Génie Enzymatique et Cellulaire

CNRS; Compiègne; Hybrid; EUR 28,000 - 36,000; Full time

Benefits offered by this job

Indemnisation TT

Forfait mobilité durable 75% et jusquà

44 jours de congés annuels

Job summary

Le CNRS recrute un ingénieur d’études pour le laboratoire Génie Enzymatique et Cellulaire, UMR CNRS 7025, à Compiègne. Vous travaillerez sur les rhamnolipides comme agents de biocontrôle et mènerez des cultures in vitro, des analyses lipidiques et des expériences de biophysique sur des liposomes.

Le poste, d'une durée de 10 mois, nécessite un profil Bac+5 avec expérience en microbiologie et génie génétique.

Qualifications

• Niveau Bac+5 (Master 2 ou ingénieur) exigé.
• Connaissances en biologie végétale et biologie des champignons.
• Expérience pratique en culture in vitro, microscopie, génie génétique et analyses chimiques (HPLC/GC-MS).
• Des qualités rédactionnelles et de présentation orale sont indispensables.
• Bon esprit d’équipe et capacité à travailler en réseau, initiative.

Responsibilities

• Cultiver du mycélium du Botrytis cinerea in vitro et en enceinte climatique pour analyse lipidique.
• Réaliser une mutagenèse ciblée des voies biosynthétiques par CRISPR/Cas9.
• Conduire des tests antifongiques et analyses lipidiques sur mutants.
• Participer aux réunions et présenter les résultats du projet.

Skills

Biologie végétale

Génie génétique

Biocontrôle

Microscopie

Culture in vitro

HPLC/GC-MS

DLS

Education

Master 2 ou ingénieur (Bac+5)

Job description

Cette offre est ouverte aux personnes disposant d’un titre leur reconnaissant la qualité de travailleur handicapé ou travailleuse handicapée.

L'unité

Génie Enzymatique et Cellulaire

Durée du contrat

10 mois

Rémuneration

2 521 à 3 248 € brut mensuel

Description du Poste

Les Missions

Dans le contexte actuel d’objectif de réduction des intrants utilisés dans les cultures, il est capital de développer des moyens de protection respectueux de l’environnement et de la santé humaine. Les rhamnolipides, molécules naturelles sécrétées par des bactéries, ont la double propriété de stimuler les réactions de défense des plantes et d’avoir des propriétés antifongiques directes. Ces composés sont donc très intéressants pour des applications en biocontrôle afin de réduire l’usage des pesticides de synthèse. Ces molécules sont connues pour avoir une affinité avec la fraction lipidique de la membrane plasmique à la fois des plantes, pour exercer leur action de stimulateur de défense, et sur champignon, pour déclencher une action biocide. Comprendre les déterminants membranaires spécifiques impliqués dans ces mécanismes d’action est essentiel pour favoriser, à terme, leur utilisation en conditions de culture.

L'Activité

L’ingénieur aura pour mission de cultiver du mycélium du champignon phytopathogène Botrytis cinerea en conditions in vitro et en enceinte climatique, afin de permettre l’analyse de la composition lipidique de sa membrane plasmique par un partenaire du projet. Certains lipides ayant été identifiés comme impliqués dans le mode d’action antifongique des rhamnolipides, il s’agira également de réaliser une mutagenèse de leur voie de biosynthèse par une approche CrispR/cas9 chez ce même pathogène. Selon l’avancement du projet, des extractions et analyses de lipides seront réalisées sur ces mutants et une étude de leur perméabilisation par les rhamnolipides sera menée en microscopie confocale. Des tests antifongiques seront également réalisés, notamment pour évaluer l’efficacité de rhamnolipides de différentes structures. Les compositions lipidiques permettront également d’obtenir des liposomes mimant la membrane plasmique végétale ou fongique, ou des monocouches de lipides mimant le feuillet externe, afin de réaliser des expériences de biophysique et étudier spécifiquement les paramètres influençant l’interaction des rhamnolipides avec les lipides membranaires. Ces tests consisteront, entre autres, à caractériser les propriétés membranaires et de structure des liposomes à l’aide de sondes fluorescentes et de diffusion dynamique de lumière (DLS). L’ingénieur participera aux réunions au sein du laboratoire d’accueil et avec les partenaires du projet afin de présenter ses résultats.

Compétences

• - Niveau d’études : Bac+5 (Master2 ou ingénieur)
• - Des connaissances théoriques et un intérêt pour la biologie végétale, la biologie des champignons mycéliens, les interactions plantes micro-organismes et le biocontrôle sont souhaitées.
• - Une expérience pratique dans tout ou partie des méthodologies requises pour mener à bien le projet est nécessaire : culture in vitro de micro-organismes, microscopie, génie génétique, chimie analytique (HPLC/GC-MS/HPTLC), DLS, analyse de données, statistiques.
• - Des qualités rédactionnelles et de présentation orale sont indispensables.
• - Le candidat doit avoir d’excellentes prédispositions pour travailler en équipe et en réseau et devra faire preuve d’esprit d’initiative.
• - Rigueur, méthodologie, fiabilité, respect des délais sont exigés.

Votre Environnement de Travail

L’ingénieur d’études sera recruté au sein du laboratoire Génie Enzymatique et Cellulaire, UMR CNRS 7025. Il effectuera ses missions à l’Université de Technologie de Compiègne et également pour partie au sein de l’université de Picardie Jules Verne pour les expériences de biophysique. Le laboratoire est reconnu internationalement pour ses recherches centrées sur les bioressources, le biomimétisme et la bioinspiration. En particulier le thème de recherche « métabolisme végétal et bioressources » développe des travaux de recherche visant l’utilisation de ressources végétales cultivées de manière soutenable afin de répondre aux demandes sociétales. Le projet est financé dans le cadre de l'appel à projets ANR générique 2025 (projet Rhapidli).

Contraintes et risques

Une partie des expériences sera réalisée en laboratoire de confinement de niveau 2.

Rémunération et avantages

Rémunération

2 521 à 3 248 € brut mensuel

Congés et RTT annuels

44 jours

Pratique et Indemnisation du TT

Pratique et indemnisation du TT

Prise en charge à 75% du coût et forfait mobilité durable jusqu’à 300€

Secteur d’activité Sciences du vivant, de la terre et de l'environnement

Emploi type Ingenieur biologiste en analyse de donnees (H/F)

À propos du CNRS

Le CNRS est un acteur majeur de la recherche fondamentale à une échelle mondiale. Le CNRS est le seul organisme français actif dans tous les domaines scientifiques. Sa position unique de multi-spécialiste lui permet d’associer les différentes disciplines pour affronter les défis les plus importants du monde contemporain, en lien avec les acteurs du changement.