Ingénieur(e) biologiste en traitement de données (H/F)

CNRS; Montpellier; Sur place; EUR 40 000 - 60 000; Plein temps

Résumé du poste

Une institution de recherche scientifique à Montpellier recrute un(e) ingénieur(e) biologiste en traitement de données. Le candidat sera responsable du développement d'outils d'analyse d'images pour des projets d'imagerie dynamique. Les compétences requises incluent la programmation en Python ou Java, l'analyse d'images, ainsi qu’une maîtrise de l'anglais scientifique. Ce poste est en contrat CDD de 18 mois avec une rémunération entre 2521€ et 2688€ bruts par mois.

Qualifications

• Connaissances approfondies en langages de programmation.
• Compétences en analyse d’images et modélisation.
• Capacité d'analyse et force de proposition dans un environnement de recherche.

Responsabilités

• Mettre en œuvre des protocoles d’analyse d’images adaptés aux projets.
• Conseiller et former les utilisateurs sur les outils d’analyse.
• Développer des outils d’analyse d’images pour répondre aux besoins des projets.

Connaissances

Langages de programmation (e.g. Python, Java, MATLAB…)

Analyse d’images (e.g. FIJI, Imaris, Huygens…)

Optique appliquée aux techniques d’imagerie

Norme ISO 9001

Anglais scientifique

Formation

BAC+3/4

Outils

Microscopes optiques à fluorescence

Description du poste

Ingénieur(e) biologiste en traitement de données (H/F)

Date Limite Candidature : mardi 6 janvier 2026 23:59:00 heure de Paris

Assurez-vous que votre profil candidat soit correctement renseigné avant de postuler

Informations générales

Intitulé de l'offre : Ingénieur(e) biologiste en traitement de données (H/F)
Référence : UAR3426-PERALL-019
Nombre de Postes : 1
Lieu de travail : MONTPELLIER
Date de publication : mardi 16 décembre 2025
Type de contrat : IT en contrat CDD
Durée du contrat : 18 mois
Date d'embauche prévue : 2 mars 2026
Quotité de travail : Complet
Rémunération : entre 2521€ Brut et 2688€ Brut
Niveau d'études souhaité : BAC+3/4
Expérience souhaitée : Indifférent
BAP : A - Sciences du vivant, de la terre et de l'environnement
Emploi type : Ingenieure ou ingenieur biologiste en traitement de donnees

Missions

L’ingénieur-e d’études sera en charge de la conception originale, de la mise à disposition et de l’utilisation d’outils d’analyse d’images spécialement dédiés à l’imagerie dynamique in‑vivo réalisée sur la plateforme IPAM‑Biocampus intégrée dans le Nœud montpelliérain de l’infrastructure nationale FranceBioimaging. Cette mission inclura également des outils de modélisation préclinique des résultats.

L’ingénieur-e d’études mettra en œuvre des protocoles d’analyse d’images adaptés à chaque projet dans le cadre de la démarche qualité de la plateforme IPAM certifiée ISO 9001.

L’ingénieur-e d’études conseillera les utilisateurs de la plateforme concernant le choix et l’utilisation d’outils d’analyse des images. Il/elle sera en charge de la formation d’étudiants à l’utilisation de ces outils, de l’accompagnement des utilisateurs et du suivi des projets dans le cadre de prestations d’analyse qui seront proposées par la plateforme.

L’ingénieur-e d’études contribuera à la mise en service et à l’installation des équipements de microscopie de la plateforme d’imagerie du petit animal de Montpellier, et plus particulièrement à la mise en service du système d’imagerie confocale IVIM.

Activités

• Analyser les besoins scientifiques et technologiques de la communauté scientifique (académique et privée) dans le domaine de l'analyse d’imagerie cellulaire dynamique in‑vivo et réaliser les développements permettant de répondre à ces besoins.
• Développer/adapter des outils d’analyse d’images et de modélisation spécifiques des organoïdes in‑vivo.
• Transférer ces développements en prestations afin de répondre aux besoins des utilisateurs locaux, nationaux et internationaux de la plateforme IPAM.
• Assurer l’accompagnement des utilisateurs de la plateforme (chercheurs, ingénieurs ou étudiants français et étrangers).
• Mettre en œuvre les protocoles d’analyse d’images adaptés à chaque projet, l’interprétation et la mise en forme des résultats dans le cadre de la démarche qualité de la plateforme IPAM certifiée ISO 9001.
• Assurer la traçabilité et la valorisation des projets menés sur la plateforme.
• Assurer l’évolution technologique et l’entretien des équipements de la plateforme IPAM.
• Assurer une veille technologique dans son domaine de compétences.
• Contribuer à la démarche qualité de la plateforme.

Compétences

• Connaissances : 1. Connaissances en langages de programmation (e.g. Python, Java, MATLAB…) 2. Connaissances en analyse d’images (e.g. FIJI, Imaris, Huygens,…) 3. Connaissance des techniques de présentation orales et écrites 4. Connaissances en optique appliquée aux techniques d’imagerie 5. Connaissance de la norme ISO 9001 6. Maîtrise de l’anglais scientifique.
• Compétences opérationnelles/savoir‑faire : 1. Maîtriser l’utilisation et l’écriture « à façon » de logiciels d’analyse d’images et de modélisation. 2. Maîtriser les procédures qualité. 3. Savoir animer une réunion. 4. Maîtriser l’utilisation de microscopes optiques à fluorescence.
• Compétences comportementales/aptitudes : 1. Sens de l’observation et de l’analyse. 2. Force de proposition. 3. Capacité à travailler en équipe. 4. Sens de l’organisation. 5. Adaptabilité. 6. Capacité à transmettre son savoir et ses connaissances.

Contexte de travail

IPAM (Imagerie Préclinique Appliquée de Montpellier) est une plateforme technologique spécialisée dans l’imagerie préclinique en temps réel sur petit animal vivant (rongeurs, poissons zèbres, drosophiles). Elle offre des solutions d’imagerie multimodale et longitudinale grâce à trois plateaux techniques complémentaires, répondant aux besoins de recherche en biologie, pharmacologie, oncologie, neurosciences et cardiologie.

Le poste est rattaché au plateau d’imagerie IPAM‑IGF, localisé à l’Institut de Génomique Fonctionnelle de Montpellier et spécialisé dans les prestations d’imagerie intravitale dynamique par microscopie de fluorescence, notamment l’imagerie des signaux calciques et hémodynamiques.

Contraintes et risques

• Station assise prolongée
• Travail sur écran
• Manipulation d’instruments de précision
• Rayonnement lasers : port d’EPI obligatoires