Ingénieur d'étude en optique (H/F)

CNRS; Marseille; On-site; EUR 26,000 - 31,000; Full time

Benefits offered by this job

Prise en charge à 75% du coût et forf.

Forfait mobilité durable 300€

Job summary

Le CNRS, Institut Fresnel, service MOSAIC, recherche un chercheur pour mener des travaux en microscopie à profondeur de champ étendue. Vous concevrez des montages optiques, réaliserez des acquisitions d’images et développerez des méthodes de traitement d’images.

Le poste, ouvert au travailleur handicapé, est à temps plein en laboratoire. Le candidat collaborera avec des partenaires et rédigera des rapports et mémoires, avec une rémunération à partir de 2571,89 euros brut par mois.

Qualifications

• Maîtrise des concepts d’imagerie et de microscopie avancée.
• Connaissance des méthodes de super-résolution et d’imagerie en fluorescence.
• Capacité à écrire des rapports et articles scientifiques en FR/ANG.

Responsibilities

• Concevoir et optimiser le montage optique et les illuminations speckle.
• Acquérir des images EDF-RIM et 2D-RIM sur échantillons fluorescents.
• Développer des chaînes de traitement d’images et réaliser des reconstructions.
• Évaluer performances: résolution, contraste, dose lumineuse, vitesse.
• Rédiger rapports d’avancement et publications scientifiques.

Skills

Optique physique

Imagerie de fluorescence

Microscopie avancée

Super-résolution

Illumination speckles

Python/Matlab

Analyse quantitative

Rédiger documents scientifiques

Anglais scientifique

Tools

Python/Matlab scripting

Job description

Cette offre est ouverte aux personnes disposant d’un titre leur reconnaissant la qualité de travailleur handicapé ou travailleuse handicapée.

L'offre en un coup d'oeil

L'unité

Type de Contrat

Temps de Travail

Lieu de Travail

Durée du contrat

3 mois

Date d'Embauche

Rémuneration

à partir de 2571,89 euros brut /mois

Description du Poste

Les Missions

Mener un travail de recherche expérimental et méthodologique en microscopie à profondeur de champs étendue: conception, mise au point instrumentale, acquisition d’images, analyse quantitative et valorisation scientifique. Le travail inclut les échanges avec les membres de l’équipe et les collaborateurs, ainsi que la rédaction de rapports, d’articles.

L'Activité

• Participer à la conception et à l’optimisation du montage optique : génération d’illuminations speckle, balayage focal rapide par lentille accordable électriquement, calibration de la PSF EDF et des autocorrélations d’illumination.
• Acquérir des images EDF-RIM, EDF grand champ et 2D-RIM sur échantillons fluorescents : cytosquelette d’actine, épithéliums, tissus embryonnaires ou autres modèles fournis par les collaborations biologiques.
• Développer et utiliser les chaînes de traitement d’images : calcul de variance, reconstruction super-résolue, comparaison avec déconvolution grand champ, estimation de topographie et rendu 3D des signaux projetés.
• Caractériser les performances : résolution latérale, contraste, suppression du fond, robustesse aux aberrations, vitesse d’acquisition, dose lumineuse et comparaison aux acquisitions plan par plan.
• Rédiger des rapports d’avancement, communications, articles scientifiques et mémoire de thèse.

Votre Profil

Compétences

• Optique physique, imagerie de fluorescence, microscopie avancée et principes de super-résolution.
• Microscopie à illumination structurée ou aléatoire, speckles, profondeur de champ étendue, PSF et aberrations optiques.
• Traitement d’images, statistiques, problèmes inverses, notions de programmation scientifique et analyse quantitative.
• Bases de biologie cellulaire et tissulaire utiles à l’imagerie de cellules, épithéliums et tissus embryonnaires.
• Aligner, calibrer et exploiter un microscope optique de recherche intégrant lasers, caméras, objectifs, lentille accordable et génération de speckles.
• Piloter les acquisitions, organiser les données, programmer ou adapter des scripts d’analyse sous Python/Matlab ou environnement équivalent.
• Quantifier les performances instrumentales et comparer des modalités d’imagerie sur des critères reproductibles.
• Rédiger des documents scientifiques en français et en anglais et présenter les résultats à l’oral.
• Rigueur expérimentale, autonomie progressive, curiosité scientifique et sens critique.
• Goût pour le travail interdisciplinaire à l’interface physique-biologie et capacité à dialoguer avec des collaborateurs.
• Organisation, fiabilité dans la tenue des cahiers d’expérience et respect des règles de sécurité, notamment laser et laboratoire.
• Assiduité sur les horaires correspondant à un temps plein.

Votre Environnement de Travail

Conditions de travail :Temps plein ; travail en laboratoire de microscopie et sur poste informatique ; respect des règles de sécurité laser et biologique ; déplacements ponctuels possibles pour collaborations, formations, réunions ou conférences.
Contexte d’exercice du poste: Poste exercé à l’Institut Fresnel, service MOSAIC, dans un environnement interdisciplinaire associant instrumentation optique, traitement d’images et applications à des échantillons biologiques. Collaborations possibles avec des plateformes d’imagerie et laboratoires partenaires.
Moyens mis à disposition: Salle expérimentale de microscopie, montage optique RIM/EDF-RIM, sources laser, diffuseur ou modulateur spatial de lumière, lentille accordable électriquement, caméras, objectifs, échantillons préparés avec les collaborateurs, bureau, ordinateur personnel et moyens de calcul/analyse.
Principaux interlocuteurs: Loïc Le Goff, Anne Sentenac, Frédéric Galland, Marc Allain, membres de l’équipe MOSAIC et collaborateurs biologistes/plateformes d’imagerie associés au projet EDF-RIM.

Rémunération et avantages

Rémunération

à partir de 2571,89 euros brut /mois

Congés et RTT annuels

44 jours

Prise en charge à 75% du coût et forfait mobilité durable jusqu’à 300€

Prise en charge à 75% du coût et forfait mobilité durable jusqu’à 300€

Secteur d’activité Sciences de l'Ingénieur et instrumentation scientifique

À propos du CNRS

Le CNRS est un acteur majeur de la recherche fondamentale à une échelle mondiale. Le CNRS est le seul organisme français actif dans tous les domaines scientifiques. Sa position unique de multi-spécialiste lui permet d’associer les différentes disciplines pour affronter les défis les plus importants du monde contemporain, en lien avec les acteurs du changement.