Data scientist (H/F)

CHU DUPUYTREN LIMOGES; Limoges; Sur place; EUR 26 000 - 33 000; Plein temps

Avantages offerts par ce poste

Restauration

Résumé du poste

Le CHU DUPUYTREN LIMOGES recrute un data scientist pour assurer les missions liées à l’Entrepôt de Données de Santé et au réseau Orchidée. Vous contribuerez au recueil des variables, au contrôle de cohérence et à la publication des codes sources, dans un cadre hospitalier.

Le poste est un CDD de 6 mois avec un salaire brut mensuel compris entre 2300 et 3000 euros. Travail en 35 heures par semaine, restaurant d’entreprise prévu.

Qualifications

• BAC+5 et plus en domaine médical ou informatique.
• Expérience d'au moins 12 mois dans le domaine ou en développement logiciel statistique.
• Connaissance des bases de données (PostgreSQL/Oracle) et sensibilité médicale.
• Anglais écrit médical obligatoire.

Responsabilités

• Participer au comité Orchidée et recueillir les variables nécessaires dans l'EDS.
• Assurer la qualité et la pérennité des données selon les BPC.
• Développer et déployer les scripts de traitement et de remontée des indicateurs.
• Gestion documentaire et publication du code source.
• Selon le profil, collecter des données et valoriser scientifiquement les résultats.

Connaissances

R

Python

SQL

Git

Bash

Jupyter

Formation

Bac+5 et plus domaine médical ou informatique

Outils

PostgreSQL

Oracle

Description du poste

Le CHU de Limoges est lauréat de l'appel à projets « Accompagnement et soutien à la constitution d'Entrepôts de Données de Santé hospitaliers » (EdS-H) soutenu par France 2030. Le plan « France 2030 », doté de 54 milliards d'euros déployés sur 5 ans, vise à développer la compétitivité industrielle et les technologies d'avenir à l'horizon 2030. Cet entrepôt de données permet aux chercheurs un accès aux données dans un cadre technique sécurisé.Certains développements sont réalisés en collaboration avec les équipes des CHU de Bordeaux et de Poitiers dans une vision d'infrastructure régionalisée en Nouvelle-Aquitaine.Dans le cadre du déploiement de son Entrepôt de Données de Santé (EDS), et de son intégration au sein du réseau européen Orchidée (*), le CHU Limoges recherche un datascientist pour assurer les missions suivantes :

Missions liées au réseau Orchidée :

• Participer au comité technique du projet Orchidée et assurer le recueil des variables nécessaires dans l'EDS du CHU Limoges
• Garantir la qualité et la pérennité de ses données selon les bonnes pratiques cliniques (BPC) de gestion de données (contrôle de cohérence, complétude.)
• Sur le plan informatique, développer et déployer les scripts de traitement de données permettant la remontée des indicateurs définis par le réseau Orchidée
• Participer à la gestion documentaire : procédures, guides techniques et documents qualité demandés par ce réseau comme par le CHU Limoges. Publication des codes sources développés.
• Générer et suivre des demandes de corrections et évolutions des indicateurs

Missions liées au déploiement de l'EdS :

• Définition des indicateurs de vigilance à intégrer dans l'EdS (profondeur historique.) avec les unités de vigilance du CHU
• Garantir la qualité, la fraîcheur et la pérennité des données nécessaires dans l'EdS
• Développement et/ou intégration des scripts statistiques de suivi et de remontée des indicateurs définis plus haut
• Le cas échéant, et selon les connaissances de la personne recrutée, collecter les données auprès des différentes sources, avec l'appui de l'équipe EdS
• Participer à la valorisation scientifique des résultats (articles, résumés, posters)

Connaissances obligatoires (Savoir) :

• Connaissance des logiciels de gestion de bases de données (PostGresQL, Oracle)
• Connaissance de logiciels de statistiques & de scripting (R, Python, bash, jupyter notebook.)
• Connaissance d'outils de gestion de versions de code (Git) et de langages d'interrogation de bases de données (SQL.)
• Anglais écrit médical

Connaissances optionnelles (Savoir) :

• Logiciels de gestion de données (ex : RedCap, Ennov Clinical.)
• Réglementation en matière de recherche clinique et de la terminologie médicale
• Réglementation sur les données personnelles et/ou sensibles (RGPD)
• Environnement Linux (Debian)
• Logiciels de développement et de séquencement d'ETL (Airflow, Nifi et/ou Talend et/ou Pentaho)

Expériences professionnelles (Savoir-faire) :

Première expérience appréciée dans le domaine médical et/ou le développement logiciel en modélisation statistique

Type de contrat CDD - 6 Mois

Contrat travail Durée du travail 35H/semaineTravail en journée

Salaire

• Salaire brut : Mensuel de 2300.0 Euros à 3000.0 Euros
• Restauration

Déplacements Déplacements: Jamais

Expérience

• 12 Mois Cette expérience est indispensable
• Bac+5 et plus ou équivalents- domaine médical ou informatique Cette formation est indispensable

Compétences

• Adapter les outils de traitement statistique de données
• Définir et faire évoluer des procédés de traitement de l'information
• Mobiliser des données massives pour éclairer les prises de décisions
• Paramétrer un logiciel, un outil, un système numérique
• Anglais Cette langue est indispensable

Savoir-être professionnels

• Avoir l'esprit d'équipe
• Etre force de proposition
• Faire preuve de rigueur et de précision

Informations complémentaires

• Secteur d'activité : Activités hospitalières