Chercheur·e Postdoctoral·e en Géomicrobiologie H/F

Universite Cote d Azur; Biot; Hybride; EUR 36 000 - 43 000; Plein temps

Avantages offerts par ce poste

Télétravail : jusqu'à 2 jours/semaine

Prise en charge partielle des frais de

transport domicile-travail

Mutuelle partielle

Accès CROUS

Résumé du poste

La Université Côte d'Azur recherche un chercheur postdoctoral en géomicrobiologie pour diriger le volet biologique d’un projet sur les interactions vivant-minéraux, avec des échantillonnages en conditions anoxiques et des analyses ADN/métabarcoding. Vous assurerez le suivi des communautés microbiennes et développerez une nouvelle expérience en laboratoire et sur le terrain.

Le poste combine travail sur le lac et en laboratoire de géochimie, avec publication dans des revues internationales et

Qualifications

• Doctorat en biologie ou microbiologie ou géomicrobiologie ou astrobiologie.
• Maîtrise des techniques de microbiologie moléculaire (extraction d'ADN, PCR, métabarcoding) et analyse des données de séquençage.
• Autonomie, rigueur et capacité à travailler aussi bien sur le terrain qu'en laboratoire.

Responsabilités

• Diriger le volet biologique du projet et étendre l'expérience existante.
• Assurer le suivi de l'écosystème microbien dans les réacteurs et comparer aux réacteurs stériles.
• Caractériser les communautés microbiennes par ADN et métabarcoding, en collaboration avec Genoscope.
• Concevoir et mener une nouvelle expérience avec les échantillons collectés, publier et présenter les résultats.

Connaissances

Biologie moléculaire

PCR

Métabarcoding

Bioinformatique

Culture anaérobie

Terrain et labo

Anglais

Formation

Doctorat en biologie / microbiologie / géomicrobiologie / astrobiologie

Outils

Extraction d'ADN

Incubations anaérobies

Description du poste

La vie a-t-elle façonné la surface de la Terre primitive ? Pendant la majeure partie de son histoire, les micro-organismes ont été les seules formes de vie à peupler l'océan et les continents, dans un monde caractérisé par un jeune Soleil faible, une atmosphère et des océans anoxiques, et potentiellement sans tectonique des plaques. L'altération des roches régule le système carbone-climat ainsi que l'habitabilité d'une planète, et les micro-organismes peuvent l'influencer directement (par leur métabolisme) ou indirectement (par les réactions chimiques dans lesquelles ils sont impliqués). L'une des doctorantes affectées au projet a conçu et construit un dispositif expérimental au CEREEP ECOTRON Île-de-France qui reproduit l'altération des roches dans des conditions similaires à celles de l'Archéen, avec et sans l'apport d'un écosystème microbien issu des eaux anoxiques du lac Pavin, un lac de maar ferrugineux situé dans le Massif central. Les étalonnages eau-roche et eau-air ainsi que les tests de stérilisation sont terminés : les expériences sont prêtes à démarrer et nous cherchons à compléter l'équipe.
Avez-vous de l'expérience en écologie microbienne, en géomicrobiologie ou en astrobiologie, ainsi qu'en cultures et incubations de micro-organismes anoxiques? Nous recherchons notre futur-e chercheur-e postdoctoral-e en géomicrobiologie !

Vos missions

• Vous travaillerez aux côtés d'une doctorante qui a construit le dispositif expérimental, et vous serez impliqué-e dans le volet biologique du projet et l'étendrez avec une nouvelle expérience.
• Diriger le volet biologique de l'expérience actuelle : assurer le suivi de l'écosystème microbien (fonctions de type archéen : micro-organismes méthanogènes, méthanotrophes, sulfato-réducteurs, sulfo-oxydants et nitrate-réducteurs) dans les réacteurs incubés par rapport aux réacteurs stériles.
• Caractériser les communautés microbiennes : extraction d'ADN et métabarcoding, en collaboration avec l'équipe du Genoscope, et interprétation de la composition des communautés selon les types de roches et les conditions.
• Co-organiser une campagne de terrain au lac Pavin : échantillonner l'eau anoxique à plus de 60 m de profondeur (bouteilles Niskin, incubations de roches in situ) et rapporter les échantillons dans des conditions anoxiques pour les utiliser dans les expériences.
• Concevoir, mettre en place et mener une nouvelle expérience similaire à celle existante, en utilisant les échantillons fraîchement collectés, et publier les résultats dans des revues internationales et les présenter lors de conférences.

Profil recherché

• Vous êtes titulaire d'un doctorat en biologie, microbiologie, géomicrobiologie ou astrobiologie (ou dans un domaine étroitement lié) et vous manifestez un vif intérêt pour l'évolution de la Terre et les interactions entre le vivant et les minéraux.
• Vous maîtrisez les techniques de microbiologie moléculaire (extraction d'ADN, PCR, métabarcoding et analyse bioinformatique des données de séquençage) et, idéalement, les techniques de culture ou d'incubation en milieu anaérobie.
• Vous êtes autonome, rigoureux-se et à l'aise aussi bien dans le travail de terrain (échantillonnage en bateau sur un lac) que dans un laboratoire de géochimie.
• Vous appréciez le travail d'équipe interdisciplinaire entre la géologie, la géochimie et la biologie, ainsi que la communication de vos résultats en anglais (la maîtrise du français est un atout).

Sujétions particulières

poste localisé entre Nice et Paris / Île de France

Rémunération

Rémunération contractuels (hors variables) : 3500 bruts mensuel, selon expériences

Congés

45 jours de congés annuels

Éligibilité et avantages

• Télétravail : jusqu'à 2 jours/semaine, selon nécessité du service
• Prise en charge partielle des frais de transport domicile-travail
• Prise en charge partielle des frais de mutuelle
• Accès aux restaurants et cafétérias du CROUS avec tarif bas

Compétences

• Analyser, exploiter, structurer des données
• Déterminer et développer les méthodes de recherche, de recueil et d'analyse de données
• Etablir un rapport d’étude ou de recherche
• Réaliser et vérifier des calculs de mathématiques généraux ou appliqués

Expérience

Experience: 7 An(s)

Qualification

Qualification: Cadre

Secteur d'activité

Secteur d'activité: Enseignement supérieur

Liste des qualités professionnelles

• Organiser son travail selon les priorités et les objectifs : Capacité à planifier, prioriser, anticiper des actions, en tenant compte des moyens, des ressources, des objectifs et du calendrier pour les réaliser.
• Faire preuve de rigueur et de précision : Capacité à réaliser des tâches en suivant avec exactitude les règles, les procédures, les instructions qui ont été fournies, sans réaliser d'erreur et à transmettre clairement des informations.
• Se montrer ponctuel et respectueux des règles de savoir-vivre usuelles.
• Etre ouvert aux changements : Capacité à s'adapter à des situations variées, à réagir à l'imprévu, gérer l'incertitude pour s'ajuster à des organisations, des collectifs de travail, des habitudes, des valeurs propres à l'entreprise.