Wissenschaftlicher Programmierer (m/w/d)

Technische Universität München; München; Vor Ort; EUR 70.000 - 90.000; Vollzeit

Zusammenfassung

Die Technische Universität München sucht eine/n Wissenschaftler/in (m/w/d) mit Expertise im computergestützten Proteindesign und Protein-Engineering zur Verstärkung der AI Core Unit des Exzellenzclusters BioSysteM. Die Stelle ist befristet bis zum 31. Dezember 2032 und in Vollzeit zu besetzen.

Sie implementieren und führen Projekte durch, entwickeln Workflows und koordinieren Arbeiten im Team. Erwartet wird eine Promotion in Bioinformatik/Strukturbio/Biophysik oder Biochemie sowie fundierte

Qualifikationen

• Promotion in einem relevanten Fachgebiet wie Bioinformatik, Strukturbio, Biophysik oder Biochemie.
• Fundierte Erfahrung im computergestützten Proteindesign und/oder Protein-Engineering.
• Fundierte Kenntnisse im wissenschaftlichen Software-Engineering.
• Kenntnisse in RFdiffusion, ProteinMPNN, Rosetta und AlphaFold.
• Erfahrung in interdisziplinären Forschungsprojekten und in der wissenschaftlichen Kommunikation.

Aufgaben

• Entwicklung und Implementierung von computergestützten Workflows im Proteindesign und Protein-Engineering.
• Durchführung oder Leitung entsprechender Projekte sowie Verwaltung der verfügbaren Recheninfrastruktur.
• Laborbesuche zur Beratung und Anforderungsanalyse für Proteindesign-Methoden.
• Unterstützung des Proteindesign-Design Accelerators und Zusammenarbeit mit BioSysteM-Mitgliedern.

Kenntnisse

Proteindesign

Protein-Engineering

Software-Engineering

Interdisziplinäre Zusammenarbeit

Ausbildung

Promotion in Bioinformatik/Strukturbio/ Biophysik/ Biochemie

Tools

RFdiffusion

ProteinMPNN

Rosetta

AlphaFold

Jobbeschreibung

TUM - Wissenschaftlicher Programmierer (m/w/d) – Computergestütztes Proteindesign und Protein-Engineering

Support

MyTUM-Portal

Technische Universität München

Wissenschaftlicher Programmierer (m/w/d) – Computergestütztes Proteindesign und Protein-Engineering

20.08.2026, Wissenschaftliches Personal

Wir suchen zum nächstmöglichen Zeitpunkt eine erfahrene Wissenschaftlerin bzw. einen erfahrenen Wissenschaftler (m/w/d) mit Kenntnissen im Bereich computergestütztes Proteindesign und Protein-Engineering zur Verstärkung der AI Core Unit des Exzellenzclusters BioSysteM. Die Stelle ist im Exzellenzcluster angesiedelt und daher an dessen Laufzeit gebunden (befristet bis zum 31. Dezember 2032).

Über uns

Der Exzellenzcluster BioSysteM ist ein internationales Forschungsnetzwerk, in dem Wissenschaftlerinnen und Wissenschaftler der beiden Münchner Universitäten, des Helmholtz Zentrums München sowie des Max-Planck-Instituts für Biochemie interdisziplinär zusammenarbeiten. Seit dem 1. Januar 2026 wird der Cluster von der Deutschen Forschungsgemeinschaft (DFG) im Rahmen der Exzellenzstrategie von Bund und Ländern gefördert. Die Technische Universität München (TUM) fungiert dabei als koordinierende Universität. Ziel von BioSysteM ist es, zu verstehen, wie biologische Systeme gezielt entworfen und gesteuert werden können.

Ein integraler Bestandteil von BioSysteM ist die AI Core Unit, eine institutionsübergreifende Unterstützungseinheit. Ihr Ziel ist es, Methoden des Machine Learning (ML) und der Künstlichen Intelligenz (KI) den Mitgliedern des Exzellenzclusters zugänglich zu machen und deren Weiterentwicklung zu fördern. Die Einheit wird zentrale Dienste aufbauen, die einen effizienten Einsatz von KI‑Werkzeugen innerhalb des Clusters ermöglichen. Neben der Leitung umfasst die AI Core Unit ein kleines Team erfahrener wissenschaftlicher Mitarbeiterinnen und Mitarbeiter.

Eine zentrale Aufgabe der Einheit besteht in der präzisen Organisation, Harmonisierung und dem Austausch von Forschungsdaten, um den Einsatz von ML‑Methoden voranzutreiben. Von besonderer Bedeutung sind dabei die Definition von Standards und Datenbanken für experimentelle Protokolle und digitale Workflows, insbesondere für den Aufbau eines Repositoriums validierter Laborprotokolle.

Für eine zentrale Rolle innerhalb dieser Einheit suchen wir eine Expertin oder einen Experten für computergestütztes Proteindesign und Protein‑Engineering. Die Person sollte mit den gängigen Pipelines und Arbeitsabläufen vertraut sein. Auf Grundlage ihrer technischen Expertise wird sie die Implementierung und Durchführung von Projekten im Bereich computergestütztes Proteindesign und Protein‑Engineering in Zusammenarbeit mit Mitgliedern von BioSysteM unterstützen. Für die Umsetzung dieser Aufgaben steht die Recheninfrastruktur der Core Unit zur Verfügung.

Ihr Profil

• Promotion (PhD) in Bioinformatik, Strukturbiologie, Biophysik, Biochemie oder einem verwandten Fachgebiet
• Erfahrung im computergestützten Proteindesign und/oder Protein-Engineering
• Fundierte Kenntnisse im wissenschaftlichen Software-Engineering
• Erfahrung mit einigen (idealerweise allen) der folgenden Softwarepakete: RFdiffusion ProteinMPNN Rosetta AlphaFold
• Erfahrung in der Durchführung (idealerweise auch Leitung) interdisziplinärer Forschungsprojekte sowie in der wissenschaftlichen Kommunikation
• Kenntnisse in der Administration von Recheninfrastrukturen für computergestütztes Proteindesign bzw. Protein-Engineering

Ihre Aufgaben

Die wissenschaftliche Programmiererin bzw. der wissenschaftliche Programmierer wird für die Entwicklung und Implementierung von computergestützten Workflows im Bereich Proteindesign und Protein‑Engineering verantwortlich sein. Darüber hinaus unterstützt und begleitet sie bzw. er die Durchführung entsprechender Projekte und administriert die verfügbare Hardware.

• Durchführung von Laborbesuchen zur Beratung, Diskussion und Identifikation spezifischer Anforderungen und Potenziale für den Einsatz von Proteindesign- und Protein‑Engineering‑Methoden
• Enge Zusammenarbeit mit dem Protein Design Accelerator Technology Hub, der ebenfalls Teil von Bio‑SysteM ist und sich auf demselben Campus in unmittelbarer Nähe befindet
• Durchführung von Einführungskursen zu den computergestützten Workflows in diesem Anwendungsbereich
• Enge Zusammenarbeit mit Wissenschaftlerinnen und Wissenschaftlern bei der Entwicklung fortgeschrittener computergestützter Workflows, mit der Perspektive, in einigen Projekten eine führende Rolle zu übernehmen
• Beratung und Unterstützung von Forschenden bei Aufgaben im Bereich Proteindesign und Protein‑Engineering
• Administration der Hard- und Software für den Bereich Proteindesign und Protein‑Engineering: Der bzw. die Eingestellte verfügt über entsprechende Hardware‑Ressourcen, die den Mitgliedern von Bio‑SysteM zur Verfügung gestellt werden sollen
• Forschungsdatenmanagement: Entwicklung und Überwachung der Datenharmonisierung innerhalb des Clusters im Bereich Proteindesign und Protein‑Engineering (in Zusammenarbeit mit den Data Stewards von Bio‑SysteM)
• Vernetzung von Forschenden, die an ähnlichen Fragestellungen arbeiten, sowie Einbindung externer Expertinnen und Experten (über das AI Advisory Board von Bio‑SysteM und das Munich Data Science Institute, MDSI)

Unser Angebot

Wir bieten

eine Vollzeitstelle als wissenschaftliche Mitarbeiterin bzw. wissenschaftlicher Mitarbeiter mit der Möglichkeit, in einem Team von Expertinnen und Experten (Fachspezialistinnen und Fachspezialisten) innerhalb der AI Core Unit zu arbeiten.

Die AI Core Unit ist in ein exzellentes Forschungsumfeld eingebettet und verfügt über hervorragende, eigenständig verwaltete Geräte und Ressourcen. Die Stelle ist auf die Laufzeit der Förderung von BioSysteM befristet.

Die Vergütung erfolgt nach dem Tarifvertrag für den öffentlichen Dienst der Länder (TV-L).

Die TUM strebt eine Erhöhung des Frauenanteils in ihrer Belegschaft an und begrüßt daher ausdrücklich Bewerbungen qualifizierter Frauen.

Die Stelle ist grundsätzlich für Menschen mit Behinderung geeignet. Schwerbehinderte Bewerberinnen und Bewerber werden bei im Wesentlichen gleicher Eignung, Befähigung und fachlicher Leistung bevorzugt berücksichtigt.

Die Stelle ist für die Besetzung mit schwerbehinderten Menschen geeignet. Schwerbehinderte Bewerberinnen und Bewerber werden bei ansonsten im wesentlichen gleicher Eignung, Befähigung und fachlicher Leistung bevorzugt eingestellt.

Hinweis zum Datenschutz:

Im Rahmen Ihrer Bewerbung um eine Stelle an der Technischen Universität München (TUM) übermitteln Sie personenbezogene Daten. Beachten Sie bitte hierzu unsere Datenschutzhinweise gemäß Art. 13 Datenschutz-Grundverordnung (DSGVO) zur Erhebung und Verarbeitung von personenbezogenen Daten im Rahmen Ihrer Bewerbung. Durch die Übermittlung Ihrer Bewerbung bestätigen Sie, dass Sie die Datenschutzhinweise der TUM zur Kenntnis genommen haben.

Kontakt: [e-mail]

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