Stagiaire postdoctoral - Laboratoire Dre Arielle Elkrief

Centre hospitalier de l'Université de Montréal (CHUM); Montreal; Hybrid; CAD 30,000 - 60,000; Full time

Job summary

Le laboratoire du Dr Arielle Elkrief, au CHUM, recherche un stagiaire postdoctoral en biologie computationnelle. Le candidat aura l'opportunité de travailler sur des projets innovants liés au microbiome et à l'immunothérapie, soutenu par une équipe de biologistes computationnels. Ce poste offre flexibilité et la possibilité de télétravail.

Benefits

Flexibilité de l'horaire

Télétravail possible

Qualifications

• Expérience dans le traitement des données de métagénomique et l'analyse statistique.
• Compétences en gestion et architecture des données requises.
• Capacité à travailler dans un environnement dynamique.

Responsibilities

• Analyse des données de métagénomique fécale et visualisation des résultats.
• Organisation de l'infrastructure des données pour plusieurs projets.
• Collaboration avec d'autres chercheurs sur divers projets.

Skills

Analyse statistique

Résolution de problèmes

Collaboration

Communication

Education

Doctorat (Ph.D.) ou M.D. / Ph.D. en bioinformatique, biologie computationnelle, informatique

Tools

R

Python

Job description

Stagiaire postdoctoral - Laboratoire Dre Arielle Elkrief

Description du poste

Le laboratoire du Dr Arielle Elkrief, co-directrice du Centre du microbiome du CHUM, est à la recherche d’un(e) biologiste computationnel(le) ou bioinformaticien(ne) talentueux(se) et autonome pour se joindre à notre équipe computationnelle en tant que stagiaire postdoctoral(e). Le ou la candidat(e) se concentrera sur l’établissement de solutions computationnelles pour analyser des données complexes et multimodales liées au microbiome.

Le ou la candidat(e) travaillera en étroite collaboration avec d’autres biologistes computationnels, scientifiques fondamentaux, étudiant(e)s et chercheur(e)s, y compris les membres du laboratoire du Dr Bertrand Routy, co-directeur du Centre du microbiome du CHUM.

Le laboratoire du Dr Elkrief fournira un soutien computationnel grâce à la présence d’un biologiste computationnel senior au sein de l’équipe. Le ou la candidat(e) sera responsable de concevoir une architecture de données pour exploiter et intégrer les ensembles de données internes sur le microbiome et l’oncologie, de traiter, de visualiser et d’interpréter les données dans le cadre de plusieurs projets.

Le laboratoire se concentre sur le développement de nouvelles thérapies basées sur le microbiome pour les personnes atteintes de cancer du poumon et de mélanome traitées par immunothérapie. Cela inclut l’étude du rôle de la transplantation fécale de microbiote, des probiotiques, des prébiotiques et de l’alimentation dans des essais cliniques prospectifs chez les patients, avec une attention particulière sur l’intégration d’approches multi-omiques translationnelles corrélatives à partir de biospécimens collectés chez les patients inclus dans ces essais.

Le rôle spécifique du ou de la candidat(e) sera de réaliser des analyses primaires de biologie computationnelle sur des échantillons provenant de multiples essais cliniques, avec un fort potentiel d’impact.

Responsabilités

• Traitement brut, analyse et visualisation des données de métagénomique fécale et de 16s rRNA (humaines et murines)
• Représentation ‘transkingdom’ des données cliniques, alimentaires, métagénomiques, métabolomiques et immunologiques multi-omiques
• Organisation de l’infrastructure des données
• Mise en œuvre et respect des meilleures pratiques en matière de gestion et d’architecture des données
• Doctorat (Ph.D.) ou M.D. / Ph.D. en bioinformatique, biologie computationnelle, informatique
• Formation ou expérience dans le traitement des données de métagénomique, l’analyse statistique et la visualisation
• Maîtrise de R ou Python et des langages de programmation en ligne de commande
• Compétence dans l’utilisation des outils de calcul en cluster
• Expertise en gestion et architecture des données
• Excellentes capacités de résolution de problèmes et résilience dans un environnement rapide et dynamique
• Capacité à collaborer et à communiquer efficacement avec les membres de l’équipe et les parties prenantes externes
• Aptitude à gérer plusieurs tâches simultanément et à diriger des analyses pour plusieurs projets

Ce que nous offrons

• Flexibilité de l’horaire et télétravail possible

Il est « essentiel » de joindre votre CV pour que votre candidature soit considérée.

Nous remercions toutes les personnes qui poseront leur candidature, mais ne communiquerons qu'avec celles retenues pour un test ou une entrevue.

Le CRCHUM invite les femmes, les Autochtones, les minorités visibles, les minorités ethniques et les personnes ayant des limitations à soumettre leur candidature. Le CRCHUM adopte une définition large et inclusive de la diversité qui va au-delà des lois applicables.

Le CRCHUM encourage ainsi toutes les personnes, peu importe leurs caractéristiques, à poser leur candidature. Conformément aux exigences de l’immigration au Canada, veuillez noter que la priorité sera accordée aux citoyens canadiens et aux résidents permanents.

Stagiaire • Montreal, Montreal (administrative region), Canada