Ingénieur(e) d'étude (IE) en Microbiologie Cellulaire et Moléculaire

Aix-Marseille Université; France; Sur place; EUR 32 000 - 40 000; Temps partiel

Résumé du poste

Aix-Marseille Université recrute un(e) ingénieur/e d’études dans le cadre du projet A*Midex TBM, chargé de générer une banque de mutants et de réaliser des expériences de localisation protéique et de phénotypage en microfluidique. Poste en CDD de 12 mois, avec collaboration entre laboratoires et partenaires du BIAM.

Le/la candidat(e) doit maîtriser la microscopie à fluorescence, la génétique bactérienne et les techniques associées, et présenter une solide formation en microbiologie moléculaire.

Qualifications

• Formation théorique et pratique en microbiologie moléculaire, bactériologie et génétique bactérienne.
• Maîtrise des techniques de biologie moléculaire et d’imagerie cellulaire.
• Autonomie dans la préparation d’échantillons et l’acquisition d’images.
• Capacité à travailler en collaboration inter-labs et à gérer des projets expérimentaux.

Responsabilités

• Générer une banque de mutants de délétion ciblée par recombinaison homologue.
• Réaliser des expériences de localisation protéique par microscopie à fluorescence.
• Effectuer le phénotypage fonctionnel de la motilité en puces microfluidiques.
• Préparer et caractériser protéines et échantillons, et réaliser Western Blot.
• Collaborer avec les partenaires du BIAM et documenter les données expérimentales.

Connaissances

Microscopie fluorescence

Génétique bactérienne

Biologie moléculaire

Biochimie des protéines

Microfluidique

Analyse de données

Formation

Master/équivalent en sciences biologiques

Outils

PCR et clonage

SDS-PAGE / Western blot

Description du poste

Dans le cadre du projet A*Midex TBMTM, l’ingénieur(e) d'études recruté(e) aura pour mission principale de générer une banque de mutants de délétion ciblés chez la bactérie utilisée au laboratoire ( P. magneticum ), de réaliser des expériences de localisation protéique par microscopie à fluorescence, et d’assurer le phénotypage fonctionnel de la motilité en puces microfluidiques en interaction directe avec les partenaires du consortium au BIAM (CEA Cadarache).

Ce CDD est financé pour une durée de douze mois.

Activités Principales et Tâches Associées

Microscopie à Fluorescence & Imagerie Cellulaire :

Conception et préparation des fusions traductionnelles avec des marqueurs fluorescents (fluorochromes). Préparation rigoureuse des échantillons de bactéries vivantes (ex. pads d'agarose) et maîtrise des protocoles d'imagerie. Acquisition autonome d'images sur les systèmes de microscopie à fluorescence du laboratoire. Traitement, analyse et gestion des données d'imagerie cellulaire.

Génétique Bactérienne & Biologie Moléculaire :

Construction de mutants de délétion ciblée par double recombinaison homologue. Réalisation courante des techniques fondamentales de biologie moléculaire : extraction d'ADN (génomique et plasmidique), PCR, clonage et transformation bactérienne (notamment par conjugaison).

Biochimie des Protéines :

Analyse et caractérisation des protéines d'intérêt. Préparation et réalisation d'électrophorèses de protéines (SDS-PAGE), transfert de membrane et immunomarquage / révélation par Western Blot.

Phénotypage de la Motilité en Microfluidique :

Mise en œuvre et suivi d'expériences de microfluidique dédiées à l'analyse de la motilité bactérienne (en partenariat avec le BIAM)

[e-mail]

Research Field Biological sciences » Other Education Level Master Degree or equivalent

Connaissances théoriques approfondies

Solide formation théorique en microbiologie moléculaire, bactériologie et génétique bactérienne. Maîtrise des principes théoriques de la biochimie des protéines (structure, interactions, immunomarquage). Connaissances approfondies des principes de la microscopie optique et de la fluorescence. Des notions théoriques ou pratiques en microfluidique constitue un atout appréciable.

Compétences techniques & Expérience pratique requises

Microscopie à fluorescence & imagerie :

Excellente expérience pratique en microscopie à fluorescence pour la détection et la localisation de protéines marquées. Autonomie complète de la préparation des plasmides et des échantillons bactériens jusqu'à l'acquisition et au traitement informatique des images.

Génétique & Biologie Moléculaire :

Expérience éprouvée dans la création de mutants de délétion par double recombinaison homologue. Parfaite maîtrise des techniques de base : extraction d'ADN/plasmides, design et réalisation de PCR, clonage, ingénierie plasmidique et transfert par conjugaison.

Biochimie des protéines :

Pratique autonome des techniques d'analyse protéique : électrophorèse (SDS-PAGE), immunomarquage et Western Blot.

Savoir-être :

Rigueur expérimentale, autonomie technique, esprit d'analyse et capacité à travailler en collaboration (notamment pour les interactions inter-laboratoires avec le BIAM). Participer aux taches communes du laboratoire.

Etre véhiculé

Le processus de sélection se déroulera en deux étapes : une première évaluation sur dossier, suivie d'un entretien pour les candidats retenus.