Ingénieur biologiste en analyse de données (Bioinformaticien)

Inserm France; Strasbourg; Sur place; EUR 40 000 - 60 000; Plein temps

Résumé du poste

Une institution de recherche biomédicale recherche un bioinformaticien pour travailler sur le projet Delta-DECODE financé par l’ANRS. Le poste implique l'analyse de données RNA‑seq, le développement de workflows bioinformatiques et la gestion de données. Le candidat idéal collaborera avec des équipes à Strasbourg et à Henri Mondor, contribuant également aux publications scientifiques. Un environnement de travail dynamique et interdisciplinaire est prévu.

Responsabilités

• Traitement et analyse de données RNA‑seq (bulk, single‑cell et spatiale).
• Développement/adaptation de workflows bioinformatiques.
• Intégration des données omiques avec les données cliniques.
• Gestion et organisation des données.
• Collaboration avec les équipes de Strasbourg et partenaires internationaux.

Description du poste

Description

Mission principale:

Le/la bioinformaticien·ne recruté·e travaillera au sein du projet Delta-DECODE, financé par l’ANRS, qui vise à déchiffrer les interactions entre le virus de l’hépatite Delta (HDV) et le microenvironnement hépatique. Ce projet repose sur une large cohorte de biopsies hépatiques de patients, et utilise des approches de pointe : RNA‑seq bulk, single‑cell transcriptomics et transcriptomique spatiale à haute résolution.

Activités principales:

• Traitement et analyse de données RNA‑seq (bulk, single‑cell et spatiale).
• Développement/adaptation de workflows bioinformatiques (QC, alignement, clustering, analyse différentielle, pathway analysis).
• Intégration des données omiques avec les données cliniques.
• Gestion et organisation des données.
• Collaboration avec les équipes de Strasbourg, Henri Mondor et partenaires internationaux.

Contribution aux publications scientifiques.

Profil recher.