Projektiasiantuntija/projektitutkija IT-painotteiseen bioinformatiikan tehtävään

University of Antwerp; Turku; On-site; EUR 40 000 - 60 000; Full time

Job summary

Turun yliopiston Lääketieteellisen Bioinformatiikan keskuksessa haetaan projektiasiantuntijaa IT-painotteiseen bioinformatiikan tehtävään syyskuusta 2025 alkaen. Tehtävä edellyttää laaja-alaisia taitoja ohjelmoinnista ja HPC-ympäristön hallinnasta, pyrkien tehokkaaseen datan analysointiin ja tutkimustulosten tukemiseen. Tarjoamme innovatiivisen työympäristön ja mahdollisuuden osallistua huipputason tutkimukseen.

Benefits

Pääsy huipputason teknologioihin

Monipuoliset työtehtävät

Joustavat työajat

Tuki ammatilliseen kehittymiseen

Erinomainen työyhteisö

Qualifications

• Kokemusta HPC-ympäristöjen tai pilvilaskenta-alustojen ylläpidosta.
• Vahvaa osaamista ohjelmoinnissa (C++, R, Python).
• Sujuva englannin kielen taito.

Responsibilities

• Tarjoaa asiantuntijatuen ja kehittää tieteellisiä IT-tukipalveluja.
• Osallistuu rahoitushakemusten tekemiseen ja raportointiin.
• Koordinointia ja kommunikointia yhteistyötahojen kanssa.

Skills

Ohjelmointi

Linux-järjestelmien hallinta

Scripting

Automaatio

Ongelmienratkaisukyky

Yhteistyötaidot

Education

Korkeakoulututkinto soveltuvalta alalta

Tools

SLURM

Ansible

Git

Docker

Job description

Suomi

Projektiasiantuntija/projektitutkija IT-painotteiseen bioinformatiikan tehtävään

Turun yliopiston Lääketieteellisen Bioinformatiikan keskuksessa on avoinna projektiasiantuntijan/projektitutkijan tehtävä alkaen 1. syyskuuta, 2025 tai sopimuksen mukaan. Tehtävä täytetään määräajaksi vuoden 2027 loppuun saakka, mutta on mahdollista, että se jatkuu pidempään.

Turun Lääketieteellisen Bioinformatiikan keskus (MBC) kuuluu sekä kansalliseen Biokeskus Suomi –tutkimusinfrastruktuuriverkostoon että Euroopan laajuiseen ELIXIR-infrastruktuuriin. Teemme kansainvälisesti korkeatasoista tutkimusta bioinformatiikan ja laskennallisen lääketieteen alalla. Kehitämme ja sovellamme laskennallisia data-analyysityökaluja laajojen molekulaaristen ja kliinisten aineistojen tulkintaan lääketieteellisessä tutkimuksessa tiiviissä yhteistyössä johtavien lääketieteen tutkimusryhmien ja biopankkien kanssa. Turun Biotiedekeskuksen ydinpalveluyksikkönä tuemme lisäksi korkeatasoista tutkimusta tarjoamalla bioinformatiikkatukea muun muassa akateemisille tutkimusyksiköille ja terveydenhuollon yksiköille sekä tieteellistä IT-tukea tutkijoille.

Toimintamme laajentuessa haemme uusia osaajia mukaan tiimiimme tukemaan kasvuamme ja kehitystämme uusissa tehtävissä.

Tehtävänkuvaus

Lääketieteellisen Bioinformatiikan keskuksen ydinpalveluyksikkö tarjoaa tukea modernien bioteknologioiden tuottaman datan analysointiin. Etsimme joukkoomme IT-alan asiantuntijaa kehittämään keskuksen tieteellisiä IT-tukipalveluja. Tehtävä on osa kansallista Biokeskus Suomi -tutkimusinfrastruktuuria ja sen tavoitteena on edistää CSC:n, ELIXIR:n ja yliopistojen tarjoamien IT-infrastruktuurien ja -resurssien tehokasta hyödyntämistä eri puolilla Suomea. Keskeisiin tehtäviin kuuluvat asiantuntijatuen tarjoaminen, ydinpalveluyksikön toimintojen kehittäminen yhteistyössä henkilöstön ja sidosryhmien kanssa sekä koordinointia ja kommunikointia yhteistyötahojen ja verkostojen kanssa. Lisäksi tehtäviin kuuluu rahoitushakemusten tekemistä ja raportointia sekä osallistumista yksikön tarjoaman koulutuksen järjestämiseen

Etsimämme henkilö

Edellytämme

Hakijoilta edellytetään kokemusta HPC-ympäristöjen tai pilvilaskenta-alustojen ylläpidosta ja käytöstä, sekä kokemusta ajonhallintajärjestelmistä (esim. SLURM). Hakijoilla tulee olla kokemusta Linux-järjestelmien hallinnasta (esim. RHEL, AlmaLinux) sekä osaamista komentorivipohjaisesta scriptauksesta ja automaatiotyökaluista (esim. Ansible). Hakijoilta edellytetään vahvaa osaamista ohjelmoinnissa (esim. C++, R, Python) sekä kykyä työskennellä versionhallintatyökalujen kanssa (esim. Git). Myös datanhallinnan ja suurten datamäärien tallennuksen parhaiden käytäntöjen tuntemus on tärkeää. Kokemus erilaisten omikkadatojen analysoinnista, yleisesti käytettyjen bioinformatiikan työkalujen (esim. GATK, STAR) käyttöönotosta ja ylläpidosta, sekä bioinformatiikan kirjastojen tuntemus (esim. Bioconductor) ovat eduksi. Tehtävä edellyttää aloitekykyä ongelmanratkaisussa, itseohjautuvuutta sekä erinomaisia yhteistyö- ja kommunikaatiotaitoja. Sujuva englannin kielen suullinen ja kirjallinen taito on välttämätöntä.

Hakijalla tulee olla korkeakoulututkinto soveltuvalta alalta. Mikäli hakijalla on alempi tai ylempi korkeakoulututkinto, tehtävänimike on projektiasiantuntija tai projektitutkija. Tohtorintutkinnon suorittaneille tehtävänimike on erikoistutkija tai projektiasiantuntija.

Lisäansioiksi katsotaan

• Kokemus FAIR-dataperiaatteiden toteuttamisesta ja säädösten (esim. GDPR) tuntemus sensitiivisen biologisen datan osalta
• Kokemus HPC-ympäristöissä työskentelystä, resurssienhallintajärjestelmistä (esim. SLURM) ja pilvilaskentapalveluista
• Tuntemus työnkulun hallintatyökaluista (esim. Nextflow) ja konttiteknologioista (esim. Docker, Singularity)
• HPC-järjestelmien valvonnan ja suorituskyvyn optimoinnin tuntemus
• Kokemus rinnakkais- ja hajautetusta laskennasta
• Kokemus varmuuskopiointi- ja arkistointiratkaisujen käyttöönotosta
• Ymmärrys RAID-tekniikasta ja skaalautuvista tallennusratkaisuista

Arvostamme yhdenvertaisuutta ja monimuotoisuutta työyhteisössämme. Kannustammekin erilaisen taustan omaavia päteviä hakijoita hakemaan avoimia tehtäviämme.

• Pääsyn huipputason teknologioihin ja ainutlaatuisiin aineistoihin
• Huipputason tutkimusympäristön
• Erinomaisen työyhteisön
• Monipuoliset ja vaihtelevat työtehtävät
• Joustavat työajat
• Tukea jatkuvaan ammatilliseen kehittymiseen

Euroopan komissio on myöntänyt Turun yliopistolle oikeuden käyttää erinomaisen työnantajanHR Excellence in Research logoa merkkinä yliopiston sitoutumisesta tutkijoiden aseman ja työolosuhteiden jatkuvaan kehittämiseen Tutkijoiden eurooppalaisen peruskirjan tavoitteiden mukaisesti.

Palkkaus ja koeaika

Tehtävästä maksettava palkka määräytyy yliopistojen palkkausjärjestelmän tutkimus- ja opetushenkilöstön tai muun asiantuntijahenkilöstön vaativuuskartan mukaisesti. Tehtävänimike riippuu tehtävään valittavan henkilön koulutuksesta ja osaamisesta. Palkka määräytyy tehtävän vaatimustason mukaan, jonka lisäksi maksetaan henkilökohtaiseen suoriutumiseen perustuvaa palkanosaa. Palkkaus aiemmasta kokemuksesta ja osaamisesta riippuen on tehtävän alussa projektitutkijalla (maisterin tutkinto) noin 2600 - 3300 €/kk ja erikoistutkijalla (tohtorin tutkinto) noin 3200 - 4600 euroa/kk. Projektiasiantuntija kuuluu muuhun asiantuntijahenkilöstöön ja kuukausipalkka on noin 2500 - 3800 €/kk osaamisesta ja pätevyydestä riippuen.

Tehtävässä noudatetaan kuuden (6) kuukauden koeaikaa.

Hakuohjeet

Jätäthän hakemuksesi sähköisen rekrytointijärjestelmämme kautta. Hakemuksia mahdollisesti käsitellään jo hakuajan aikana.

Hakijoiden on liitettävä hakemukseensa:

• motivaatiokirje (enintään yksi sivu)
• ansioluettelo (enintään kaksi sivua)
• mahdollinen julkaisuluettelo
• tutkintotodistukset
• kahden suosittelijan yhteystiedot
• muut mahdolliset tehtävän täyttämiseen vaikuttavat asiakirjat

Turun Biotiedekeskus on Turun yliopiston ja Åbo Akademin yhteinen erillislaitos. Keskuksen tehtävä on edistää korkeatasoista tutkimusta ja koulutusta ja se tarjoaa korkealuokkaisen ja kansainvälisesti kilpailukykyisen ja verkostoituneen tutkimusympäristön. Meillä teet tutkimusta viimeisimpien tutkimusmenetelmien ja huipputason tutkijoiden parissa. Työympäristömme on vahvasti kansainvälinen ja siten työkielemme on englanti.

Turun yliopisto on 25 000 opiskelijan ja työntekijän innostava ja kansainvälinen akateeminen yhteisö. Rakennamme kestävää tulevaisuutta monitieteisellä tutkimuksella, koulutuksella ja yhteistyöllä. Tarjoamme mielenkiintoisia urapolkuja, kannustamme jatkuvaan oppimiseen ja panostamme yhteisömme hyvinvointiin. Tule meille tekemään työtä, jolla on merkitystä muuttuvassa maailmassa!

Hakulomaketta ei voi tallentaa keskeneräisenä. Voit kuitenkin palata muokkaamaan ja täydentämään hakemustasi sen lähettämisen jälkeen aina hakuajan päättymiseen saakka. Saat linkin hakemuksesi muokkaamista varten sähköpostiisi, kun olet jättänyt hakemuksesi järjestelmään.

Sinulla on 6 tuntia aikaa työhakemuksesi täyttämiseen ennen aikakatkaisua.

Projektiasiantuntija/projektitutkija IT-painotteiseen bioinformatiikan tehtävään