridisciplinaire.

Responsabilités

• Concevoir, organiser et réaliser des analyses de biologie moléculaire appliquées à la génétique de l'infertilité.
• Planifier et exploiter les analyses de séquençage à haut débit (NGS), traiter les données, annoter, filtrer et prioriser les variants.
• Participer au développement de nouvelles approches génomiques et transcriptomiques (long-read sequencing, RNA-seq et single-cell).
• Analyser et intégrer données protéomiques et d'interactomique pour identifier de nouveaux mécanismes et biomarqueurs.
• Développer des outils et pipelines bioinformatiques pour automatiser et standardiser les analyses.
• Contribuer à la démarche qualité, traçabilité et documentation des analyses.

Connaissances

Python

R

Bash

Linux

NGS data analysis

Multi-omics analysis

Formation

Master 2 en bioinformatique

Description du poste

Avec plus de 2 100 lits et places, le CHU Grenoble Alpes est le 12e hôpital de France. Il emploie plus de 11 500 professionnels dont 1 700 médecins sur 3 sites : site Nord (hôpital Michallon et hôpital Couple-Enfant, site Sud, site de Voiron). Il dispose d’un plateau technique performant et dispense des soins hautement spécialisés.

Plus de 100 corps de métiers se côtoient chaque jour pour contribuer directement ou indirectement à sa vocation de soin, d’enseignement, de recherche et de prévention.

Les 3 Missions Essentielles Du CHUGA Sont

• Soigner
• Former
• Chercher

Le Poste

Présentation du poste

Le secteur de génétique de l'infertilité du CHU Grenoble Alpes recrute un(e) ingénieur(e) en bioinformatique et biologie moléculaire pour participer aux activités de diagnostic génétique et au développement de nouvelles approches génomiques et multiomiques appliquées à l'infertilité humaine.

Le poste associe des activités de biologie moléculaire, d'analyse bioinformatique et de développement méthodologique, en collaboration avec les biologistes médicaux et les équipes techniques du laboratoire.

Missions principales

• Concevoir, organiser et réaliser des analyses de biologie moléculaire appliquées à la génétique de l'infertilité.
• Planifier et exploiter les analyses de séquençage à haut débit (NGS), notamment le traitement bioinformatique, l'annotation, le filtrage et la priorisation des variants génétiques.
• Participer au développement de nouvelles approches génomiques et transcriptomiques (long-read sequencing, RNA-seq et single-cell).
• Analyser et intégrer des données protéomiques et d'interactomique pour l'identification de nouveaux mécanismes moléculaires et biomarqueurs de l'infertilité.
• Développer des outils et pipelines bioinformatiques permettant l'automatisation et la standardisation des analyses.
• Contribuer à la démarche qualité, à la traçabilité et à la documentation des analyses.

Profil Recherché

Formation : Master 2 (Bac +5) en bioinformatique, génétique, génomique, biologie moléculaire ou discipline apparentée.

Compétences requises : Bonne maîtrise des outils bioinformatiques (Python, R et/ou Bash), de l'environnement Linux et des méthodes d'analyse de données de séquençage à haut débit.

Compétences appréciées : Expérience en génétique de l'infertilité, en analyse de données multiomiques (génomique, transcriptomique, protéomique) ou en développement d'outils bioinformatiques.

Qualités attendues : Rigueur scientifique, autonomie, capacités d'organisation et aptitude au travail en équipe pluridisciplinaire.