Techniker/in – 10x Genomics / Single-Cell Sequencing

Projectstudy; Münster; Vor Ort; EUR 65.000 - 90.000; Vollzeit

Zusammenfassung

Projectstudy sucht eine/n erfahrene/n Forscher/in für Single-Cell Sequencing, Molekularbiologie und NGS-Workflows. Sie arbeiten an Probenvorbereitung, Zellsortierung und Analyse in einem kollaborativen Team.

Sie nutzen Plattformen wie 10x Genomics, führen SOP-gesteuerte Experimente durch, beraten intern und unterstützen ggf. Schulungen von Teammitgliedern. Gute Englischkenntnisse sind erforderlich; Reisebereitschaft wird erwartet.

Qualifikationen

• Promoviert in Zellbiologie, Molekularbiologie, Biotechnologie oder verwandtem Fachgebiet.
• Oder Masterabschluss mit 1–3 Jahren einschlägiger Praxis.
• Praktische Erfahrung mit Single-Cell-Sequencing-Plattformen (z. B. 10x Genomics) und zugehörigen Workflows.
• Erfahrung in Gewebeprobenvorbereitung, FACS, PCR/qPCR, NGS-Workflows und SOPs.

Aufgaben

• Durchführung end-to-end Single-Cell Sequencing Workflows inklusive Probenverarbeitung, Dissociation, nuke Prep und Library Preparation.
• Durchführung und Optimierung von Single-Cell Experimenten mit Plattformen wie 10x Genomics oder PARSE.
• Molekularbiologische Arbeiten inkl. PCR, qPCR, Nukleinsäureextraktion und NGS-Workflows.
• Arbeiten mit menschlichen und murinen Gewebeproben; Protokolloptimierung.
• Bedienung und Wartung von Laborgeräten (FACS, PCR/qPCR Systeme).
• Analyse der Ergebnisse, Dokumentation und Berichterstattung an interne Teams.
• Fehleranalyse, Troubleshooting und Weiterentwicklung von Laborabläufen.
• Zusammenarbeit mit Forschungs- und Projektteams; ggf. Einarbeitung von Junioren.

Kenntnisse

Single-Cell sequencing

Molekularbiologie

PCR/qPCR

Flow cytometry

NGS-Workflows

Englisch (sehr gut)

Ausbildung

PhD in Zellbiologie oder Molekularbiologie

Masterabschluss + 1–3 Jahre Praxis

Tools

10x Genomics

FACS

Nukleinsäure Extraktion

Jobbeschreibung

Key Responsibilities

• Perform end-to-end single-cell sequencing workflows, including sample processing, single-cell dissociation, single-nucleus preparation, cell sorting, quality assessment, and library preparation.
• Execute and optimize single-cell experiments using platforms such as 10x Genomics, PARSE, or other single-cell technologies.
• Conduct molecular biology experiments including PCR, qPCR, nucleic acid extraction/purification, and NGS-related workflows.
• Handle human and mouse tissue samples and optimize protocols for challenging samples to improve experimental performance and data quality.
• Operate laboratory instruments including flow cytometers (FACS), cell counters, PCR/qPCR systems, and other molecular biology equipment.
• Analyze experimental results, maintain accurate laboratory records, prepare reports, and communicate findings with internal teams and customers when required.
• Troubleshoot experimental issues, improve laboratory workflows, and contribute to the development and validation of single-cell methodologies.
• Collaborate with research teams and support the training or supervision of junior team members when needed.

Requirements

• PhD degree in Cell Biology, Molecular Biology, Biotechnology, or related fields,
• or a Master’s degree with 1–3 years of relevant hands‑on laboratory experience.
• Hands‑on experience with single‑cell sequencing platforms (10x Genomics or equivalent) and related experimental workflows.
• Experience in:
  • Single‑cell suspension preparation and tissue dissociation (human/mouse tissues)
  • Single‑nucleus extraction/preparation
  • Flow cytometry/FACS operation
  • Molecular biology techniques including PCR, qPCR, purification, and NGS workflows
  • Experience with protocol optimization, troubleshooting, and laboratory SOPs.
  • Familiarity with organoids, recombinant AAV, screening, or low‑input molecular assays is a plus.
  • Basic experience with data analysis tools (e.g., Prism, Spotfire, or equivalent) and interest in bioinformatics is preferred.
  • Good communication skills and ability to work collaboratively in a research environment.
  • Willingness to travel when required.
  • Proficiency in English (written and spoken).

Ihre Aufgaben

• Durchführung von Single-Cell-Sequencing-Workflows von A bis Z, einschließlich Probenverarbeitung, Einzelzell-Dissoziation, Einzelkernpräparation, Zellsortierung, Qualitätskontrolle und Library Preparation.
• Durchführung und Optimierung von Single-Cell-Experimenten mit Plattformen wie 10x Genomics, PARSE oder vergleichbaren Single-Cell-Technologien.
• Durchführung molekularbiologischer Arbeiten, einschließlich PCR, qPCR, Nukleinsäureextraktion und -aufreinigung sowie weiterer NGS-bezogener Workflows.
• Arbeiten mit menschlichen und murinen Gewebeproben sowie Optimierung von Protokollen für anspruchsvolle Proben, um die experimentelle Leistung und Datenqualität zu verbessern.
• Bedienung und Wartung von Laborgeräten, insbesondere Durchflusszytometern (FACS), Zellzählern, PCR-/qPCR-Systemen und weiteren Geräten der Molekularbiologie.
• Analyse und Dokumentation experimenteller Ergebnisse, Führung präziser Laboraufzeichnungen, Erstellung von Berichten sowie Kommunikation der Ergebnisse mit internen Teams und bei Bedarf mit Kunden.
• Fehleranalyse und Troubleshooting bei experimentellen Problemen sowie kontinuierliche Optimierung von Laborabläufen und Mitwirkung bei der Entwicklung und Validierung von Single-Cell-Methoden.
• Zusammenarbeit mit Forschungs- und Projektteams sowie bei Bedarf Unterstützung bei der Einarbeitung und Betreuung von Junior-Teammitgliedern.
• Bereitschaft zu gelegentlichen Dienstreisen.

Ihr Profil

• Promotion (PhD) in Zellbiologie, Molekularbiologie, Biotechnologie oder einem verwandten Fachgebiet oder ein Masterabschluss mit 1–3 Jahren einschlägiger praktischer Laborerfahrung.
• Praktische Erfahrung mit Single-Cell-Sequencing-Plattformen, idealerweise 10x Genomics, sowie mit den entsprechenden experimentellen Workflows.
• Praktische Erfahrung in folgenden Bereichen:
  • Herstellung von Einzelzellsuspensionen und Gewebedissoziation aus humanen und murinen Geweben.
  • Extraktion und Präparation von Einzelkernen (Single Nuclei).
  • Bedienung von Durchflusszytometern / FACS.
  • Molekularbiologische Methoden, einschließlich PCR, qPCR, Nukleinsäureaufreinigung und NGS-Workflows.
  • Protokolloptimierung, Troubleshooting und Erstellung bzw. Anwendung von Labor-SOPs.
• Erfahrung mit Organoiden, rekombinantem AAV, Screening-Verfahren oder Low-Input-Molekularassays ist von Vorteil.
• Grundkenntnisse in Datenanalyse-Tools wie Prism, Spotfire oder vergleichbaren Programmen sowie Interesse an Bioinformatik sind wünschenswert.
• Gute Kommunikations- und Teamfähigkeit sowie Freude an der Zusammenarbeit in einem wissenschaftlichen Forschungsumfeld.
• Sehr gute Englischkenntnisse in Wort und Schrift.