INGENIEUR.E DE RECHERCHE

Laboratoire Labeo; Bitot; Sur place; EUR 26 000 - 33 000; Plein temps

Avantages offerts par ce poste

Comité Social et Economique (CSE)

TITRES restaurant

Mutuelle santé

Transports en commun

Résumé du poste

LABÉO Saint Contest recherche un Ingénieur de Recherche pour rejoindre le pôle Recherche, Développement et Innovation. Vous réaliserez les analyses in silico des données de séquençage et métagénomique, du procaryote à l’eucaryote, contribuant à des applications en santé animale et environnement.

Vous développerez des pipelines bio-informatiques, rédigerez rapports et articles, présenterez les résultats et interviendrez avec des partenaires locaux et internationaux.

Qualifications

• Titulaire d’un Bac+5 en génomique/bio-informatique.
• Expérience d’au moins 2 ans dans le traitement et l’analyse de données omiques.
• Expérience en calcul haute performance et utilisation de SLURM.
• Maîtrise Linux et langages Python, Perl, Java, Bash et R.
• Rigueur, autonomie, curiosité et esprit d’équipe.

Responsabilités

• Réaliser les analyses in silico de données omiques, métagénomique et séquençage.
• Développer de nouveaux pipelines d’analyses bio-informatiques.
• Rédiger rapports et articles scientifiques; présenter les résultats en congrès.
• Collaborer avec les partenaires académiques et industriels locaux et nationaux.
• Assurer une veille scientifique et identifier les besoins stratégiques.
• Préparer des comptes rendus et les présenter régulièrement.
• Encadrer des étudiants.

Connaissances

Python

Perl

Java

Bash

R

HPC

Linux

Slurm

Formation

Master Bac+5 en génomique / bio-informatique

Outils

SLURM HPC

Description du poste

Offre d’emploi INGENIEUR.E DE RECHERCHE - SAINT-CONTEST (14)

Type de contrat

Contrat durée déterminée

Rejoignez nos équipes et donnez du sens à votre vie professionnelle en participant à la vie d’un laboratoire à l’impact direct sur les acteurs et l’économie local. Venez apporter votre dynamisme à un laboratoire reconnu pour sa compétence globale pour l’environnement et la santé publique, sa qualité de service, sa proximité et sa polyvalence.

Entreprise

Présent sur l’ensemble de la Normandie, reconnu internationalement, l’engagement et le savoir-faire de 400 collaborateurs font de LABÉO, une plateforme d'analyses et de recherche de haut niveau technologique dans les domaines de la santé animale, de l'agroalimentaire et de l'environnement.

LABÉO Frank Duncombe est un site analytique historique connu et reconnu par les acteurs locaux (ARS, DDPP, Industriels, collectivités, centres hospitaliers…)

Localisation:Saint Contest, un cadre agréable aux portes de Caen

Le laboratoire Frank Duncombe est basé à Saint Contest, à proximité de Caen, ville dynamique et paisible offrant un cadre de vie alliant nature, patrimoine et proximité de la mer. Proche des transports et des loisirs, vous pourrez concilier facilement vie professionnelle et personnelle.

Votre rôle au sein de votre future équipe

Rattaché(e) au pôle Recherche, Développement, Innovation de LABÉO, vous rejoignez une équipe à taille humaine, conviviale et stimulante. Votre mission au sein de cette équipe de chercheurs sera d’assurer l’ensemble des analyses in silico des données de séquençages NGS, de génotypage à haut débit au niveau procaryote qu’eucaryote. Les projets concernent principalement des applications de métagénomique (16S et shotgun), de séquençage de génomes complets, de transcriptomique ou d’étude d’association pangénomique. L’ensemble de ces projets permet de répondre aux attentes nombreuses des filières économiques normandes: équine, conchylicole, bovine, apicole etc.

Vous recherchez un environnement de travail stimulant et proactif s’inscrivant dans le cadre de collaborations multidisciplinaires en lien avec des partenaires locaux (Centre François Baclesse, GIS Centaure) nationaux (INRAe) et internationaux (UK, USA etc.)

Vos activités se répartissent de la manière suivante:

• Réaliser les analyses in silico de données «omiques»
• Développer des nouveaux pipelines d’analyses bio-informatiques pour des applications variées: métagénomique, WGS, GWAS etc.
• Participer à la valorisation des résultats par la rédaction des rapports et des articles scientifiques; les présentations à différents congrès (inter)nationaux
• Interagir avec les collaborateurs scientifiques de LABÉO, de l’Université de Caen/Rouen et des partenaires
• Assurer la veille scientifique et technologique dans votre domaine et Identifier les besoins stratégiques
• Préparer des comptes-rendus réguliers sur l’avancement des travaux et être en mesure de les présenter.
• Encadrer des étudiants de tous niveau

Ces responsabilités ne sont pas limitatives.

Votre profil idéal

Nous valorisons avant tout les qualités humaines et le savoir-être. Voici ce que nous attendons de notre futur.e Ingénieur.e :

• Vous êtes titulaire d’un niveau Bac +5 en génomique en bio-informatique ou autre expertise équivalente
• Vous justifiez d’une expérience préalable d’au moins 2 ans dans le traitement et l’analyse de données «Omiques».
• Vous avez une expérience du calcul haute performance (HPC) et des ordonnanceurs de tâches tels que Slurm.
• Vous maitrisez le système Linux ainsi que des différents langages de programmation/Script: Python/Perl/Java/Bash/R
• Vous êtes rigoureu.se, motivé. e, autonome, curieu.se et vous avez le sens du travail en équipe

Ce que nous avons à vous offrir

En intégrant notre équipe, vous bénéficierez d’avantages qui facilitent votre quotidien et reconnaissent votre engagement:

• Comité Social et Economique (CSE) offrant divers avantages pour les salariés.
• Titres restaurant pour alléger vos frais de repas.
• Mutuelle santé pour vous et votre famille.
• Prise en charge des frais de transport en commun pour faciliter vos trajets domicile-travail

Nous mettons tout en œuvre pour créer un environnement de travail motivant et bienveillant, où votre bien-être est une priorité.

Modalités du contrat

Type de contrat : CDD – 18 mois

Temps de travail: Temps plein, 35h

Lieu de travail : LABÉO Frank Duncombe

Rémunération: Entre 2315€ à 3000€ brut mensuel

Prise de poste: 04/01/2027

Notre processus de recrutement

Chaque candidature est étudiée avec attention. Si votre profil correspond à nos attentes, un chargé de recrutement vous contacte pour une pré-sélection téléphonique. Si votre profil nous a plu lors de cet échange, un entretien de recrutement vous sera proposé, en présentiel ou à distance via Teams selon vos possibilités. On s’adapte! À l’issue de l’entretien, nous nous engageons à vous faire un retour dans un délai maximum de 14 jours.

Chez LABÉO, on s’engage à ce que chaque candidat reçoive une réponse, qu’elle soit positive ou négative.

Tous les postes de LABÉO sont ouverts aux personnes en situation de handicap.

Salaire

Minimum d’études

Minimum d’expérience

2-5 année(s)