Biologiste Moléculaire H/F

Asur Plant Breeding; Estrées-Saint-Denis, Compiègne, Amiens; Hybrid; EUR 48,000 - 62,000; Full time

Benefits offered by this job

Cantine sur place

Job summary

ASUR PLANT BREEDING, société française spécialisée en sélection génétique des céréales, recrute un biologiste moléculaire. Vous contribuerez à la caractérisation moléculaire de ressources génétiques et à l’amélioration des variétés céréalières au sein d’un laboratoire moderne.

Le poste, en CDI à temps plein, implique des activités de génotypage haut débit et une collaboration étroite avec les équipes de sélection; travail possible à Amiens puis au siège à Estrées-Saint-Denis, avec télétravail

Qualifications

• Bac+5 en biologie moléculaire, génétique, biotechnologies végétales ou domaine équivalent.
• Maîtrise des techniques d'extraction d'ADN manuelle et automatisée.
• Maîtrise de la PCR quantitative et utilisation de marqueurs moléculaires SNP.
• Notions en bio-informatique et manipulation de données (VCF, CSV, Excel).
• Rigueur, autonomie, sens de l’organisation et travail en équipe.

Responsibilities

• Gérer des projets de génotypage par marqueurs moléculaires du début à la fin.
• Réaliser les extractions d'ADN et les analyses qPCR (KASP/TaqMan) et optimiser les procédés.
• Assurer le suivi et la conformité du génotypage et la qualité des ADN et des PCR.
• Gérer les flux à haut débit et la traçabilité des échantillons.
• Participer à la gestion des données de génotypage et archivage des résultats.
• Collaborer avec les équipes de sélection et de biométrie; support bioinformatique.

Skills

Extraction ADN

PCR quantitative

SNP markers

Bioinformatique (bases)

Gestion données labo

Education

Bac+5 en biologie moléculaire

Tools

LIMS

R

Python

Primer3Plus

BLAST

Job description

Vous recherchez une expérience enrichissante dans une entreprise dynamique, à taille humaine, où l’esprit d’équipe, l’innovation et l’initiative sont valorisés ?

Rejoignez ASUR PLANT BREEDING, société française spécialisée dans la sélection génétique des céréales et membre du groupe semencier européen SAATEN-UNION.

Implantés à Estrées-Saint-Denis (60) à 15 km de Compiègne, nous sommes reconnus pour notre dynamisme et notre expertise dans la création variétale des céréales. Depuis plus de vingt ans nous sommes leader mondial en semences de blé hybride, et actuellement leader européen en blé lignée avec notre variété emblématique CHEVIGNON.

Nos variétés sont commercialisées dans toute l’Europe sous la marque SAATEN-UNION au sein d’une gamme qui regroupe céréales, protéagineux et plantes de services.

Le métier

Dans le cadre denotre programme de sélection assistée par marqueurs (SAM), nous recrutons un(e) biologiste moléculaire pour renforcer notre équipe de génotypage. Vous serez au cœur des activités de caractérisation moléculaire de nos ressources génétiques et contribuerez directement à l’amélioration de nos variétés céréalières.

• Un environnement scientifique stimulant au sein d’un programme de sélection végétale innovant, leader sur son marché, au sein de la Société
• Des équipements de génotypage à la pointe (plateformesde génotypage à haut débit, robots de manipulation)au sein du Laboratoire
• Une collaboration étroite avec des équipes de génétiqueetsélection variétale

Missions principales sous la direction du Responsable des Technologies de Sélection Variétale :

• Gérer des projets de génotypage par marqueurs moléculaires, de la définition des objectifs jusqu’au suivi scientifique, opérationnel, technique et budgétaire
• Réaliser les extractions d'ADN à partir de matériel végétal (feuilles, graines) selon les protocoles en vigueur, et effectuer les analyses de génotypage par qPCR (grâce aux technologies de type KASP et Taqman notamment) tout en assurant l’optimisation des procédés
• Assurer le suivi, la qualité et la conformité du génotypage (contrôle qualité des ADN extraits et des réactions de PCR effectuées, interprétation et validation des résultats) tout en respectant les bonnes pratiques du laboratoire
• Assurer la gestion des processus à haut débit : suivi de volumes importants d’échantillons et de leur traçabilité, et utilisation de stations automatisées de pipetage dédiées à l’extraction d’ADNg et à la qPCR set up
• Participer à la gestion et à l'organisation des données de génotypage : saisie, structuration, archivage et contrôle de la qualité des données dans les bases de données internes
• Contribuer à des tâches de bioinformatique appliquée à la sélection : manipulation de fichiers de données génomiques, utilisation d'outils de traitement et de visualisation des résultats (tableurs, scripts, logiciels dédiés)
• Collaborer étroitement avec les équipes de sélection et de biométrie

Profil demandé

Bac+5 en biologie moléculaire, génétique, biotechnologies végétales ou domaine équivalent.

• Maîtrise des techniques d'extraction d'ADN manuelle et automatisée
• Maîtrise de la PCR quantitative
• Maitrise de la mise en œuvre des marqueurs moléculaires de type SNP (analyse du polymorphisme, design d'assays, discrimination allélique par PCR et interprétation de clusters)
• Notions en bio-informatique : manipulation de fichiers de données (formats VCF, CSV, Excel), utilisation d'outils de base (BLAST, Primer 3Plus) et avancés (R, Python ou équivalent apprécié)
• Sensibilité à la gestion de données : rigueur dans le suivi des échantillons, la traçabilité et la structuration des bases de données de génotypage
• Connaissance des outils LIMS ou bases de données de laboratoire est un plus
• Rigueur, autonomie, sens de l’organisation et des priorités
• Capacité à gérer des volumes importants d'échantillons avec méthode
• Esprit d'équipe et bonne communication avec des équipes pluridisciplinaires
• Curiosité scientifique et intérêt pour la sélection végétale et la génomique appliquée

Commentaires

• CDI temps complet (télétravail selon la politique de l’entreprise)
• Localisation : Travaux saisonniers réalisés au Laboratoire de Biologie moléculaire localisé à Amiens (jusqu’à 50% du temps – 1 heure de train de Estrées Saint Denis) et le reste du temps basé au siège de l’entreprise à Estrées Saint Denis (15km de Compiègne)
• Restauration sur place (cantine)
• Permis B requis pour des déplacements ponctuels